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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G426830
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 105594893-105604876 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1929 bp · TkA06G426830|TK1151|cDNA

TACTATTTAGACTTTCTTTTCTGGCGTCTTAATTTTTTGGTTGAAGATAGTATGAACGTTGACCTTTTCTGATATTTATATATATGACGCACTTTGTAAACAACTCAACCGCATAACACTTATATCTCCAACAACTCTTTTTGCATTTTCCGGTCACTCCATCATTTTTCCGGCGACTCTTTTTTGTACAGCTCAATCATGCGTCGAGATGGATACGGCAAGCTAGTGGCGGCGCTCTTACTTACCGCAACCACCACCGG...

1524 bp · TkA06G426830|TK1151|CDS

ATGCGTCGAGATGGATACGGCAAGCTAGTGGCGGCGCTCTTACTTACCGCAACCACCACCGGGGCTGTGTACGCCGCCGTCAGACTTCGTCGCCGGAAAAACCTTAATTCGTTGATGCCGGCAAGCGATTCAGGAAGGGTTGAAAAGTTTTCCCGATATGTTGCAAGGCAACTTGGATTCAAAGATGAAACCGAGTGTCCCGAATTAAGCAAATTGGCATGCGATTTTGTGAGAAGCTCAAAAGGGTTTAAAGATGGCAT...

507 aa · TkA06G426830|TK1151|PROTEIN

MRRDGYGKLVAALLLTATTTGAVYAAVRLRRRKNLNSLMPASDSGRVEKFSRYVARQLGFKDETECPELSKLACDFVRSSKGFKDGMYVYFSNEYEVDSLCVKLEEEFERCIIAYFAFNWNKTSFMISQVLSEGSEERKLKNMVLTATRKQRFERATKDLKVRRAFSTIVEEMKVIGTNTPKKGDGNGASPEVEGLFADEDRSPVILFMGGGMGAGKSTVLKEILKEGFWSEAATNAVVVEADAFKETDVIYQALASKGH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G426830
TK1151 IDTkA06G426830
OH-1004 IDLXL04_022930
关系 / 置信度序列支持,注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.606 / OH-1004 28.379
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G426830
位置Chr06:105594893-105604876 (+)
描述Similar to NADKC: Calmodulin calcium-dependent NAD kinase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g04280 可能以钙/钙调蛋白依赖的方式将 NAD⁺ 磷酸化,生成 NADP⁺。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_022930 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006741 NADP+ biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分
GO:0003676 nucleic acid binding 分子功能
GO:0003951 NAD+ kinase activity 分子功能
GO:0004523 RNA-DNA hybrid ribonuclease activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04280
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

线粒体0.350
排名 1 · TkA06G426830 · TK1151
细胞质0.168
排名 2 · TkA06G426830 · TK1151
内质网0.151
排名 3 · TkA06G426830 · TK1151
质体0.134
排名 4 · TkA06G426830 · TK1151
细胞核0.129
排名 5 · TkA06G426830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13238AAA_1867-159 aa
PF21797CycT2-like_C73-126 aa
PF25199nSTAND_NTPase5136-159 aa
PF03215Rad17140-161 aa
PF25199nSTAND_NTPase5198-249 aa
PF06414Zeta_toxin200-321 aa
PF13191AAA_16201-313 aa
PF03215Rad17202-250 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G426830PF13238AAA_18671593.1e-0525.2
TkA06G426830PF21797CycT2-like_C731260.0215.4
TkA06G426830PF25199nSTAND_NTPase51361590.04114.4
TkA06G426830PF03215Rad171401610.09113.4
TkA06G426830PF25199nSTAND_NTPase51982490.04114.4
TkA06G426830PF06414Zeta_toxin2003215.5e-1865.9
TkA06G426830PF13191AAA_162013130.1513.3
TkA06G426830PF03215Rad172022500.09113.4
TkA06G426830PF13671AAA_332073159.2e-0523.5
TkA06G426830PF00091Tubulin2082550.01816.0
TkA06G426830PF13238AAA_182103073.1e-0525.2
TkA06G426830PF06415iPGM_N2232960.1312.4
TkA06G426830PF06414Zeta_toxin3244015.5e-1865.9
TkA06G426830PF26837Phage_T4_Y00H_G4334630.1712.6
TkA06G426830PF23137HVO_07584334580.2412.0
TkA06G426830PF13238AAA_184845043.1e-0525.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WUY1拟南芥sp|Q0WUY1|NADKC_ARATH Calmodulin calcium-dependent NAD kinase57.600%Swiss-Prot高置信

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