TkA07G134470 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G134470

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 34924718-34928060 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3130 bp · TkA07G134470|TK1151|cDNA

ATAATGAATCCACAAAAACTGCATTCCCTTTTCTTCTCCACAGTTTTCTTTTCAATAGTTTCAGGAGACGAAAAAGCTCAAATTTTTAACGACCGAGCTTCTCTCCTCACGTTCTTTTCCGGCGTCGTTTCTGATCCCGGAAACATTCTTCATAACTGGAACAGTTCTTTGATTCCAGTCTGTAACTGGACCGGAATCACATGCAATCAGAATCGTGATTTCGTTCTTGAGTTAGATCTAAGTGGAGCTTCACTCCATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2892 bp · TkA07G134470|TK1151|CDS

ATGAATCCACAAAAACTGCATTCCCTTTTCTTCTCCACAGTTTTCTTTTCAATAGTTTCAGGAGACGAAAAAGCTCAAATTTTTAACGACCGAGCTTCTCTCCTCACGTTCTTTTCCGGCGTCGTTTCTGATCCCGGAAACATTCTTCATAACTGGAACAGTTCTTTGATTCCAGTCTGTAACTGGACCGGAATCACATGCAATCAGAATCGTGATTTCGTTCTTGAGTTAGATCTAAGTGGAGCTTCACTCCATGGGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

963 aa · TkA07G134470|TK1151|PROTEIN

MNPQKLHSLFFSTVFFSIVSGDEKAQIFNDRASLLTFFSGVVSDPGNILHNWNSSLIPVCNWTGITCNQNRDFVLELDLSGASLHGIISPAISRLSRLKVLDLSRNFFEGGIPGEIGYLSELRQLSLSSNLLQGRIPFELGFLSKIQYLDLGSNRLVGDIPMALFCNGTSVLEYVDLSNNSISGPIPFTEECEISELRFLLVWSNKLTGRIPSALANSSKLKWLDLEVNGFEGELPFEIVKNLSNLQFVYLSYNRFSGPL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G134470`
TK1151 ID	TkA07G134470
OH-1004 ID	LXL04_028253
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G134470

位置 Chr07:34924718-34928060 (+)

描述 Similar to At2g24130: Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24130

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g24130`	推定的富含亮氨酸重复的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g24130。	暂无已核实直接文献
`At3g47570`	可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At3g47570。	暂无已核实直接文献
`At3g47110`	推测的类受体蛋白激酶 At3g47110。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: Q1MX30`	受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。	暂无已核实直接文献
`Os11g0569733`	受体激酶，可检测稻瘟病菌 X.oryzae pv. oryzae 的蛋白 Ax21 以促进先天免疫。	Cleavage and nuclear localization of the rice XA21 immune receptor.2012 · DOI: 10.1038/ncomms1932

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028253 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程

GO:0002764 immune response-regulating signaling pathway 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009617 response to bacterium 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程

GO:0016045 detection of bacterium 生物过程

GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程

GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G24130

ath:AT3G47570

ath:AT5G20480

osa:107276510

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.865

排名 1 · TkA07G134470 · TK1151

内质网0.090

排名 2 · TkA07G134470 · TK1151

细胞质0.058

排名 3 · TkA07G134470 · TK1151

细胞核0.041

排名 4 · TkA07G134470 · TK1151

溶酶体／液泡0.028

排名 5 · TkA07G134470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_229-68 aa

PF00560LRR_176-95 aa

PF13855LRR_876-132 aa

PF12799LRR_476-106 aa

PF23952LRR_EndoS76-106 aa

PF23211LRR_LRWD178-132 aa

PF29594LRR_SKP288-106 aa

PF23598LRR_1489-156 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G134470	`PF08263`	LRRNT_2	29	68	4.9e-10	40.2
TkA07G134470	`PF00560`	LRR_1	76	95	2.7e-59	184.9
TkA07G134470	`PF13855`	LRR_8	76	132	1.8e-40	137.2
TkA07G134470	`PF12799`	LRR_4	76	106	8.4e-33	112.4
TkA07G134470	`PF23952`	LRR_EndoS	76	106	1.9	9.4
TkA07G134470	`PF23211`	LRR_LRWD1	78	132	0.0014	19.1
TkA07G134470	`PF29594`	LRR_SKP2	88	106	0.0023	17.9
TkA07G134470	`PF23598`	LRR_14	89	156	1.5e-22	80.6
TkA07G134470	`PF24048`	LRR_NXF1-5	89	108	2.6	8.4
TkA07G134470	`PF25013`	LRR_Zer-1	90	106	0.017	16.0
TkA07G134470	`PF14580`	LRR_9	95	149	4.1	7.7
TkA07G134470	`PF00560`	LRR_1	97	119	2.7e-59	184.9
TkA07G134470	`PF13516`	LRR_6	98	106	0.00026	21.5
TkA07G134470	`PF12799`	LRR_4	121	160	8.4e-33	112.4
TkA07G134470	`PF00560`	LRR_1	122	142	2.7e-59	184.9
TkA07G134470	`PF13516`	LRR_6	122	130	0.00026	21.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZUI0`	拟南芥	sp\|Q9ZUI0\|Y2241_ARATH Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g24130	57.100%	Swiss-Prot	高置信
`C0LGP4`	拟南芥	sp\|C0LGP4\|Y3475_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570	42.100%	Swiss-Prot	低置信
`Q9SD62`	拟南芥	sp\|Q9SD62\|Y3471_ARATH Putative receptor-like protein kinase At3g47110	40.200%	Swiss-Prot	低置信
`Q1MX30`	水稻	sp\|Q1MX30\|XA21_ORYSI Receptor kinase-like protein Xa21	41.700%	Swiss-Prot	低置信
`Q2R2D5`	水稻	sp\|Q2R2D5\|XA21_ORYSJ Receptor kinase-like protein Xa21	40.800%	Swiss-Prot	低置信

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