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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G052390
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 13944948-13946345 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1311 bp · TkA07G052390|TK1151|cDNA

ATGCCATCAACCACGCCCTCCCCCACCCCCACAACACGAAAAGAAGCCCAATCCCTCCTCCTCCGCCGCTACGAGATCGGCCATGTTCTCGGCCATGGCAGTTTCGGGAAAGTCTACGTCGCCCGCAACGTCAAAACCAACGAACAGGTCGCCATTAAAGTCATCGACAAAGAGAAAATCATGAAAGGCGGTTTAATCGCTCATATCAAACGCGAAATCTCCATCCTCCGCCGCGTACGACACCCCAACATCGTCCAACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1311 bp · TkA07G052390|TK1151|CDS

ATGCCATCAACCACGCCCTCCCCCACCCCCACAACACGAAAAGAAGCCCAATCCCTCCTCCTCCGCCGCTACGAGATCGGCCATGTTCTCGGCCATGGCAGTTTCGGGAAAGTCTACGTCGCCCGCAACGTCAAAACCAACGAACAGGTCGCCATTAAAGTCATCGACAAAGAGAAAATCATGAAAGGCGGTTTAATCGCTCATATCAAACGCGAAATCTCCATCCTCCGCCGCGTACGACACCCCAACATCGTCCAACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

436 aa · TkA07G052390|TK1151|PROTEIN

MPSTTPSPTPTTRKEAQSLLLRRYEIGHVLGHGSFGKVYVARNVKTNEQVAIKVIDKEKIMKGGLIAHIKREISILRRVRHPNIVQLFEGVNCLEKSRKQLISAVGFCHSRGVFHRDLKPENILLDDNGDLKVSDFGLSAISEQICGDGLFYTFCGTPAYVAPEVLGRKGYDAGKVDIWSCGVILFVLMAGYLPFRDQNIMVMYKKIYKGEFRRPRWFTPELTRLLKRLLDTNPETRITISEIMEDKWFKKGFKHTKFYF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G052390
TK1151 IDTkA07G052390
OH-1004 IDLXL04_027352
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)92.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G052390
位置Chr07:13944948-13946345 (-)
描述Similar to CIPK12: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g18700 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
At5g45810 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
At1g29230 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0514200 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os01g0759400 参与干旱胁迫耐受性。
Characterization of stress-responsive CIPK genes in rice for stress tolerance improvement.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.101295
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027352 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程
GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0061891 calcium ion sensor activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G29230
ath:AT4G18700
ath:AT5G45810
dosa:Os01g0759400
dosa:Os05g0514200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.530
排名 1 · TkA07G052390 · TK1151
细胞核0.442
排名 2 · TkA07G052390 · TK1151
细胞膜0.141
排名 3 · TkA07G052390 · TK1151
内质网0.050
排名 4 · TkA07G052390 · TK1151
溶酶体／液泡0.039
排名 5 · TkA07G052390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase24-89 aa
PF14531Kinase-like25-58 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr26-90 aa
PF03109ABC130-57 aa
PF12330Haspin_kinase31-91 aa
PF18218Spa1_C34-54 aa
PF01633Choline_kinase83-140 aa
PF00069Pkinase97-249 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G052390PF00069Pkinase24892.4e-60204.9
TkA07G052390PF14531Kinase-like25581.6e-0628.4
TkA07G052390PF07714PK_Tyr_Ser-Thr26904.7e-2898.9
TkA07G052390PF03109ABC130572.1e-0524.6
TkA07G052390PF12330Haspin_kinase31910.03913.7
TkA07G052390PF18218Spa1_C34540.710.9
TkA07G052390PF01633Choline_kinase831400.2511.3
TkA07G052390PF00069Pkinase972492.4e-60204.9
TkA07G052390PF07714PK_Tyr_Ser-Thr992454.7e-2898.9
TkA07G052390PF06293Kdo991290.1811.9
TkA07G052390PF14531Kinase-like1002371.6e-0628.4
TkA07G052390PF03109ABC11101402.1e-0524.6
TkA07G052390PF01636APH1111300.1712.3
TkA07G052390PF12330Haspin_kinase1151430.03913.7
TkA07G052390PF18218Spa1_C2292790.710.9
TkA07G052390PF06293Kdo2422420.1811.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SN43拟南芥sp|Q9SN43|CIPKC_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1268.200%Swiss-Prot高置信
Q9FJ55拟南芥sp|Q9FJ55|CIPKJ_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1963.000%Swiss-Prot高置信
Q9LP51拟南芥sp|Q9LP51|CIPKI_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1862.300%Swiss-Prot高置信
Q68Y49水稻sp|Q68Y49|CIPKJ_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 1956.400%Swiss-Prot高置信
Q5JLS2水稻sp|Q5JLS2|CIPKC_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 1256.400%Swiss-Prot高置信

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