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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G268750
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 67124332-67129459 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3289 bp · TkA07G268750|TK1151|cDNA

CTTTCTCGTTTTATATTGTCTTCCCGTTTCATATTCCATTTGAACTTTGTTGCTTCTGGGTTATTTGTTTTTCAGTATTTCTTCTTCTTCAATAGACATGGGAGAATCTACATGTCTCATGCCTTCAATATATGAACCCAACAAGGAAACAACCACGTAAGTCTCCGCAAATTCATCCACCACTTGTTCTTAATCCGATCGATTTCAAAGAAGAGAAAGAAACCAGCGTATCGGCTAGGCCTGTCGTAGGCAAAGTGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2184 bp · TkA07G268750|TK1151|CDS

ATGTCTCATATAACAGAGTTTGAACACCTCAAAATAAACTTAGAAGCCATAAAATCTGCAACCAACAACTTTGCTACTGAGAATTGTATTGGGAAAGGAGGATTTGGGAATGTGTATAAAGGAGAAATCGTCCATTCCAAAGGCAAGTGCATGGTTGCTTTTAAGCGATTAGACCGTGCATTTGGACAAGGAAACCCCGAGTTCTGGAAGGAAATCACAATGCTTTTTCAATACAAACATGAAAATTTGGTTCTCCTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

727 aa · TkA07G268750|TK1151|PROTEIN

MSHITEFEHLKINLEAIKSATNNFATENCIGKGGFGNVYKGEIVHSKGKCMVAFKRLDRAFGQGNPEFWKEITMLFQYKHENLVLLLGFCDESDEKILVYNYACNRSLDFHLNNNDLTWTQRLKICLGIARGLAYLHSYEGGQVRVLHRDIKSSNILLNENWNAKISDFGLSKYAHANRFTFLFTSAVGTIGYCDPLYAETGLLTKESDVYSLGVVLFEVLCGRLCISNKDDRPLTVLARQCYELNKLDTIIFGNIRDEI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G268750
TK1151 IDTkA07G268750
OH-1004 IDLXL04_029204
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)68.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 55.983 / OH-1004 20.709
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G268750
位置Chr07:67124332-67129459 (+)
描述Similar to TPR2: Protein TOPLESS-RELATED PROTEIN 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g15750 转录共抑制因子。 暂无已核实直接文献
At1g80490 转录共抑制因子。
Arabidopsis resistance protein SNC1 activates immune responses through association with a transcriptional corepressor.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1002828107
At3g15880 锌指转录因子GAF1/IDD2和ENY/IDD1的转录抑制因子，在调节赤霉素稳态和信号传导中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0162100 转录核心抑制因子，参与分支形成调控，推测通过抑制主分支形成并促进次分支形成。
OsLIS-L1 encoding a lissencephaly type-1-like protein with WD40 repeats is required for plant height and male gametophyte formation in rice.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1532-7
Os03g0254700 可能是独脚金内酯信号通路的下游调控因子（基于相似性推测）。
MODD Mediates Deactivation and Degradation of OsbZIP46 to Negatively Regulate ABA Signaling and Drought Resistance in Rice.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.00171
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029204 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009867 jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010072 primary shoot apical meristem specification 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15750
dosa:Os08g0162100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.577
排名 1 · TkA07G268750 · TK1151
细胞核0.370
排名 2 · TkA07G268750 · TK1151
细胞膜0.177
排名 3 · TkA07G268750 · TK1151
内质网0.052
排名 4 · TkA07G268750 · TK1151
溶酶体／液泡0.046
排名 5 · TkA07G268750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase26-289 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr27-290 aa
PF23414Beta-prop_EML_2388-517 aa
PF24805EIF3I388-434 aa
PF25174Beta-prop_THOC3390-554 aa
PF25175Beta-prop_WDR5390-428 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz390-435 aa
PF00400WD40391-413 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G268750PF00069Pkinase262891.4e-42146.6
TkA07G268750PF07714PK_Tyr_Ser-Thr272903.5e-40138.7
TkA07G268750PF23414Beta-prop_EML_23885172e-2074.0
TkA07G268750PF24805EIF3I3884343.3e-0833.8
TkA07G268750PF25174Beta-prop_THOC33905542.7e-2383.0
TkA07G268750PF25175Beta-prop_WDR53904287.8e-2278.6
TkA07G268750PF24807WD40_CDC20-Fz3904352.3e-1764.0
TkA07G268750PF00400WD403914133e-2072.5
TkA07G268750PF24814WD40_Prp193914283.4e-1969.7
TkA07G268750PF23381Beta-prop_IFT122_1st3914483.8e-1866.5
TkA07G268750PF24805EIF3I3915143.3e-0833.8
TkA07G268750PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st3914305.1e-0833.4
TkA07G268750PF23609Beta-prop_EIPR13914277.5e-0626.3
TkA07G268750PF23409Beta-prop_EML3924281e-0939.0
TkA07G268750PF23775Beta-prop_RIG_2nd3925511.3e-0525.5
TkA07G268750PF23383Beta-prop_IFT140_1st3924300.001618.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94AI7拟南芥sp|Q94AI7|TPL_ARATH Protein TOPLESS55.900%Swiss-Prot中等置信
Q0WV90拟南芥sp|Q0WV90|TPR1_ARATH Topless-related protein 155.200%Swiss-Prot中等置信
Q27GK7拟南芥sp|Q27GK7|TPR4_ARATH Topless-related protein 453.400%Swiss-Prot中等置信
Q0J7U6水稻sp|Q0J7U6|TPR2_ORYSJ Protein TOPLESS-RELATED PROTEIN 263.000%Swiss-Prot中等置信
Q10NY2水稻sp|Q10NY2|TPR3_ORYSJ Protein TPR357.100%Swiss-Prot中等置信

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