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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G093630
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 24396524-24400968 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1605 bp · TkA07G093630|TK1151|cDNA

ATGGCACTCATCTTCTCCAAGATAGGCATCATCGGAGGTGGCATAAGCGGCTTAGCGGCGGCCAAACAGCTATCCGAACACAACCCAATAGTGTTAGAAGCCACCGACTCCATTGGAGGTGTTTGGAAGCACTGCGCCTTTAGAACCACCAAACTTCAAACCCCTCGTTGCGACTATGAATTCTCAGATTATCCATGGCCGAATAGGGATAATACCAGCTTCCCGTCGCATGCGGAGATTGTGGATTATCTCAGTTCTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1605 bp · TkA07G093630|TK1151|CDS

ATGGCACTCATCTTCTCCAAGATAGGCATCATCGGAGGTGGCATAAGCGGCTTAGCGGCGGCCAAACAGCTATCCGAACACAACCCAATAGTGTTAGAAGCCACCGACTCCATTGGAGGTGTTTGGAAGCACTGCGCCTTTAGAACCACCAAACTTCAAACCCCTCGTTGCGACTATGAATTCTCAGATTATCCATGGCCGAATAGGGATAATACCAGCTTCCCGTCGCATGCGGAGATTGTGGATTATCTCAGTTCTTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

534 aa · TkA07G093630|TK1151|PROTEIN

MALIFSKIGIIGGGISGLAAAKQLSEHNPIVLEATDSIGGVWKHCAFRTTKLQTPRCDYEFSDYPWPNRDNTSFPSHAEIVDYLSSYAKHFDLFKFIKFNSKVVEIRLAKDQSESPTKLSTLLSAGKPVWEVAVQTTGSAIQWYGFEFIVVCMGKYGDVPIIPKYGMKKGPEVFKGRVMHSQEYSKLNVEESSKLLKDKKVVVVGYKKSGIDLAVECAEANQGEEGKTCTMVVRTSHWTVPHYSIWGLPFYLFYSTRFSQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G093630
TK1151 IDTkA07G093630
OH-1004 IDLXL04_027779
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)92.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G093630
位置Chr07:24396524-24400968 (-)
描述Similar to FMO1: Probable flavin-containing monooxygenase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g19250 建立系统性获得性耐药性 所需的。
The Arabidopsis flavin-dependent monooxygenase FMO1 is an essential component of biologically induced systemic acquired resistance.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081257
A role for a flavin-containing mono-oxygenase in resistance against microbial pathogens in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02813.x
At5g45180 推测含黄素的单加氧酶 2。 暂无已核实直接文献
At2g33230 参与生长素生物合成。
Activation of a flavin monooxygenase gene YUCCA7 enhances drought resistance in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1552-3

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027779 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程
GO:0006805 xenobiotic metabolic process 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0062034 L-pipecolic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0090181 regulation of cholesterol metabolic process 生物过程
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19250
ath:AT5G45180
mmu:14262
ocu:100009064
rno:246248
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.314
排名 1 · TkA07G093630 · TK1151
细胞质0.211
排名 2 · TkA07G093630 · TK1151
线粒体0.163
排名 3 · TkA07G093630 · TK1151
过氧化物酶体0.116
排名 4 · TkA07G093630 · TK1151
细胞膜0.095
排名 5 · TkA07G093630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01946Thi46-42 aa
PF00743FMO-like7-265 aa
PF07992Pyr_redox_27-220 aa
PF01266DAO8-61 aa
PF13738Pyr_redox_310-112 aa
PF13450NAD_binding_810-60 aa
PF13454NAD_binding_910-59 aa
PF00890FAD_binding_210-40 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G093630PF01946Thi46420.05513.4
TkA07G093630PF00743FMO-like72651.7e-41143.0
TkA07G093630PF07992Pyr_redox_272208.9e-0522.8
TkA07G093630PF01266DAO8618.6e-0626.2
TkA07G093630PF13738Pyr_redox_3101121e-1145.4
TkA07G093630PF13450NAD_binding_810605.2e-0730.6
TkA07G093630PF13454NAD_binding_910590.007217.0
TkA07G093630PF00890FAD_binding_210400.3910.6
TkA07G093630PF01593Amino_oxidase15400.0004720.3
TkA07G093630PF13434Lys_Orn_oxgnase712443.6e-0730.3
TkA07G093630PF01266DAO1261818.6e-0626.2
TkA07G093630PF13738Pyr_redox_31782451e-1145.4
TkA07G093630PF01946Thi41992190.05513.4
TkA07G093630PF13450NAD_binding_82723045.2e-0730.6
TkA07G093630PF00743FMO-like3385081.7e-41143.0
TkA07G093630PF13738Pyr_redox_33733961e-1145.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMA1拟南芥sp|Q9LMA1|FMO1_ARATH Probable flavin-containing monooxygenase 162.200%Swiss-Prot高置信
Q9FKE7拟南芥sp|Q9FKE7|FMO2_ARATH Putative flavin-containing monooxygenase 255.900%Swiss-Prot高置信
O49312拟南芥sp|O49312|YUC7_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA726.900%Swiss-Prot低置信

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