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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G465780
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 115247313-115250994 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1492 bp · TkA06G465780|TK1151|cDNA

ATAAAAACGTGATATTTTTGTGATCATCCCATGATTCCCGTAACGTTAAAAGGCCCATCCACTAGATCTATCCCCAAATTAAACTAATCGTATCAAAGTCATCAAAAACCCATCACAGAAATCACCACCGCTTTCTTTCTCTCCCTCCCTCTCCGACTTTGAGGGTTTCTGTAAAATTACTCAAACTCAACAAAACAGAGAGAGAATAAGGGGGAGAGATGGCCGGACAAGAAGATATTCCAGAAGGGACGATTCGTAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1086 bp · TkA06G465780|TK1151|CDS

ATGGCCGGACAAGAAGATATTCCAGAAGGGACGATTCGTAATGTATTGGAGCAAGAGAGTTTGAAGTGGGTATTTGTTGGTGGCAAAGGAGGTGTTGGGAAAACTACGTGCAGCTCTATTCTTTCAATCCTTTTGGCTTCTGTTAGATCGTCGGTTCTTATCATCTCAACTGACCCAGCTCATAATCTAAGCGATGCTTTCCAACAAAGGTTCACGAAATCTCCTACTTTGGTTAATGGTTTCACCAATTTATATGCTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

361 aa · TkA06G465780|TK1151|PROTEIN

MAGQEDIPEGTIRNVLEQESLKWVFVGGKGGVGKTTCSSILSILLASVRSSVLIISTDPAHNLSDAFQQRFTKSPTLVNGFTNLYAMEVDPTVEPEETGSSDGMESFLSDLANSIPGIDEAMSFAEMLKLVQTMDYSVIVFDTAPTGHTLRLLQFPSTLEKGLNKMMTLKSKFGGLLGQMTRMFGVGEEFGEDAILGKLEGMKEVIEQVNRQFKDPDLTTFVCVCIPEFLSLYETERLVQELTKFEIDTHNIIINQVLFG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G465780
TK1151 IDTkA06G465780
OH-1004 IDLXL04_022687
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G465780
位置Chr06:115247313-115250994 (-)
描述Similar to GET3A: ATPase GET3A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g01910 ATP酶，参与尾锚定（TA）蛋白向内质网的翻译后输送。
Loss of GET pathway orthologs in Arabidopsis thaliana causes root hair growth defects and affects SNARE abundance.2017 · DOI: 10.1073/pnas.1619525114

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_022687 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0071816 tail-anchored membrane protein insertion into ER membrane 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0043529 GET complex 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
aag:5574421
ath:AT1G01910
cci:CC1G_08655
cnb:CNBK0900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.603
排名 1 · TkA06G465780 · TK1151
细胞核0.302
排名 2 · TkA06G465780 · TK1151
高尔基体0.180
排名 3 · TkA06G465780 · TK1151
内质网0.147
排名 4 · TkA06G465780 · TK1151
细胞膜0.071
排名 5 · TkA06G465780 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07755DUF161112-69 aa
PF00931NB-ARC13-38 aa
PF25199nSTAND_NTPase514-58 aa
PF06414Zeta_toxin15-58 aa
PF02374ArsA_ATPase22-315 aa
PF01656CbiA24-215 aa
PF13238AAA_1824-67 aa
PF00448SRP5424-58 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G465780PF07755DUF161112690.04813.8
TkA06G465780PF00931NB-ARC13380.01315.8
TkA06G465780PF25199nSTAND_NTPase514580.1512.6
TkA06G465780PF06414Zeta_toxin15580.02914.5
TkA06G465780PF02374ArsA_ATPase223157.9e-104347.9
TkA06G465780PF01656CbiA242152.1e-0938.1
TkA06G465780PF13238AAA_1824670.06814.4
TkA06G465780PF00448SRP5424580.1612.3
TkA06G465780PF13479AAA_24241430.2411.8
TkA06G465780PF00142Fer4_NifH25640.00218.4
TkA06G465780PF10609ParA26580.0005920.1
TkA06G465780PF06564CBP_BcsQ26730.04514.0
TkA06G465780PF13614AAA_31281472.1e-0938.2
TkA06G465780PF00448SRP541211440.1612.3
TkA06G465780PF22734NNH22023020.2211.9
TkA06G465780PF10609ParA2172590.0005920.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q949M9拟南芥sp|Q949M9|GET3A_ARATH ATPase GET3A79.400%Swiss-Prot高置信

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