TkA07G264420 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G264420

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 66098836-66101797 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2619 bp · TkA07G264420|TK1151|cDNA

ATGATGAGTCGTGGAGCGACGACTGTAGTCCGATCCGGAAACGCATCCGTGACCGGGGTGATGAGAACCAACACTGGCCTCATTGGATCTGAAAAGGCGGTGGCGACATGGTGGATTAGATATTCTCCTATTGGTGCTCGCAATGCGAGTACCATGACATTGGGGGAGAAAGAACAGCAACAGGAGCATAAGGAAGAAGCAACAGGTAGCGGCGGCGCTGCCGCCGGTGGTCAGAAAGGTAAAGAAGTCGTGAGTTACTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1002 bp · TkA07G264420|TK1151|CDS

ATGATGAGTCGTGGAGCGACGACTGTAGTCCGATCCGGAAACGCATCCGTGACCGGGGTGATGAGAACCAACACTGGCCTCATTGGATCTGAAAAGGCGGTGGCGACATGGTGGATTAGATATTCTCCTATTGGTGCTCGCAATGCGAGTACCATGACATTGGGGGAGAAAGAACAGCAACAGGAGCATAAGGAAGAAGCAACAGGTAGCGGCGGCGCTGCCGCCGGTGGTCAGAAAGGTAAAGAAGTCGTGAGTTACTG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

333 aa · TkA07G264420|TK1151|PROTEIN

MMSRGATTVVRSGNASVTGVMRTNTGLIGSEKAVATWWIRYSPIGARNASTMTLGEKEQQQEHKEEATGSGGAAAGGQKGKEVVSYWGVQPPKVTKEDGSEWKWHCFRPWETYQADLSIDLKKHHTPTTFLDKLAYWTVKSLRFPTDVFFQRRYGCRAMMLETVAAVPGMVGGMLLHCKSLRRFEPSGGWIKALLEEAENERMHLMTFMEVSKPRWYERALVFTVQGVFFNAYFLAYLASPKLAHRIVGYLEEEAIHSYT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G264420`
TK1151 ID	TkA07G264420
OH-1004 ID	LXL04_029036
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G264420

位置 Chr07:66098836-66101797 (+)

描述 Similar to AOX1: Ubiquinol oxidase 1, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g22370`	催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水，但不转移质子，因此与氧化磷酸化无关。	The alternative oxidase of plant mitochondria is involved in the acclimation of shoot growth at low temperature. A study of Arabidopsis AOX1a transgenic plants.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.070789
`At3g22360`	催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水，但不转移质子，因此与氧化磷酸化无关。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029036 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0010230 alternative respiration 生物过程

GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程

GO:0031930 mitochondria-nucleus signaling pathway 生物过程

GO:0045333 cellular respiration 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0009916 alternative oxidase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0102721 ubiquinol:oxygen oxidoreductase activity 分子功能

GO:0106292 superoxide-generating NADPH oxidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G22360

ath:AT3G22370

gmx:547924

nta:107781761

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.957

排名 1 · TkA07G264420 · TK1151

细胞核0.044

排名 2 · TkA07G264420 · TK1151

细胞质0.040

排名 3 · TkA07G264420 · TK1151

细胞膜0.035

排名 4 · TkA07G264420 · TK1151

内质网0.016

排名 5 · TkA07G264420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24107DUF73825-29 aa

PF01786AOX122-314 aa

PF03232COQ7194-309 aa

PF06480FtsH_ext258-275 aa

PF24107DUF7382293-309 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G264420	`PF24107`	DUF7382	5	29	0.26	11.9
TkA07G264420	`PF01786`	AOX	122	314	1.3e-82	277.3
TkA07G264420	`PF03232`	COQ7	194	309	0.002	18.5
TkA07G264420	`PF06480`	FtsH_ext	258	275	0.3	12.1
TkA07G264420	`PF24107`	DUF7382	293	309	0.26	11.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39219`	拟南芥	sp\|Q39219\|AOX1A_ARATH Ubiquinol oxidase 1a, mitochondrial	78.600%	Swiss-Prot	高置信
`O23913`	拟南芥	sp\|O23913\|AOX1B_ARATH Ubiquinol oxidase 1b, mitochondrial	84.500%	Swiss-Prot	高置信

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