RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G035370
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 9410279-9412402 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1217 bp · TkA07G035370|TK1151|cDNA

AGAATAATCAAGCTGTTGATGATAGTAAGCTTACCAAAATCGGCATTGGTTGGATGATGGCTTCAACTACTGCAAATGGCGGCACTCAAAAAGATGTTACTGTCGATTGGGAAATCGTTGAATTTACAAAGGAAGAGGAAGTGGTCGATGTGGAATTCAATGATAAGTTTGAAGGGAAAACGTTTAAAGATCTTGTTAACGAAAATGATCTATTGCATATAATGCTGGATTCTTCAGAAAGAAATCGTAAGGAAGCAGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

909 bp · TkA07G035370|TK1151|CDS

ATGATGGCTTCAACTACTGCAAATGGCGGCACTCAAAAAGATGTTACTGTCGATTGGGAAATCGTTGAATTTACAAAGGAAGAGGAAGTGGTCGATGTGGAATTCAATGATAAGTTTGAAGGGAAAACGTTTAAAGATCTTGTTAACGAAAATGATCTATTGCATATAATGCTGGATTCTTCAGAAAGAAATCGTAAGGAAGCAGAGTCTACAATGAAACTTAAAGAAGAAGATTTGAAATCAACAATCTCCAAATTGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

302 aa · TkA07G035370|TK1151|PROTEIN

MMASTTANGGTQKDVTVDWEIVEFTKEEEVVDVEFNDKFEGKTFKDLVNENDLLHIMLDSSERNRKEAESTMKLKEEDLKSTISKLENNISSLKQSLAIEESQKLDAIDQLKKQKEANTTLKKDQDSLKEELQDVKQYSLTAYEKVKEHEDTYKRWQEYNKSLQQYNTKLQNEIKTTTDANKHVEKEKATLLENHTTLKKLLEDEVKEKATSVKEVQVLRGELQRVNEDRELLVSLIKDLNAEVIRYKESTGRTAAEYAN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G035370
TK1151 IDTkA07G035370
OH-1004 IDLXL04_027147
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 90.964
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G035370
位置Chr07:9410279-9412402 (-)
描述Similar to KIN14C: Kinesin-like protein KIN-14C
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21270 驱动蛋白，以 ATP 依赖性方式支持微管运动，并具有负端定向极性。
The Arabidopsis ATK1 gene is required for spindle morphogenesis in male meiosis.2002 · DOI: 10.1242/dev.129.10.2401
Arabidopsis thaliana protein, ATK1, is a minus-end directed kinesin that exhibits non-processive movement.2002 · DOI: 10.1002/cm.10045

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027147 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0009971 anastral spindle assembly involved in male meiosis 生物过程
GO:0051225 spindle assembly 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0000776 kinetochore 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005872 minus-end kinesin complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G05190
ath:AT4G21270
ath:AT5G54670
dosa:Os04g0629700
dosa:Os07g0105700
osa:4337093
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.675
排名 1 · TkA07G035370 · TK1151
细胞核0.222
排名 2 · TkA07G035370 · TK1151
高尔基体0.064
排名 3 · TkA07G035370 · TK1151
线粒体0.054
排名 4 · TkA07G035370 · TK1151
细胞膜0.054
排名 5 · TkA07G035370 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10874DUF274623-46 aa
PF11559ADIP43-155 aa
PF28422CCDC8945-134 aa
PF27636CCPG1_N46-135 aa
PF14662KASH_CCD50-91 aa
PF23649FKBP1552-163 aa
PF07888CALCOCO153-135 aa
PF24161CCDC3957-201 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G035370PF10874DUF274623462.29.5
TkA07G035370PF11559ADIP431551.69.5
TkA07G035370PF28422CCDC89451341.58.8
TkA07G035370PF27636CCPG1_N461357.47.8
TkA07G035370PF14662KASH_CCD50917.67.2
TkA07G035370PF23649FKBP15521632.78.2
TkA07G035370PF07888CALCOCO1531352.17.9
TkA07G035370PF24161CCDC39572016.3e-0521.8
TkA07G035370PF08614ATG16621932.19.2
TkA07G035370PF28159CEP89642500.310.2
TkA07G035370PF10874DUF274665962.29.5
TkA07G035370PF08702Fib_alpha661150.2112.5
TkA07G035370PF06818Fez1661850.611.3
TkA07G035370PF19220Rod_CreS701880.05213.4
TkA07G035370PF20369DUF666470840.05614.7
TkA07G035370PF25539Bestrophin_270926.27.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q07970拟南芥sp|Q07970|KN14C_ARATH Kinesin-like protein KIN-14C34.500%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看