TkA07G015180 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G015180

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 4126597-4127616 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

390 bp · TkA07G015180|TK1151|cDNA

ATGAAATCGGAGGGCAGTGCCAGTGGCGGTGAAACTTCTGAAGCGGCGTCGAAGATTGGGATGGTGGCGGCAGTCACGGTAGTAGGAAAGCCGAATAATTATCAGCAACAGTTGATGGTGAATGATTGTGGGAAGAAACATGTTTATATTGGTATGCTGTATATGGATCTTTTTGACACTAAAGTTGAAGCTGTCAGGGCTTATGATAAAGCTACAAACAAATGCAATGGAAACGATGTTGTTACAGATTTTGATTCCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

390 bp · TkA07G015180|TK1151|CDS

ATGAAATCGGAGGGCAGTGCCAGTGGCGGTGAAACTTCTGAAGCGGCGTCGAAGATTGGGATGGTGGCGGCAGTCACGGTAGTAGGAAAGCCGAATAATTATCAGCAACAGTTGATGGTGAATGATTGTGGGAAGAAACATGTTTATATTGGTATGCTGTATATGGATCTTTTTGACACTAAAGTTGAAGCTGTCAGGGCTTATGATAAAGCTACAAACAAATGCAATGGAAACGATGTTGTTACAGATTTTGATTCCGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

129 aa · TkA07G015180|TK1151|PROTEIN

MKSEGSASGGETSEAASKIGMVAAVTVVGKPNNYQQQLMVNDCGKKHVYIGMLYMDLFDTKVEAVRAYDKATNKCNGNDVVTDFDSGHIYPQCIYVHSVHSAYMCTVCTVHIYAFVNMCICTYVFAKRH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G015180`
TK1151 ID	TkA07G015180
OH-1004 ID	LXL04_026882
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G015180

位置 Chr07:4126597-4127616 (-)

描述 Similar to AP2: Floral homeotic protein APETALA 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g36920`	可能的转录激活因子，促进早期花分生组织特性的建立。	暂无已核实直接文献
`At5g67180`	可能充当转录激活因子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8AXC3`	可能的转录因子（通过同源推测）。	暂无已核实直接文献
`Os05g0121600`	可能的转录因子（通过同源推测）。	Coexpression analysis identifies Rice Starch Regulator1, a rice AP2/EREBP family transcription factor, as a novel rice starch biosynthesis regulator.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.159517
`UniProt: B8B0I8`	可能的转录因子（通过同源推测）。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026882 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0009409 response to cold 生物过程

GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009908 flower development 生物过程

GO:0009909 regulation of flower development 生物过程

GO:0010073 meristem maintenance 生物过程

GO:0010093 specification of floral organ identity 生物过程

GO:0010581 regulation of starch biosynthetic process 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0048316 seed development 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G36920

ath:AT5G67180

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.463

排名 1 · TkA07G015180 · TK1151

细胞质0.410

排名 2 · TkA07G015180 · TK1151

细胞外0.087

排名 3 · TkA07G015180 · TK1151

线粒体0.081

排名 4 · TkA07G015180 · TK1151

细胞膜0.061

排名 5 · TkA07G015180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P47927`	拟南芥	sp\|P47927\|AP2_ARATH Floral homeotic protein APETALA 2	66.700%	Swiss-Prot	低置信
`Q9FH95`	拟南芥	sp\|Q9FH95\|TOE3_ARATH AP2-like ethylene-responsive transcription factor TOE3	63.400%	Swiss-Prot	低置信
`B8AXC3`	水稻	sp\|B8AXC3\|AP21_ORYSI APETALA2-like protein 1	57.100%	Swiss-Prot	低置信
`Q2TQ34`	水稻	sp\|Q2TQ34\|AP21_ORYSJ APETALA2-like protein 1	57.100%	Swiss-Prot	低置信
`B8B0I8`	水稻	sp\|B8B0I8\|AP24_ORYSI APETALA2-like protein 4	53.500%	Swiss-Prot	低置信

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