TkA07G036990 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G036990

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 9847521-9850800 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2345 bp · TkA07G036990|TK1151|cDNA

GATCTTTCCGGTTTCTAAAAAGTTAAACTGCAGAAGTGTCTTTAAAACCCAAAAAGGTATGATTACTAGAAGATCTCTTCTTGCAAACCTTTTATGCATGACATGCCTGATTATTTCATTACAACACTACAAGGCCACTGATATACTGACTAAAGATAGTCCAATGTCATTACAACAGACTCTAGTCTCTTCCAATCAAATCTTTGAGCTAGGCTTCTTCACTCCAGGTAATTCCACTAACCGATTTCTGGGTATATGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1290 bp · TkA07G036990|TK1151|CDS

ATGAGACTTGGGACAAATGGGAAAACGCAAGGGAATAAAAACTTATTGACATCATGGAAAAGTGATAATGATCCAACAACTGGAGATTTTGTTGTTGGCCTTTCAGAAGAACAACCACCACAAGCTTTCACAAGGCGTGGTTCAAAACCGTATTGGAGAGGCGGGCCATGGGATGGAGGGAAGTTTATAGGTATACCAGAGCAAGAGAGTGGGTACTCGAGTCTCATGACTCTCATGCCTGGAAACTCACAAGGTGGAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

429 aa · TkA07G036990|TK1151|PROTEIN

MRLGTNGKTQGNKNLLTSWKSDNDPTTGDFVVGLSEEQPPQAFTRRGSKPYWRGGPWDGGKFIGIPEQESGYSSLMTLMPGNSQGGAYLTINVESSSNVRWLFLRHDGVLELKYMGDVRNNLNFSWEAPSNPCDFYGVCGVFSTCTNKTRICECLQGFVPRSNDEWSKGNWTRGCVRGTELLCEKNESSTLASRTIKPDKFEVVRGIKLPDNYQYFLYMDSDECREWCLVQCSCKAYAFVEGINCIVWEQDLIDIQQFSF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G036990`
TK1151 ID	TkA07G036990
OH-1004 ID	LXL04_027170
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	68.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.436 / OH-1004 68.151 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G036990

位置 Chr07:9847521-9850800 (-)

描述 Similar to At1g61550: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61550

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g61370`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61370。	暂无已核实直接文献
`At1g61480`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61480。	暂无已核实直接文献
`At1g61390`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61390。	暂无已核实直接文献
`At1g61550`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g61550。	暂无已核实直接文献
`At1g61420`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g61420。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027170 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006955 immune response 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0048544 recognition of pollen 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G61370

ath:AT1G61390

ath:AT1G61440

ath:AT1G61480

ath:AT1G61550

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.778

排名 1 · TkA07G036990 · TK1151

内质网0.090

排名 2 · TkA07G036990 · TK1151

细胞质0.065

排名 3 · TkA07G036990 · TK1151

细胞外0.063

排名 4 · TkA07G036990 · TK1151

溶酶体／液泡0.034

排名 5 · TkA07G036990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00954S_locus_glycop52-161 aa

PF01683EB128-162 aa

PF28413At5g65660_helical138-153 aa

PF08276PAN_2198-255 aa

PF01683EB228-236 aa

PF14610Psg1273-309 aa

PF28413At5g65660_helical293-310 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr362-426 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G036990	`PF00954`	S_locus_glycop	52	161	1.1e-21	78.1
TkA07G036990	`PF01683`	EB	128	162	0.074	13.9
TkA07G036990	`PF28413`	At5g65660_helical	138	153	0.67	10.4
TkA07G036990	`PF08276`	PAN_2	198	255	8.9e-16	58.5
TkA07G036990	`PF01683`	EB	228	236	0.074	13.9
TkA07G036990	`PF14610`	Psg1	273	309	0.094	13.2
TkA07G036990	`PF28413`	At5g65660_helical	293	310	0.67	10.4
TkA07G036990	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	362	426	3.4e-08	33.8
TkA07G036990	`PF00069`	Pkinase	362	426	6e-08	33.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O64783`	拟南芥	sp\|O64783\|Y1137_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61370	42.100%	Swiss-Prot	中等置信
`O64771`	拟南芥	sp\|O64771\|Y1148_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61480	42.300%	Swiss-Prot	中等置信
`O64781`	拟南芥	sp\|O64781\|Y1639_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61390	40.900%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SY95`	拟南芥	sp\|Q9SY95\|Y1155_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61550	40.600%	Swiss-Prot	中等置信
`O64778`	拟南芥	sp\|O64778\|Y1142_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g61420	39.400%	Swiss-Prot	中等置信

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