RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G079110
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 20672962-20676134 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1515 bp · TkA07G079110|TK1151|cDNA

ATCAAGAGCATGAGTGGATTGCACTCCAAAAATATGGACGATGAACAGATAAAGAAGGACGAATACCATAAACAGGAGGAAGTCATGCAACTGTCCACAATTTGTGCAAGGAACAAGATAATGTTCCAGATAGATGTGCAATCTGGATCTTCCCCAAAGAAAGTCGCAGCAAAGGCGGCCAAAAGCTTGAGCCTGACATGGGTCGTACTTGACAGGCAGATGAAGAAAGACAGAAAGTACTTTATGGAGAATCTTACATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1506 bp · TkA07G079110|TK1151|CDS

ATGAGTGGATTGCACTCCAAAAATATGGACGATGAACAGATAAAGAAGGACGAATACCATAAACAGGAGGAAGTCATGCAACTGTCCACAATTTGTGCAAGGAACAAGATAATGTTCCAGATAGATGTGCAATCTGGATCTTCCCCAAAGAAAGTCGCAGCAAAGGCGGCCAAAAGCTTGAGCCTGACATGGGTCGTACTTGACAGGCAGATGAAGAAAGACAGAAAGTACTTTATGGAGAATCTTACATGTGGAATATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

502 aa · TkA07G079110|TK1151|PROTEIN

MSGLHSKNMDDEQIKKDEYHKQEEVMQLSTICARNKIMFQIDVQSGSSPKKVAAKAAKSLSLTWVVLDRQMKKDRKYFMENLTCGILRMKRDNRVEKLRGPIIMEDKKLRSLRRTSSNEHVSYGEMIPVMSKRELSLKKTPNAQKPTYKLEGGDRRFAPPRDKPQLSSSPPSTDQTSPTASKASTSSFGASEVSTMNSSFTYDGQQEEFEYSVCSVCQNKRPSIRLKKDFVYAELYQATNGFSKNNFLSEGGFGSVYEGE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G079110
TK1151 IDTkA07G079110
OH-1004 IDLXL04_027620
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 86.403
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G079110
位置Chr07:20672962-20676134 (+)
描述Similar to PERK3: Proline-rich receptor-like protein kinase PERK3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g38560 可能参与根生长的负调控。
PERK-KIPK-KCBP signalling negatively regulates root growth in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1093/jxb/eru390
At3g24540 富脯氨酸受体样蛋白激酶 PERK3。 暂无已核实直接文献
At1g07870 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At2g28590 可能参与植物防御信号传导。 暂无已核实直接文献
At1g52290 富脯氨酸受体样蛋白激酶PERK15。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027620 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0019901 protein kinase binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07870
ath:AT1G52290
ath:AT2G28590
ath:AT5G38560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.553
排名 1 · TkA07G079110 · TK1151
细胞质0.330
排名 2 · TkA07G079110 · TK1151
细胞核0.288
排名 3 · TkA07G079110 · TK1151
内质网0.040
排名 4 · TkA07G079110 · TK1151
高尔基体0.030
排名 5 · TkA07G079110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase244-502 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr245-452 aa
PF03109ABC1253-275 aa
PF17667Pkinase_fungal352-432 aa
PF03109ABC1354-390 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G079110PF00069Pkinase2445025.6e-41141.4
TkA07G079110PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2454522.3e-43149.1
TkA07G079110PF03109ABC12532750.01715.0
TkA07G079110PF17667Pkinase_fungal3524320.02214.2
TkA07G079110PF03109ABC13543900.01715.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FFW5拟南芥sp|Q9FFW5|PERK8_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK845.400%Swiss-Prot中等置信
Q1PEM5拟南芥sp|Q1PEM5|PERK3_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK346.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LQQ8拟南芥sp|Q9LQQ8|PBL5_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL542.500%Swiss-Prot中等置信
Q9SIB6拟南芥sp|Q9SIB6|PBL6_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL644.100%Swiss-Prot中等置信
Q9C821拟南芥sp|Q9C821|PEK15_ARATH Proline-rich receptor-like protein kinase PERK1545.800%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看