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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G104250
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 27093575-27099071 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3113 bp · TkA07G104250|TK1151|cDNA

CTATATGCATCAATAAATCATATTTATCATATTTTCCTCATTTTCAGTTAGTGGGAGCTAATCAAGTTCCATTTTTTTGACTTCTTGTTCTTTCGAGTTTCTATAGTAAATCAACAAATTCATAGTTACTAATTTCTCATAGAAATTACAAAAAAACTTGAGGGAGGTTGCTAACTTACAATGATCTTTCTTCTTCATTTGTTCATTTCGTGTATTACTTTTGTTATTGTTCATGGACAAGTTCAAACAGGTTATATAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2043 bp · TkA07G104250|TK1151|CDS

ATGAATGGGACGGGTCGATATGTGGATGATATATATGATCGAATTTGGTCTCCTTATGGTTCGTTATCATGGGATTCTTTAAGTACGTCTTTAGATATAGATGTAAGTGGAAATGACTATAGAGCCCCTAGTGAAGTCATGCGAACGGCCGCCACTCCCAAAAACGGAACCGAGGGTTTGGAGTTTAGTTGGAATATGTCGGACTCTGAAGAAGCTAAGTTTTATGTTTATATGTACTTTGCTGACGTGGCGGTGTTGGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

680 aa · TkA07G104250|TK1151|PROTEIN

MNGTGRYVDDIYDRIWSPYGSLSWDSLSTSLDIDVSGNDYRAPSEVMRTAATPKNGTEGLEFSWNMSDSEEAKFYVYMYFADVAVLGRNETRQFNVSWNGEPLFGNVRPRAYYASTFYNLRPLVGNKHKISIRRSSGANLPPILNAIEIFRVQEFSEFATFDIDVDAIESIKTTYKVNRNWVGDPCGPKNYSWEGVKCNYTNSNPPRIISINLSTSDLTGQIATSIANLSSLETLDLSNNSLTGQIPDFLENLSSLKLID...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G104250
TK1151 IDTkA07G104250
OH-1004 IDLXL04_027912
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 76.836
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G104250
位置Chr07:27093575-27099071 (+)
描述Similar to At4g29180: Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g29180
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g29180 可能的 LRR 类似受体丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At4g29180。 暂无已核实直接文献
At2g19230 推定的富含亮氨酸重复序列的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At2g19230。 暂无已核实直接文献
At2g19190 参与植物的先天免疫反应。 暂无已核实直接文献
At2g19210 推定富含亮氨酸重复序列的受体样蛋白激酶 At2g19210。 暂无已核实直接文献
At1g05700 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g05700。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027912 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05700
ath:AT2G19190
ath:AT2G19210
ath:AT2G19230
ath:AT4G29180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.858
排名 1 · TkA07G104250 · TK1151
内质网0.083
排名 2 · TkA07G104250 · TK1151
细胞质0.072
排名 3 · TkA07G104250 · TK1151
细胞核0.041
排名 4 · TkA07G104250 · TK1151
溶酶体／液泡0.034
排名 5 · TkA07G104250 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12819Malectin_like5-152 aa
PF00560LRR_1209-229 aa
PF13855LRR_8210-266 aa
PF13516LRR_6230-243 aa
PF00560LRR_1231-253 aa
PF12799LRR_4231-267 aa
PF13516LRR_6254-267 aa
PF00560LRR_1255-273 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G104250PF12819Malectin_like51526.6e-40138.1
TkA07G104250PF00560LRR_12092291.8e-0627.6
TkA07G104250PF13855LRR_82102662.4e-0731.1
TkA07G104250PF13516LRR_62302434.28.4
TkA07G104250PF00560LRR_12312531.8e-0627.6
TkA07G104250PF12799LRR_42312671.4e-0525.9
TkA07G104250PF13516LRR_62542674.28.4
TkA07G104250PF00560LRR_12552731.8e-0627.6
TkA07G104250PF04415DUF5152863550.1211.6
TkA07G104250PF03109ABC12893435.1e-0626.5
TkA07G104250PF09716ETRAMP3003340.1412.9
TkA07G104250PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3665782.3e-48165.5
TkA07G104250PF17667Pkinase_fungal3664130.0214.3
TkA07G104250PF00069Pkinase3676292.9e-45155.4
TkA07G104250PF03109ABC13674035.1e-0626.5
TkA07G104250PF17667Pkinase_fungal4635550.0214.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
C0LGR6拟南芥sp|C0LGR6|Y4291_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g2918051.600%Swiss-Prot高置信
O64556拟南芥sp|O64556|Y2923_ARATH Putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g1923049.500%Swiss-Prot中等置信
O64483拟南芥sp|O64483|SIRK_ARATH Senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase49.800%Swiss-Prot中等置信
O65924拟南芥sp|O65924|Y2921_ARATH Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g1921048.200%Swiss-Prot中等置信
C0LGD6拟南芥sp|C0LGD6|Y1570_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g0570047.400%Swiss-Prot中等置信

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