TkA07G145370 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G145370

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 37540342-37540731 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

390 bp · TkA07G145370|TK1151|cDNA

ATGGACCTCAACTCATCTTCTTCGCCATTGTTGTCCTCTTTACACCATGCGGACCAACGGGTCTTCTCCTGCAGCTATTGCAGGAGAAAGTTCTACAGCCCTCAAGCATTCGGAGGCCACCAAAATGCTCACAAGCTTGAAAGAACCTTAGCTAAGAAAAGCCGAGAGCTATGCTCGGCTGCTAGACATCATCAATCTGAATGGAACCTGCAACTGTCATCGAGGTTCGACTGTAACGGTTCAGCTCATGTTGGAGAGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

390 bp · TkA07G145370|TK1151|CDS

ATGGACCTCAACTCATCTTCTTCGCCATTGTTGTCCTCTTTACACCATGCGGACCAACGGGTCTTCTCCTGCAGCTATTGCAGGAGAAAGTTCTACAGCCCTCAAGCATTCGGAGGCCACCAAAATGCTCACAAGCTTGAAAGAACCTTAGCTAAGAAAAGCCGAGAGCTATGCTCGGCTGCTAGACATCATCAATCTGAATGGAACCTGCAACTGTCATCGAGGTTCGACTGTAACGGTTCAGCTCATGTTGGAGAGGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

129 aa · TkA07G145370|TK1151|PROTEIN

MDLNSSSSPLLSSLHHADQRVFSCSYCRRKFYSPQAFGGHQNAHKLERTLAKKSRELCSAARHHQSEWNLQLSSRFDCNGSAHVGEVQPANMVMGLEHHQERLVRFSSTERRREVGESSVDQLDLSLRL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G145370`
TK1151 ID	TkA07G145370
OH-1004 ID	LXL04_028346
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 90.210 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G145370

位置 Chr07:37540342-37540731 (+)

描述 Similar to ZFP2: Zinc finger protein 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g57520`	转录因子参与花器官脱落的调节，是种子和长角果发育所必需的。	Stamen abscission zone transcriptome profiling reveals new candidates for abscission control: enhanced retention of floral organs in transgenic plants overexpressing Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN2.2008 · DOI: 10.1104/pp.107.110908 ZINC FINGER PROTEIN2 suppresses funiculus lignification to ensure seed loading efficiency in Arabidopsis.2025 · DOI: 10.1016/j.devcel.2025.01.021
`At1g24625`	在发芽和早期幼苗发育过程中充当脱落酸信号传导的负调节因子。	The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
`At1g80730`	可能在芽生长发育调控中起作用，位于光形态发生激活的下游（可能）。	The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294 Expression analysis of an Arabidopsis C2H2 zinc finger protein gene.1996 · DOI: 10.1007/bf00020477
`At5g25160`	在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。	The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294
`At1g66140`	在种子萌发和幼苗早期发育中起脱落酸(ABA)信号的负调控作用。	The Arabidopsis ZINC FINGER PROTEIN3 Interferes with Abscisic Acid and Light Signaling in Seed Germination and Plant Development.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.234294

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028346 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0019760 glucosinolate metabolic process 生物过程

GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0060860 regulation of floral organ abscission 生物过程

GO:0060862 negative regulation of floral organ abscission 生物过程

GO:0080050 regulation of seed development 生物过程

GO:1901347 negative regulation of secondary cell wall biogenesis 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G24625

ath:AT1G66140

ath:AT1G80730

ath:AT5G25160

ath:AT5G57520

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.966

排名 1 · TkA07G145370 · TK1151

细胞质0.107

排名 2 · TkA07G145370 · TK1151

细胞膜0.026

排名 3 · TkA07G145370 · TK1151

内质网0.016

排名 4 · TkA07G145370 · TK1151

质体0.008

排名 5 · TkA07G145370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13912zf-C2H2_621-45 aa

PF13894zf-C2H2_422-44 aa

PF12171zf-C2H2_jaz22-42 aa

PF00096zf-C2H222-44 aa

PF13894zf-C2H2_462-64 aa

PF13912zf-C2H2_662-65 aa

PF00096zf-C2H262-65 aa

PF13894zf-C2H2_496-101 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G145370	`PF13912`	zf-C2H2_6	21	45	0.042	14.6
TkA07G145370	`PF13894`	zf-C2H2_4	22	44	0.018	16.4
TkA07G145370	`PF12171`	zf-C2H2_jaz	22	42	0.094	13.6
TkA07G145370	`PF00096`	zf-C2H2	22	44	0.13	13.5
TkA07G145370	`PF13894`	zf-C2H2_4	62	64	0.018	16.4
TkA07G145370	`PF13912`	zf-C2H2_6	62	65	0.042	14.6
TkA07G145370	`PF00096`	zf-C2H2	62	65	0.13	13.5
TkA07G145370	`PF13894`	zf-C2H2_4	96	101	0.018	16.4
TkA07G145370	`PF00096`	zf-C2H2	96	101	0.13	13.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39261`	拟南芥	sp\|Q39261\|ZFP2_ARATH Zinc finger protein 2	47.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q39266`	拟南芥	sp\|Q39266\|ZFP7_ARATH Zinc finger protein 7	46.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q42485`	拟南芥	sp\|Q42485\|ZFP1_ARATH Zinc finger protein 1	81.100%	Swiss-Prot	低置信
`Q39262`	拟南芥	sp\|Q39262\|ZFP3_ARATH Zinc finger protein 3	61.400%	Swiss-Prot	低置信
`Q39263`	拟南芥	sp\|Q39263\|ZFP4_ARATH Zinc finger protein 4	71.800%	Swiss-Prot	低置信

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