TkA07G145940 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G145940

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 37704278-37708883 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2698 bp · TkA07G145940|TK1151|cDNA

ATTCTGGTTCGGTAGGCGTTGGCTCCTCTTTCTACTCTCCTTCGTTTCCCCACCATAAAAGAACCCCCTCAAGTCAATACCTTTCTCCCAACTACCCCTACCAATTATCAGAGGATCTAAGAGAGAGAGAGAGAGCTAAAAAATCAGTAGTTTTTGTTTTCATCGAAACCGACTCTCGAATACTCTGTATTCTAGTCGGCAAAGGTTGGTTGGTAGTTGAATTGTCTAGATTTTGGGTGAAAAAAAAATGCAATCCAACT...

CDS

下载 CDS FASTA

2121 bp · TkA07G145940|TK1151|CDS

ATGCAATCCAACTCCGTGAAGATTTCGCCGCTTGATCTGATGAGTGCGCTTCTTAACGGCAAAGTTTTCGACACATCGAACGCATCGGAATCGGGAGAATCTATGGTGCCGCCAGCGTTGGCGATGCTGATGGAGAACCGTGAGTTGTTGATGATACTTACGACGTCAGTTGCTGTGTTGATTGGATGCGTTGTCGTCTTGGTGTGGCGGAGATCATCCACAAAGAAGTCGGCTAAGGAATTGGAGTCACCGGTGATTGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

706 aa · TkA07G145940|TK1151|PROTEIN

MQSNSVKISPLDLMSALLNGKVFDTSNASESGESMVPPALAMLMENRELLMILTTSVAVLIGCVVVLVWRRSSTKKSAKELESPVIVVPKRVQEEEVDDGKTKVTVFFGTQTGTAEGFAKALVEEAKARYEKAVFRIIDMDDYAADDDEYEEKLKKESLAFFFLATYGDGEPTDNAARFYKWFTEGEEKGEWLPKLKYGVFGLGNRQYEHFNKIAKVVDDNLAEAGAKRLVPVGLGDDDQCIEDDFTAWKELVWPELDQL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G145940`
TK1151 ID	TkA07G145940
OH-1004 ID	LXL04_028355
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G145940

位置 Chr07:37704278-37708883 (-)

描述 Similar to CPR: NADPH--cytochrome P450 reductase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g30210`	该酶对微体中从NADP到细胞色素P450的电子转移必不可少。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028355 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009698 phenylpropanoid metabolic process 生物过程

GO:0051762 sesquiterpene biosynthetic process 生物过程

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0003958 NADPH-hemoprotein reductase activity 分子功能

GO:0010181 FMN binding 分子功能

GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能

GO:0050660 flavin adenine dinucleotide binding 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G30210

dosa:Os09g0558900

osa:4347838

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.333

排名 1 · TkA07G145940 · TK1151

细胞质0.282

排名 2 · TkA07G145940 · TK1151

线粒体0.214

排名 3 · TkA07G145940 · TK1151

细胞核0.137

排名 4 · TkA07G145940 · TK1151

高尔基体0.130

排名 5 · TkA07G145940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26007DUF800051-82 aa

PF00175NAD_binding_188-153 aa

PF00258Flavodoxin_1106-249 aa

PF26007DUF8000126-142 aa

PF00667FAD_binding_1302-523 aa

PF19908DUF6381417-434 aa

PF10886DUF2685509-534 aa

PF00258Flavodoxin_1519-543 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G145940	`PF26007`	DUF8000	51	82	0.21	12.4
TkA07G145940	`PF00175`	NAD_binding_1	88	153	3.7e-18	66.9
TkA07G145940	`PF00258`	Flavodoxin_1	106	249	2.9e-33	115.8
TkA07G145940	`PF26007`	DUF8000	126	142	0.21	12.4
TkA07G145940	`PF00667`	FAD_binding_1	302	523	8.4e-70	235.5
TkA07G145940	`PF19908`	DUF6381	417	434	0.32	11.5
TkA07G145940	`PF10886`	DUF2685	509	534	0.0021	19.2
TkA07G145940	`PF00258`	Flavodoxin_1	519	543	2.9e-33	115.8
TkA07G145940	`PF00175`	NAD_binding_1	560	670	3.7e-18	66.9
TkA07G145940	`PF00258`	Flavodoxin_1	660	674	2.9e-33	115.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SUM3`	拟南芥	sp\|Q9SUM3\|NCPR2_ARATH NADPH--cytochrome P450 reductase 2	71.900%	Swiss-Prot	高置信

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