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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G036310
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 9679504-9685225 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2841 bp · TkA07G036310|TK1151|cDNA

ATAATGGTCAACTAACACTTCATTCATTATTCTTTTTCTACCAATAAATTCTTTGAATGATAGAGAGCCAATATCACATTAACAATTGACAAGAACAAAATCAACAAAATCCCAAAAACCCGAATCAATGAACCAAATATAGATTGGGGGAATCACACTTCTCTCTCAAAAATGAAAAACCTCCATTATCGTGCCACGATTATATTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCCCTTTTATCTCTCTAGCCGTTGATACCATCACACC...

CDS

下载 CDS FASTA

2550 bp · TkA07G036310|TK1151|CDS

ATGAAAAACCTCCATTATCGTGCCACGATTATATTCTCTCTCTTCTTCTTCTTCCCTTTTATCTCTCTAGCCGTTGATACCATCACACCCACAAAACCCCTCACCGTTAATCAAACTCTAGTGTCTGATGATGAAGTTTTTGAGATGGGTTTCTTTGATCCAGGCAACAATAATTTATATTTCGGCATTTGGTACAAGCAAATTGAACCCAAAACGATTGTTTGGGTGGCTAATAGAGACAACCCCATTACTTCATCTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

849 aa · TkA07G036310|TK1151|PROTEIN

MKNLHYRATIIFSLFFFFPFISLAVDTITPTKPLTVNQTLVSDDEVFEMGFFDPGNNNLYFGIWYKQIEPKTIVWVANRDNPITSSSGMLTIGDDRNIVVLNEAEIPVWSSNQSVPMVNTVAQLLDNGNFVLRAENDDNPDNYIWQSFDNPTDTLLPEMKLGWNRSTGQNRFLQSWKTSTDPGSGDYTFKMDTDGFPEIVISRRGVETYRSGPWNGRRFSGVPEMKSAVVINFFFKYNSDEITYSFDMMNSSIYSRLIMG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G036310
TK1151 IDTkA07G036310
OH-1004 IDLXL04_027165
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 95.501
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G036310
位置Chr07:9679504-9685225 (-)
描述Similar to SD18: Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21380 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At1g65800 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
At1g65790 参与细胞扩张和分化的调节。 暂无已核实直接文献
UniProt: P0DH86 自交不亲和性的雌性特异性决定因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027165 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0048544 recognition of pollen 生物过程
GO:0060320 rejection of self pollen 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65790
ath:AT1G65800
ath:AT4G21380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.865
排名 1 · TkA07G036310 · TK1151
内质网0.078
排名 2 · TkA07G036310 · TK1151
细胞质0.071
排名 3 · TkA07G036310 · TK1151
细胞核0.036
排名 4 · TkA07G036310 · TK1151
溶酶体／液泡0.025
排名 5 · TkA07G036310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19442CRIM1_C28-44 aa
PF11883DUF340333-39 aa
PF01453B_lectin72-177 aa
PF00954S_locus_glycop209-317 aa
PF08276PAN_2298-312 aa
PF08276PAN_2339-404 aa
PF01708Gemini_mov423-467 aa
PF15872SRTM1429-479 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G036310PF19442CRIM1_C28440.07913.7
TkA07G036310PF11883DUF340333398.5e-1452.1
TkA07G036310PF01453B_lectin721779.9e-39132.7
TkA07G036310PF00954S_locus_glycop2093176.2e-36124.0
TkA07G036310PF08276PAN_22983121.4e-2383.5
TkA07G036310PF08276PAN_23394041.4e-2383.5
TkA07G036310PF01708Gemini_mov4234670.2511.9
TkA07G036310PF15872SRTM14294790.08913.7
TkA07G036310PF02009RIFIN4314710.001119.7
TkA07G036310PF16101PRIMA14314770.07313.6
TkA07G036310PF19442CRIM1_C4344720.07913.7
TkA07G036310PF21314TM_ErbB14474710.0613.8
TkA07G036310PF12398DUF36604865211.8e-0835.0
TkA07G036310PF00069Pkinase5327349.6e-46157.0
TkA07G036310PF07714PK_Tyr_Ser-Thr5357991.9e-49169.0
TkA07G036310PF03109ABC15375620.0009819.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81905拟南芥sp|O81905|SD18_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-855.600%Swiss-Prot高置信
Q9S972拟南芥sp|Q9S972|SD16_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-652.600%Swiss-Prot高置信
Q39086拟南芥sp|Q39086|SD17_ARATH Receptor-like serine/threonine-protein kinase SD1-751.800%Swiss-Prot高置信
P0DH86拟南芥sp|P0DH86|SRK_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SRK50.600%Swiss-Prot高置信

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