本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G327820
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 81991277-81998351 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3176 bp · TkA07G327820|TK1151|cDNA

AAAAAATCATCACTAATTGACAAAAGATTATGTAATTATTTAGTAAAAATACAAATCCATTATACAATCTATCACGCTGGCCATACCAATCTGTTTTCTCAAGGCTATCTATCAGATTCCCCACACCCCTATCACTCAGATCAAAGAAAGATTCAAGCTACGTGCCGTGTCCCATCAGTTAAATGCTCAAATATCATATCTAAATACAGAAATTATCATAATTCACAGCAAATTATTCATAGAAGTTGCCAATTTCCAAA...

3039 bp · TkA07G327820|TK1151|CDS

TTTGGGCCGTGGTTTATATCTTTTTTTCATCCTAGGTTTTCTCAAGGCTATCTATCAGATTCCCCACACCCCTATCACTCAGATCAAAGAAAGTTGACGATGGCTCGATTGATTATTCCCTGCAAAGGTTCGAGCTTGCCGAGGACTTGTCTCTTGGGTTTGATTTCGTCTGCTCATATTCAAGCTACGTGCCGTGTCCCATCAGTTAAATGCTCAAATATCATATCTAAATACAGAAATTATCATAATTCACAGCAAAT...

1012 aa · TkA07G327820|TK1151|PROTEIN

FGPWFISFFHPRFSQGYLSDSPHPYHSDQRKLTMARLIIPCKGSSLPRTCLLGLISSAHIQATCRVPSVKCSNIISKYRNYHNSQQIIHRSCQFPNRYSPRSSQTSRRLICSVATESVSKSEESEMEGPKEIFLKDYKLPDYYFDTVDLSFSLGEEKTIVCAKISVVPRVNGVGAPLALDGTDLTLISVKINGNELKEGDYHVDARHLILKSPPSGNFILETVTEILPQKNTSLEGLYKSSGNFCTQCEAEGFRKITFYQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G327820
TK1151 IDTkA07G327820
OH-1004 IDLXL04_010339
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 19.664 / OH-1004 84.878
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G327820
位置Chr07:81991277-81998351 (+)
描述Similar to Os08g0562700: Puromycin-sensitive aminopeptidase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0562700 氨基肽酶,对嘌呤霉素敏感。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_010339 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0004177 aminopeptidase activity 分子功能
GO:0008237 metallopeptidase activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0016285 alanyl aminopeptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63770
ccr:CC_2481
dosa:Os08g0562700
ecj:JW0915
eco:b0932
ecoc:C3026_05725
hin:HI_1614
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

质体0.644
排名 1 · TkA07G327820 · TK1151
细胞质0.324
排名 2 · TkA07G327820 · TK1151
细胞核0.129
排名 3 · TkA07G327820 · TK1151
线粒体0.089
排名 4 · TkA07G327820 · TK1151
过氧化物酶体0.082
排名 5 · TkA07G327820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17432DUF3458_C86-126 aa
PF17900Peptidase_M1_N149-314 aa
PF01433Peptidase_M1355-564 aa
PF05299Peptidase_M61420-504 aa
PF09621LcrR426-448 aa
PF11940DUF3458572-685 aa
PF17432DUF3458_C690-1011 aa
PF09621LcrR871-899 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G327820PF17432DUF3458_C861268.2e-126420.4
TkA07G327820PF17900Peptidase_M1_N1493145.4e-1453.4
TkA07G327820PF01433Peptidase_M13555649.5e-52176.5
TkA07G327820PF05299Peptidase_M614205040.01316.7
TkA07G327820PF09621LcrR4264480.07413.6
TkA07G327820PF11940DUF34585726854.2e-29101.5
TkA07G327820PF17432DUF3458_C69010118.2e-126420.4
TkA07G327820PF09621LcrR8718990.07413.6
TkA07G327820PF11940DUF34589169374.2e-29101.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8H0S9拟南芥sp|Q8H0S9|PSA_ARATH Puromycin-sensitive aminopeptidase81.200%Swiss-Prot高置信
B7EA73水稻sp|B7EA73|PSA_ORYSJ Puromycin-sensitive aminopeptidase77.000%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看