TkA07G124230 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G124230

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 32185382-32190820 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

3892 bp · TkA07G124230|TK1151|cDNA

TATGAGAAATTTGTATTTGAAAATCCATAATTTTGTGCTTATTTTGCGTAAAGATAGTTAATAAAAAGTTATTTTGGTCGAATTCTCTTTATATAATAACACTATTTAAAATTAAAAAGAAACAATAAACTCTCAAAATGAAATCCACCACACACACCCTTGTTTTGTCCGATGACTGTTCGTTGAAGAAAGGGATTACGTAGGACTACCAAGTTGTCCATTACCACAAAACAGTCGATTACTTTTCCAAGTTCCATCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3204 bp · TkA07G124230|TK1151|CDS

ATGGATTCTACTGCTTCCTCCAGTACAATCGTTTCTCCCGGGACAAACAATAGCAGATACGACGTTTTCATAAGTTTTAGAGGCGAAGATACTCGCTTCTCCTTTACAGATCATCTCTACGAGGCGTTAGTGGGAGCAGGAATCAGGACTTTCACGGATGATGAGTCAATCAACAGAGGTGAAGATCTGAAACCCGAAATAGAAAGAGCAATCACTGCATCAAGGGCTTCAATAGTTGTATTGTCAAAAAATTACGCAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1067 aa · TkA07G124230|TK1151|PROTEIN

MDSTASSSTIVSPGTNNSRYDVFISFRGEDTRFSFTDHLYEALVGAGIRTFTDDESINRGEDLKPEIERAITASRASIVVLSKNYANSTWCLDELLLIMERRKTFYHIVIPVFYHVDPSDVRQQQNNFELKVNTVKWTEHKVERWKAALTEFANLDPMVLSGPETKFIADIVSTIGHKLRLKLASTPPHLTGMDTRAESINSWVKDKQDVEVLAICGMAGSGKTTMAKYIYDSNFLKFESSSFLEDIGKICEQPYGLCAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G124230`
TK1151 ID	TkA07G124230
OH-1004 ID	LXL04_028142
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	97.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 94.019 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G124230

位置 Chr07:32185382-32190820 (-)

描述暂无功能描述

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g19510`	疾病抗性蛋白，与RPP2A合作对Hyaloperonospora parasitica Cala2株产生抗性。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028142 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程

GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G12010

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.488

排名 1 · TkA07G124230 · TK1151

细胞核0.326

排名 2 · TkA07G124230 · TK1151

细胞膜0.261

排名 3 · TkA07G124230 · TK1151

内质网0.078

排名 4 · TkA07G124230 · TK1151

质体0.051

排名 5 · TkA07G124230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01582TIR20-185 aa

PF13676TIR_222-119 aa

PF08937ThsB_TIR29-95 aa

PF00931NB-ARC195-365 aa

PF24883NPHP3_N198-233 aa

PF01637ATPase_2199-304 aa

PF25199nSTAND_NTPase5204-226 aa

PF20720nSTAND3205-231 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G124230	`PF01582`	TIR	20	185	1.8e-44	152.4
TkA07G124230	`PF13676`	TIR_2	22	119	9.3e-19	68.8
TkA07G124230	`PF08937`	ThsB_TIR	29	95	0.0037	18.3
TkA07G124230	`PF00931`	NB-ARC	195	365	3.9e-21	76.1
TkA07G124230	`PF24883`	NPHP3_N	198	233	2e-06	28.8
TkA07G124230	`PF01637`	ATPase_2	199	304	0.072	13.6
TkA07G124230	`PF25199`	nSTAND_NTPase5	204	226	0.14	12.7
TkA07G124230	`PF20720`	nSTAND3	205	231	0.0093	16.4
TkA07G124230	`PF13173`	AAA_14	211	325	0.0021	18.8
TkA07G124230	`PF00005`	ABC_tran	211	232	0.18	13.1
TkA07G124230	`PF13401`	AAA_22	212	305	0.00023	22.2
TkA07G124230	`PF05729`	NACHT	212	308	0.082	13.5
TkA07G124230	`PF13238`	AAA_18	214	277	0.0038	18.4
TkA07G124230	`PF00004`	AAA	215	303	0.027	15.6
TkA07G124230	`PF01443`	Viral_helicase1	215	305	0.14	12.7
TkA07G124230	`PF07693`	KAP_NTPase	247	307	0.49	10.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4JT80`	拟南芥	sp\|F4JT80\|RPP2B_ARATH Disease resistance protein RPP2B	33.900%	Swiss-Prot	中等置信

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