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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G173160
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 44410411-44421328 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1786 bp · TkA07G173160|TK1151|cDNA

TCCCTCCCAACCCCCTCACCCCACCCCACTCCACGTAAATAATACGACATTTTCATCAACTCAGAACTAAAACTTACTGAAAAGAATGGCAGTGTCACTCTCCGCCGCCGGAGTCCGGCACCTACATGGCAGCTCTGCATTGGCTCCTAGGGACTTGAGGCCTTTATATTGCGACTTAATGGGGAAAAAGCTAAATTTCAGTCAAAGGGTTCAAAAGAAAAACAATGTTAAATCAAGCATACAAATGACGCTCACCACCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1533 bp · TkA07G173160|TK1151|CDS

ATGGCAGTGTCACTCTCCGCCGCCGGAGTCCGGCACCTACATGGCAGCTCTGCATTGGCTCCTAGGGACTTGAGGCCTTTATATTGCGACTTAATGGGGAAAAAGCTAAATTTCAGTCAAAGGGTTCAAAAGAAAAACAATGTTAAATCAAGCATACAAATGACGCTCACCACCATTGCCACAAGTGAGGGAAAGTTAAGGGACTTGGAGATGGAGAAACGGGACCCGAGAACCGTTGTGGCGGTGATACTTGGCGGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

510 aa · TkA07G173160|TK1151|PROTEIN

MAVSLSAAGVRHLHGSSALAPRDLRPLYCDLMGKKLNFSQRVQKKNNVKSSIQMTLTTIATSEGKLRDLEMEKRDPRTVVAVILGGGAGTRLFPLTKRRAKPAVPIGGAYRLIDVPMSNCINSGINKVYILTQYNSASLNRHLARAYNFGVTFGDGFVEALSATQTPGVEGKRWFQGTADAVRQFHWLFEDARSKDIEDVLILSGDHLYRMDYMDFVQNHRQSGADITISCLPMDDSRASDFGLMKIDGKGRVLSFSEKP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G173160
TK1151 IDTkA07G173160
OH-1004 IDLXL04_028586
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G173160
位置Chr07:44410411-44421328 (-)
描述Similar to ADG2: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g19220 该蛋白在淀粉合成中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g27680 该蛋白在淀粉合成中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0735000 参与淀粉的合成。
Identification of the ADP-glucose pyrophosphorylase isoforms essential for starch synthesis in the leaf and seed endosperm of rice (Oryza sativa L.).2007 · DOI: 10.1007/s11103-007-9153-z
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028586 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005978 glycogen biosynthetic process 生物过程
GO:0019252 starch biosynthetic process 生物过程
GO:0009501 amyloplast 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0010170 glucose-1-phosphate adenylyltransferase complex 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008878 glucose-1-phosphate adenylyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27680
ath:AT5G19220
bvg:104889614
dosa:Os03g0735000
sot:102582750
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.960
排名 1 · TkA07G173160 · TK1151
线粒体0.060
排名 2 · TkA07G173160 · TK1151
细胞质0.032
排名 3 · TkA07G173160 · TK1151
过氧化物酶体0.026
排名 4 · TkA07G173160 · TK1151
细胞核0.018
排名 5 · TkA07G173160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24894Hexapep_GlmU39-59 aa
PF00483NTP_transferase81-356 aa
PF12804NTP_transf_381-229 aa
PF25247LbH_GLGC375-509 aa
PF25087GMPPB_C383-429 aa
PF24894Hexapep_GlmU384-437 aa
PF25084LbH_EIF2B391-427 aa
PF00132Hexapep405-428 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G173160PF24894Hexapep_GlmU39593e-0731.3
TkA07G173160PF00483NTP_transferase813569.3e-70235.7
TkA07G173160PF12804NTP_transf_3812290.007317.2
TkA07G173160PF25247LbH_GLGC3755091.7e-49168.0
TkA07G173160PF25087GMPPB_C3834299.9e-0729.2
TkA07G173160PF24894Hexapep_GlmU3844373e-0731.3
TkA07G173160PF25084LbH_EIF2B3914276.6e-0626.8
TkA07G173160PF00132Hexapep4054280.001518.8
TkA07G173160PF24894Hexapep_GlmU4484833e-0731.3
TkA07G173160PF25087GMPPB_C4505099.9e-0729.2
TkA07G173160PF25084LbH_EIF2B4504766.6e-0626.8
TkA07G173160PF00132Hexapep4504740.001518.8
TkA07G173160PF00132Hexapep5005090.001518.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P55229拟南芥sp|P55229|GLGL1_ARATH Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic81.300%Swiss-Prot高置信
P55230拟南芥sp|P55230|GLGL2_ARATH Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 2, chloroplastic68.200%Swiss-Prot高置信
Q6AVT2水稻sp|Q6AVT2|GLGL1_ORYSJ Glucose-1-phosphate adenylyltransferase large subunit 1, chloroplastic/amyloplastic81.600%Swiss-Prot高置信

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