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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G045090
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 12020262-12021350 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1089 bp · TkA07G045090|TK1151|cDNA

ATGGAAGACAGACTCACTAACTTACCCGAAGATCTAAAGCTTTGTATTCTCTCTTCTCTTGACACAAAACACGCGGTCCTAACATCGACCCTATCAAAATCATGGCTTCCTTTATGGACTCGAATCCCTGTTCTAGAATTCAACTACTTTGCTTTCCGTCAACTCCCAGGTTTCCAAGATTTCGTCAAGCAACTGTTGTGTCTTCGCGATCAAACCGCCAAGTTACAAAGATTAAGCCTCACCGGAATCGGAACGTGCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1089 bp · TkA07G045090|TK1151|CDS

ATGGAAGACAGACTCACTAACTTACCCGAAGATCTAAAGCTTTGTATTCTCTCTTCTCTTGACACAAAACACGCGGTCCTAACATCGACCCTATCAAAATCATGGCTTCCTTTATGGACTCGAATCCCTGTTCTAGAATTCAACTACTTTGCTTTCCGTCAACTCCCAGGTTTCCAAGATTTCGTCAAGCAACTGTTGTGTCTTCGCGATCAAACCGCCAAGTTACAAAGATTAAGCCTCACCGGAATCGGAACGTGCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

362 aa · TkA07G045090|TK1151|PROTEIN

MEDRLTNLPEDLKLCILSSLDTKHAVLTSTLSKSWLPLWTRIPVLEFNYFAFRQLPGFQDFVKQLLCLRDQTAKLQRLSLTGIGTCDVKFIKNFLDYAFNHSVEELEVKICQICKYHSWPVYLNTFCDSLKSLKLQSVIEMSCPFLGAISRFKNLRVLYLQRALITNLEPFLGFPVLEKLTLANCDINTMGKTLSVHGPNLSYLKISDCRSFNCCELTTPNLRFFVYHGSDFPQLRAYGLGLPVLDTISLDFHPDGDMKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G045090
TK1151 IDTkA07G045090
OH-1004 IDLXL04_027297
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 95.263
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G045090
位置Chr07:12020262-12021350 (+)
描述Similar to At5g53840: F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g53840
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g55660 F-盒/LRR 重复蛋白 At1g55660。 暂无已核实直接文献
At3g58940 F-box/LRR重复蛋白 At3g58940。 暂无已核实直接文献
At4g10400 与FBD相关的F-box蛋白At4g10400。 暂无已核实直接文献
At5g56420 F-box/FBD/LRR 重复蛋白 At5g56420。 暂无已核实直接文献
At3g49030 推定F-box/FBD/LRR重复蛋白At3g49030。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027297 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G04230
ath:AT3G26922
ath:AT3G51530
ath:AT5G22700
ath:AT5G53840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.821
排名 1 · TkA07G045090 · TK1151
细胞质0.226
排名 2 · TkA07G045090 · TK1151
内质网0.037
排名 3 · TkA07G045090 · TK1151
细胞膜0.036
排名 4 · TkA07G045090 · TK1151
质体0.017
排名 5 · TkA07G045090 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00646F-box5-42 aa
PF12937F-box-like6-35 aa
PF23622LRR_At1g61320_AtMIF173-235 aa
PF12799LRR_474-82 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL21101-161 aa
PF12799LRR_4129-171 aa
PF13855LRR_8129-135 aa
PF25019LRR_R13L1-DRL21129-185 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G045090PF00646F-box5421.3e-0525.6
TkA07G045090PF12937F-box-like6350.06813.7
TkA07G045090PF23622LRR_At1g61320_AtMIF1732353.3e-1040.6
TkA07G045090PF12799LRR_474820.0001322.8
TkA07G045090PF25019LRR_R13L1-DRL211011610.04614.3
TkA07G045090PF12799LRR_41291710.0001322.8
TkA07G045090PF13855LRR_81291350.001718.8
TkA07G045090PF25019LRR_R13L1-DRL211291850.04614.3
TkA07G045090PF24758LRR_At5g563701442320.0004620.6
TkA07G045090PF12799LRR_41531880.0001322.8
TkA07G045090PF13855LRR_81542090.001718.8
TkA07G045090PF25019LRR_R13L1-DRL211752150.04614.3
TkA07G045090PF12799LRR_41772090.0001322.8
TkA07G045090PF25019LRR_R13L1-DRL212452850.04614.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q1PFK0拟南芥sp|Q1PFK0|FBL32_ARATH F-box/LRR-repeat protein At1g5566028.400%Swiss-Prot低置信
Q9LXQ8拟南芥sp|Q9LXQ8|FBL60_ARATH F-box/LRR-repeat protein At3g5894029.200%Swiss-Prot低置信
Q9SV82拟南芥sp|Q9SV82|FBD40_ARATH FBD-associated F-box protein At4g1040028.000%Swiss-Prot低置信
Q9FM89拟南芥sp|Q9FM89|FDL38_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g5642028.500%Swiss-Prot低置信
Q9SMU0拟南芥sp|Q9SMU0|FDL18_ARATH Putative F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g4903029.600%Swiss-Prot低置信

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