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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G069770
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 18293581-18295979 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1117 bp · TkA07G069770|TK1151|cDNA

GTTTTATCCTCTTATCGTTTCAAAAAAATTATACATACTACGCATATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGATATGGGTAGGAATTGCAATTTGGAACTCCGCCTTGTGCCGCCGTCACCGTACATTTTCTCCGATCACAACCATCAGTGTCAAGAAAAAACAAGTGAGGAGAATACGGCGGTTGGCGAGGATTTAAAGGATATGCAGAAGCTAACAATCTTTTACGACGGAAAAGTCAGCGT...

CDS

下载 CDS FASTA

396 bp · TkA07G069770|TK1151|CDS

ATGGGTAGGAATTGCAATTTGGAACTCCGCCTTGTGCCGCCGTCACCGTACATTTTCTCCGATCACAACCATCAGTGTCAAGAAAAAACAAGTGAGGAGAATACGGCGGTTGGCGAGGATTTAAAGGATATGCAGAAGCTAACAATCTTTTACGACGGAAAAGTCAGCGTTTGTGACGTCACAGAGCTTCAGGCAAGAACAATAATAAAGCTAGCAAGCGAAGAAATAGAGGAGAAATGGAGGAGAACACCGGGATTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

131 aa · TkA07G069770|TK1151|PROTEIN

MGRNCNLELRLVPPSPYIFSDHNHQCQEKTSEENTAVGEDLKDMQKLTIFYDGKVSVCDVTELQARTIIKLASEEIEEKWRRTPGLTTSLESPSPLILPPMYSPSGLSMKRSLQRFLQKRKNRMQATSPYH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G069770
TK1151 IDTkA07G069770
OH-1004 IDLXL04_027514
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G069770
位置Chr07:18293581-18295979 (-)
描述Similar to TIFY5A: Protein TIFY 5A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g30135 茉莉酸反应的阻遏物。
JAZ8 lacks a canonical degron and has an EAR motif that mediates transcriptional repression of jasmonate responses in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.093005
At3g22275 茉莉酸（JA）介导的生长和防御反应的非TIFY功能性抑制因子。
Repression of jasmonate signaling by a non-TIFY JAZ protein in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12841
At5g13220 茉莉酸（JA）反应的抑制因子，缺失整个 Jas 域，并表现为对 JA 的严重不敏感以及对 JA 诱导降解的抗性。
A downstream mediator in the growth repression limb of the jasmonate pathway.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050708
A critical role for the TIFY motif in repression of jasmonate signaling by a stabilized splice variant of the JASMONATE ZIM-domain protein JAZ10 in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.064097
Negative feedback control of jasmonate signaling by an alternative splice variant of JAZ10.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.218164

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027514 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0009867 jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010112 regulation of systemic acquired resistance 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:2000022 regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003714 transcription corepressor activity 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30135
ath:AT2G34600
ath:AT3G22275
ath:AT5G13220
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.906
排名 1 · TkA07G069770 · TK1151
细胞质0.147
排名 2 · TkA07G069770 · TK1151
细胞膜0.052
排名 3 · TkA07G069770 · TK1151
内质网0.039
排名 4 · TkA07G069770 · TK1151
质体0.020
排名 5 · TkA07G069770 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21812DUF688117-67 aa
PF06200tify45-73 aa
PF09425Jas_motif110-130 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G069770PF21812DUF688117670.213.0
TkA07G069770PF06200tify45731.4e-1144.2
TkA07G069770PF09425Jas_motif1101302e-1041.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LBM2拟南芥sp|Q8LBM2|TIF5A_ARATH Protein TIFY 5A43.200%Swiss-Prot中等置信
F4J078拟南芥sp|F4J078|JAZ13_ARATH Protein JAZ1333.100%Swiss-Prot中等置信
Q93ZM9拟南芥sp|Q93ZM9|TIF9_ARATH Protein TIFY 936.800%Swiss-Prot中等置信

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