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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G077520
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 20169225-20181442 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6630 bp · TkA07G077520|TK1151|cDNA

TGGGATTTCAAATCCATACCCCGGGCCGGCAAGCCCTCACCTGACCTAACACCCCAATACATAAAACTGAAATTTCATCCCCTCCCGACATTCCCCCAAATCTCCCTCTTAATATCTTTATTCGTTTCAAATTGGGGGAGAAATCAACCCCAAAGACGTTATGTTCTTCTTCCCACACACTACAAGTTACAGACTTCGATTTGATCGCCATTTGTATCTAGAACACATATATACATATCTATTCATCTATATAACTTGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

3111 bp · TkA07G077520|TK1151|CDS

ATGAGAGAATCTGCTTTGGCAGCTTTGGATTCTTGGGTTGCTGCCACTCACCTTGATAAGATGGTACCATACATTACTACTTCTTTGACTGATGCTAAACTTGGTGCGGAAGGACGCAAAGACCTTTTCGATTGGTTGTCCAGACAACTTACGGGAATAGCAGAGTTCCCTGATGCAATTCAATTGTTGAGACCTGTTGCTGCTGCTATGACGGATAAGTCAGTGGATGTTCGTAAAGCAGCAGAAACATTCTTTGGAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1036 aa · TkA07G077520|TK1151|PROTEIN

MRESALAALDSWVAATHLDKMVPYITTSLTDAKLGAEGRKDLFDWLSRQLTGIAEFPDAIQLLRPVAAAMTDKSVDVRKAAETFFGDIVRVCGPEVVMKNSRDIQGPALAIVLERLKSHGAVPEVHDNAKTSAPSWQAAKTKVGKSNGYGSKAGSRAVSSRGVSAKAAKSEPIMSVQDINVQSQALLNIKDSNKDERERSVVRRFKFEEVRLEQIQDLENDLMKYFREDLHRRLLSTDFKKQVDGIEMLQRALPTMGKEI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G077520
TK1151 IDTkA07G077520
OH-1004 IDLXL04_027601
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)97.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 52.979
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G077520
位置Chr07:20169225-20181442 (-)
描述Similar to MOR1: Protein MOR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g35630 微管结合蛋白，对于皮质微管的组织和功能至关重要。
MOR1 is essential for organizing cortical microtubules in plants.2001 · DOI: 10.1038/35079128
Mutation or drug-dependent microtubule disruption causes radial swelling without altering parallel cellulose microfibril deposition in Arabidopsis root cells.2003 · DOI: 10.1105/tpc.011593
Genetic analysis of adventitious root formation with a novel series of temperature-sensitive mutants of Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1242/dev.00794
Cellulose microfibril alignment recovers from DCB-induced disruption despite microtubule disorganization.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01906.x
Aberrant cell plate formation in the Arabidopsis thaliana microtubule organization 1 mutant.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci068
MICROTUBULE ORGANIZATION 1 regulates structure and function of microtubule arrays during mitosis and cytokinesis in the Arabidopsis root.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.069989
Hypersensitivity to cytoskeletal antagonists demonstrates microtubule-microfilament cross-talk in the control of root elongation in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2006.01671.x
MOR1, the Arabidopsis thaliana homologue of Xenopus MAP215, promotes rapid growth and shrinkage, and suppresses the pausing of microtubules in vivo.2008 · DOI: 10.1242/jcs.039065

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0816400 微管相关蛋白，对皮质微管的组织和功能至关重要。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027601 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0002181 cytoplasmic translation 生物过程
GO:0007019 microtubule depolymerization 生物过程
GO:0007051 spindle organization 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0007098 centrosome cycle 生物过程
GO:0009920 cell plate formation involved in plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010609 mRNA localization resulting in post-transcriptional regulation of gene expression 生物过程
GO:0022618 protein-RNA complex assembly 生物过程
GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程
GO:0045807 positive regulation of endocytosis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G35630
dosa:Os01g0816400
hsa:9793
mmu:75786
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.691
排名 1 · TkA07G077520 · TK1151
细胞膜0.197
排名 2 · TkA07G077520 · TK1151
细胞核0.178
排名 3 · TkA07G077520 · TK1151
高尔基体0.148
排名 4 · TkA07G077520 · TK1151
溶酶体／液泡0.059
排名 5 · TkA07G077520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25782TPR_CAND115-127 aa
PF24987HEAT_EF3_N21-95 aa
PF08161RRP12_HEAT57-99 aa
PF24492HEAT_ECM2959-104 aa
PF21041XMAP215_CLASP_TOG60-99 aa
PF02985HEAT62-92 aa
PF26611MAD7171-226 aa
PF11698V-ATPase_H_C173-189 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G077520PF25782TPR_CAND1151270.008617.2
TkA07G077520PF24987HEAT_EF3_N21951.4e-0525.8
TkA07G077520PF08161RRP12_HEAT57990.007216.5
TkA07G077520PF24492HEAT_ECM29591040.1812.7
TkA07G077520PF21041XMAP215_CLASP_TOG60994.9e-0833.7
TkA07G077520PF02985HEAT62920.04514.7
TkA07G077520PF26611MAD71712260.0313.8
TkA07G077520PF11698V-ATPase_H_C1731890.0009320.1
TkA07G077520PF28950YDR249C_C2593071.59.3
TkA07G077520PF21041XMAP215_CLASP_TOG2734414.9e-0833.7
TkA07G077520PF24987HEAT_EF3_N3123811.4e-0525.8
TkA07G077520PF11698V-ATPase_H_C3234110.0009320.1
TkA07G077520PF25782TPR_CAND13273890.008617.2
TkA07G077520PF24492HEAT_ECM293434210.1812.7
TkA07G077520PF02985HEAT3483750.04514.7
TkA07G077520PF02985HEAT4004110.04514.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94FN2拟南芥sp|Q94FN2|MOR1_ARATH Protein MOR170.200%Swiss-Prot高置信
Q5N749水稻sp|Q5N749|MOR1_ORYSJ Protein MOR166.200%Swiss-Prot高置信

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