TkA07G061290 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G061290

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 16238075-16243053 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2965 bp · TkA07G061290|TK1151|cDNA

GCGACACATACTTGTGAAAAGACATAAATACTCTCATCATGGTTCTAGATAGCGATTGAATTATAAAATGATTGAACTCGAAACAATATATATGGTTTAAGAATTAAGAGTCTCCGCATATTCTGAAATTGTGGATTTGACCGAAAGTATTAACCTTTAAAAGAGAGTGAAGAAAATGAGATTAGAGAGGCATCTTTGGTTTGAAACCGAGAATGTCACTTCTTGGAGGAAAGAAATCAAGATTCCATTGGCCCATTCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2199 bp · TkA07G061290|TK1151|CDS

ATGTCGTTTTCAGCCAACACCAACTTGCTCGGGTGCTTCCGGTTTAATGATTTCCCAACCGGAAAAACCACCGGATTATTATACTCCGGCGATCTCCTCCCGTCTCTCGGAGCCAATTTTAACCGCTCGGTTTCTCTAAATAAATACGTCGTTTCCCCGTTTGATAGACGTTACAGGGTGTGGGAGATGTTTCTGATTATTTTGGTGGTTTACTCGGCTTGGATTTCGCCATTTGACTTTGCGTTTCTTGATGAAAGGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

732 aa · TkA07G061290|TK1151|PROTEIN

MSFSANTNLLGCFRFNDFPTGKTTGLLYSGDLLPSLGANFNRSVSLNKYVVSPFDRRYRVWEMFLIILVVYSAWISPFDFAFLDEREGILRIYDNIVNGFFAIDIVLTFFVAYLDSQAYVLVDDHKKIALRYLSTWFIFDVSSTVPFRSLSLLCTDRRSVMGFQVLSMLRLWRLRRVSSLFARLEKDIRFNYFWIRCTKLISVTLFAVHCAGCFNYLIADRYPDPKNTWIGAVNPNFKTDRIWNRYVTSLYWSIVTLTTT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G061290`
TK1151 ID	TkA07G061290
OH-1004 ID	LXL04_027482
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	98.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G061290

位置 Chr07:16238075-16243053 (+)

描述 Similar to KAT1: Potassium channel KAT1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g46240`	高选择性内向整流钾通道。	暂无已核实直接文献
`At4g18290`	高选择性内向整流钾通道。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os02g0245800`	推测的内向整流钾通道。	暂无已核实直接文献
`Os01g0756700`	推测的内向整流钾通道。	暂无已核实直接文献
`Os01g0210700`	推测的内向整流钾通道。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027482 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007623 circadian rhythm 生物过程

GO:0009644 response to high light intensity 生物过程

GO:0010118 stomatal movement 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0034702 monoatomic ion channel complex 细胞组分

GO:0005242 inward rectifier potassium channel activity 分子功能

GO:0005249 voltage-gated potassium channel activity 分子功能

GO:0042802 identical protein binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G18290

ath:AT5G46240

dosa:Os01g0648000

dosa:Os02g0245800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.558

排名 1 · TkA07G061290 · TK1151

细胞质0.193

排名 2 · TkA07G061290 · TK1151

内质网0.139

排名 3 · TkA07G061290 · TK1151

溶酶体／液泡0.129

排名 4 · TkA07G061290 · TK1151

高尔基体0.085

排名 5 · TkA07G061290 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00520Ion_trans58-304 aa

PF00023Ank207-218 aa

PF07885Ion_trans_2243-298 aa

PF00027cNMP_binding395-481 aa

PF12796Ank_2540-605 aa

PF13857Ank_5541-585 aa

PF13637Ank_4541-569 aa

PF13606Ank_3548-576 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G061290	`PF00520`	Ion_trans	58	304	1e-42	146.7
TkA07G061290	`PF00023`	Ank	207	218	1.7e-10	41.3
TkA07G061290	`PF07885`	Ion_trans_2	243	298	1.2e-12	48.3
TkA07G061290	`PF00027`	cNMP_binding	395	481	2.5e-17	63.3
TkA07G061290	`PF12796`	Ank_2	540	605	2.2e-12	48.1
TkA07G061290	`PF13857`	Ank_5	541	585	8.6e-11	42.7
TkA07G061290	`PF13637`	Ank_4	541	569	6e-09	36.7
TkA07G061290	`PF13606`	Ank_3	548	576	1.6e-06	28.6
TkA07G061290	`PF00023`	Ank	549	579	1.7e-10	41.3
TkA07G061290	`PF24521`	Ank_KRIT1	549	606	0.029	14.8
TkA07G061290	`PF13637`	Ank_4	553	600	6e-09	36.7
TkA07G061290	`PF00023`	Ank	582	604	1.7e-10	41.3
TkA07G061290	`PF11834`	KHA	651	718	1.1e-22	80.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39128`	拟南芥	sp\|Q39128\|KAT1_ARATH Potassium channel KAT1	56.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q38849`	拟南芥	sp\|Q38849\|KAT2_ARATH Potassium channel KAT2	54.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K3T2`	水稻	sp\|Q6K3T2\|KAT1_ORYSJ Potassium channel KAT1	50.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q5JM04`	水稻	sp\|Q5JM04\|KAT3_ORYSJ Potassium channel KAT3	65.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5QNI1`	水稻	sp\|Q5QNI1\|KAT2_ORYSJ Potassium channel KAT2	47.000%	Swiss-Prot	中等置信

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