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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G005570
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 1542442-1547154 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1105 bp · TkA07G005570|TK1151|cDNA

GATTTTGAATCAACTCTTGTAAATGGTAATGGTACCGAAACAGTCTACAGGATGTCAAGGCATTATGTTAGGATGAATCAACACATGCCTATGTTGTATGTACAGCTCTACACATATCAGATCTGTCGTTCACTTAACTACATTCATAATGTGATTGGTGTATGCCATCGTGATATCAAGCCACAAAATTTATTGGTTAATCCACAAACTCATCAGCTAAAGCTATGTGATTTTGGGAGTGCAAAGATGCTGGTACCTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1320 bp · TkA07G005570|TK1151|CDS

ATGAATGTGATGCGTCGTTTGAAGAGTATCGCCTCTGGTCGTACTTCTGTTTCGGATACCGGTGGGGATTCCAACAAATCTGGGAGTATGGAGCAGCCTGGAAGTGCTAGATCTGTAAAGATGTCGACCAGCACATCTTTTGCCAGACATGGAAAATCTGACCTTGATAAACTCCCAAAAGAAATGAACGGAATGAAAATTCTGGAAGATAAAACTGATGAAAAGGATTTTGAATCAACTCTTGTAAATGGTAATGGTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

439 aa · TkA07G005570|TK1151|PROTEIN

MNVMRRLKSIASGRTSVSDTGGDSNKSGSMEQPGSARSVKMSTSTSFARHGKSDLDKLPKEMNGMKILEDKTDEKDFESTLVNGNGTETGQIIVTSIGGKNGKPKQTLSYIAERVVGTGSFGVVFQAKCLETGESVAIKKVLQDKRYKNRELQIMRLLQHPNVVPLKNCFYSTTEKNEVYLNVVLEFVPETVYRMSRHYVRMNQHMPMLYVQLYTYQICRSLNYIHNVIGVCHRDIKPQNLLVNPQTHQLKLCDFGSAKM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G005570
TK1151 IDTkA07G005570
OH-1004 IDLXL04_026750
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G005570
位置Chr07:1542442-1547154 (-)
描述Similar to ASK8: Shaggy-related protein kinase theta
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g00720 可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。 暂无已核实直接文献
At5g14640 可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。 暂无已核实直接文献
At5g26751 可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。 暂无已核实直接文献
At3g05840 可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。 暂无已核实直接文献
At1g57870 可能介导细胞外信号以调节分化细胞中的转录。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026750 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006972 hyperosmotic response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016301 kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G00720
ath:AT5G14640
bna:106388722
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.667
排名 1 · TkA07G005570 · TK1151
细胞核0.381
排名 2 · TkA07G005570 · TK1151
细胞膜0.108
排名 3 · TkA07G005570 · TK1151
线粒体0.047
排名 4 · TkA07G005570 · TK1151
高尔基体0.032
排名 5 · TkA07G005570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03109ABC1102-143 aa
PF14531Kinase-like110-153 aa
PF00069Pkinase111-394 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr113-311 aa
PF01636APH149-194 aa
PF05445Pox_ser-thr_kin187-252 aa
PF01633Choline_kinase199-256 aa
PF14531Kinase-like212-284 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G005570PF03109ABC11021437.7e-0626.0
TkA07G005570PF14531Kinase-like1101530.03114.3
TkA07G005570PF00069Pkinase1113941.4e-61208.9
TkA07G005570PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1133112.1e-2383.7
TkA07G005570PF01636APH1491940.2511.8
TkA07G005570PF05445Pox_ser-thr_kin1872520.05613.1
TkA07G005570PF01633Choline_kinase1992560.001818.3
TkA07G005570PF14531Kinase-like2122840.03114.3
TkA07G005570PF03109ABC12222617.7e-0626.0
TkA07G005570PF01636APH2302570.2511.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96287拟南芥sp|Q96287|KSG8_ARATH Shaggy-related protein kinase theta72.600%Swiss-Prot高置信
Q8VZD5拟南芥sp|Q8VZD5|KSG5_ARATH Shaggy-related protein kinase epsilon76.100%Swiss-Prot高置信
P43288拟南芥sp|P43288|KSG1_ARATH Shaggy-related protein kinase alpha82.000%Swiss-Prot高置信
P43289拟南芥sp|P43289|KSG3_ARATH Shaggy-related protein kinase gamma81.700%Swiss-Prot高置信
Q9FVS6拟南芥sp|Q9FVS6|KSG4_ARATH Shaggy-related protein kinase delta79.000%Swiss-Prot高置信

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