基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA07G081170
当前版本: TK1151
染色体: Chr07
坐标: 21228101-21228532
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA432 bp · TkA07G081170|TK1151|cDNA
ATGGTATGTTCATGTGGCAAGTCCGAATCCGTGGTTACTTCCTGGATCGAAGAAATCCTGACAGAAATCGAAGGGTTAGCCCAAACCGGAATCCTCGTTTCCATCGACGGCCAACTCACTGGCATTCTCGCAATTTCCGATCCGTTAAAACCCGGTGCTCGCGAGGTAATCTCCATTCTCAAATCCATGAAAATAAAAAGTCTATTGGTCACCGGAGACAACTGGGGAACCGCGAATTCCATCGCGAAGGAAGTCGGAAT...
CDS
下载 CDS FASTA432 bp · TkA07G081170|TK1151|CDS
ATGGTATGTTCATGTGGCAAGTCCGAATCCGTGGTTACTTCCTGGATCGAAGAAATCCTGACAGAAATCGAAGGGTTAGCCCAAACCGGAATCCTCGTTTCCATCGACGGCCAACTCACTGGCATTCTCGCAATTTCCGATCCGTTAAAACCCGGTGCTCGCGAGGTAATCTCCATTCTCAAATCCATGAAAATAAAAAGTCTATTGGTCACCGGAGACAACTGGGGAACCGCGAATTCCATCGCGAAGGAAGTCGGAAT...
143 aa · TkA07G081170|TK1151|PROTEIN
MVCSCGKSESVVTSWIEEILTEIEGLAQTGILVSIDGQLTGILAISDPLKPGAREVISILKSMKIKSLLVTGDNWGTANSIAKEVGIEDVIAESKPEDKAEKVKSLQGSGFVVTMVGDGINDSPALVAADVGNGDWSWYRHSD
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA07G081170 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA07G081170 |
| OH-1004 ID | LXL04_002266 |
| 关系 / 置信度 | 序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核 |
| 蛋白一致性 (%) | 98.500 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 91.608 / OH-1004 43.813覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA07G081170 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:21228101-21228532 (+) | ||||||||||||
| 描述 | Similar to HMA5: Probable copper-transporting ATPase HMA5 | ||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| ||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009636 response to toxic substance 生物过程 GO:0009723 response to ethylene 生物过程 GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程 GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程 GO:0010273 detoxification of copper ion 生物过程 GO:0046688 response to copper ion 生物过程 GO:0055070 copper ion homeostasis 生物过程 GO:0055085 transmembrane transport 生物过程 GO:0071280 cellular response to copper ion 生物过程 GO:0005768 endosome 细胞组分 GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 | ||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G63440 ath:AT5G44790 dosa:Os02g0196600 dosa:Os04g0556000 dosa:Os06g0665800 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.241
质体0.234
过氧化物酶体0.120
细胞外0.108
线粒体0.089
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00702Hydrolase15-130 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA07G081170 | PF00702 | Hydrolase | 15 | 130 | 1.3e-21 | 78.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9SH30 | 拟南芥 | sp|Q9SH30|HMA5_ARATH Probable copper-transporting ATPase HMA5 | 75.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9S7J8 | 拟南芥 | sp|Q9S7J8|HMA7_ARATH Copper-transporting ATPase RAN1 | 52.100% | Swiss-Prot | 高置信 |
A3AWA4 | 水稻 | sp|A3AWA4|HMA5_ORYSJ Copper-transporting ATPase HMA5 | 63.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q6H7M3 | 水稻 | sp|Q6H7M3|HMA4_ORYSJ Copper-transporting ATPase HMA4 | 59.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
A0A0P0X004 | 水稻 | sp|A0A0P0X004|HMA9_ORYSJ Cation-transporting ATPase HMA5 | 56.900% | Swiss-Prot | 高置信 |