TkA07G063780 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G063780

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 16885599-16887912 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1958 bp · TkA07G063780|TK1151|cDNA

TTTCGAACCCCTGCCACAAGCCTGATACCAACGAACCTATATATTAAAGGATCAAAAACCCTAGTAGACGAGAGTACAACCACGAGAAGAGACCCAATGACTTCGCCGGAGAAGCGATGCCTTTACGAAGTCCTTGGTCTCCCTCGCGATTGCAGCCCCGACGAGATCCGCTCGGCCTACAGAAAGCTCGCCCTCCAACGCCACCCGGACAAGCTAATCAAGTCCGGCGTTAGCGAAGCAGAAGCCACCGCTTCCTTCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1164 bp · TkA07G063780|TK1151|CDS

TTTCGAACCCCTGCCACAAGCCTGATACCAACGAACCTATATATTAAAGGATCAAAAACCCTAGTAGACGAGAGTACAACCACGAGAAGAGACCCAATGACTTCGCCGGAGAAGCGATGCCTTTACGAAGTCCTTGGTCTCCCTCGCGATTGCAGCCCCGACGAGATCCGCTCGGCCTACAGAAAGCTCGCCCTCCAACGCCACCCGGACAAGCTAATCAAGTCCGGCGTTAGCGAAGCAGAAGCCACCGCTTCCTTCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

387 aa · TkA07G063780|TK1151|PROTEIN

FRTPATSLIPTNLYIKGSKTLVDESTTTRRDPMTSPEKRCLYEVLGLPRDCSPDEIRSAYRKLALQRHPDKLIKSGVSEAEATASFQELVNAYEVLSDVRERTWYDSHRSQILFSSSNSNKSSSGSAVVPDLMSFFSNSVYSGFSDKGKGFYKVYADVFDKIYRNELNFAKKLGLGDVVKEAPLMGNLDSPYAQVNAFYGYWLGFVTVMDFVWEDEYDATAGPNRKSRRLMEDENKKIRKKAKREYNETVRGLAEFVKKR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G063780`
TK1151 ID	TkA07G063780
OH-1004 ID	LXL04_015275
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)	92.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 63.566 / OH-1004 53.611 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G063780

位置 Chr07:16885599-16887912 (-)

描述 Similar to JJJ1: DNAJ protein JJJ1 homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g74250`	DNAJ蛋白 JJJ1 同源物。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015275 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006457 protein folding 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005840 ribosome 细胞组分

GO:0003676 nucleic acid binding 分子功能

GO:0003723 RNA binding 分子功能

GO:0008270 zinc ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G74250

bta:509302

dre:336984

hsa:134218

mmu:78244

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.509

排名 1 · TkA07G063780 · TK1151

细胞核0.480

排名 2 · TkA07G063780 · TK1151

内质网0.063

排名 3 · TkA07G063780 · TK1151

线粒体0.058

排名 4 · TkA07G063780 · TK1151

细胞膜0.052

排名 5 · TkA07G063780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00226DnaJ41-106 aa

PF21884ZUO1-like_ZHD151-264 aa

PF30210YKR005C_N160-172 aa

PF30210YKR005C_N219-260 aa

PF12269CpG_bind_C230-284 aa

PF30210YKR005C_N253-299 aa

PF12269CpG_bind_C267-358 aa

PF18868zf-C2H2_3rep291-350 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G063780	`PF00226`	DnaJ	41	106	2.7e-20	72.9
TkA07G063780	`PF21884`	ZUO1-like_ZHD	151	264	1e-21	78.2
TkA07G063780	`PF30210`	YKR005C_N	160	172	2.0	9.1
TkA07G063780	`PF30210`	YKR005C_N	219	260	2.0	9.1
TkA07G063780	`PF12269`	CpG_bind_C	230	284	9.9	6.5
TkA07G063780	`PF30210`	YKR005C_N	253	299	2.0	9.1
TkA07G063780	`PF12269`	CpG_bind_C	267	358	9.9	6.5
TkA07G063780	`PF18868`	zf-C2H2_3rep	291	350	0.11	13.9
TkA07G063780	`PF14871`	GHL6	293	332	0.0057	17.6
TkA07G063780	`PF30210`	YKR005C_N	315	371	2.0	9.1
TkA07G063780	`PF13824`	zf-Mss51	322	366	0.27	12.1
TkA07G063780	`PF26408`	DUF8106	325	350	0.28	11.7
TkA07G063780	`PF12756`	zf-C2H2_2	326	362	0.0097	16.8
TkA07G063780	`PF12171`	zf-C2H2_jaz	329	354	4.1e-11	43.5
TkA07G063780	`PF12874`	zf-met	329	353	6.3e-08	33.4
TkA07G063780	`PF25095`	C2H2-zf_KIN17	329	355	0.034	15.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9C911`	拟南芥	sp\|Q9C911\|JJJ1_ARATH DNAJ protein JJJ1 homolog	69.600%	Swiss-Prot	高置信

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