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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G414860
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 102664512-102670032 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2025 bp · TkA06G414860|TK1151|cDNA

ATGATGAAGCAAGAGACAGTTGTAGTAATTGTAGGAGCAGGACCTGCAGGAATCGCAACATCTGCGTGTCTCAATCGTCTCTCTATTCCAAATGTCATTTTGGAGAAAGATGACTGTTATGCATCTTTATGGCAAAAGAAAGCTTACGATCGTTTAAAGCTTCACCTAGCTAAAAACTTTTGTGAACTCCCTCACATGCCATTTCCAGTTTCCGCACCCACATTTGTATCAAAATATATGTTTGTTCAATACTTGCATAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2025 bp · TkA06G414860|TK1151|CDS

ATGATGAAGCAAGAGACAGTTGTAGTAATTGTAGGAGCAGGACCTGCAGGAATCGCAACATCTGCGTGTCTCAATCGTCTCTCTATTCCAAATGTCATTTTGGAGAAAGATGACTGTTATGCATCTTTATGGCAAAAGAAAGCTTACGATCGTTTAAAGCTTCACCTAGCTAAAAACTTTTGTGAACTCCCTCACATGCCATTTCCAGTTTCCGCACCCACATTTGTATCAAAATATATGTTTGTTCAATACTTGCATAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

674 aa · TkA06G414860|TK1151|PROTEIN

MMKQETVVVIVGAGPAGIATSACLNRLSIPNVILEKDDCYASLWQKKAYDRLKLHLAKNFCELPHMPFPVSAPTFVSKYMFVQYLHRYVNEFNVDPLYQRSVESAWYNEVAKRWMVTAKNGVSGFVEEYVGEFLVVATGENSEGSIPSVYGLDSFTGSVIHSSEYQNGKKFGNKNVLVVGAGNSGMEIAYDLSNWGAQTSIVVRSPVHVLTKELVQLGMYLLKYLSCTFVDKIVLMFSKLLYGDLCKYGIQRPRKGPFCL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G414860
TK1151 IDTkA06G414860
OH-1004 IDLXL04_035576
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 54.006 / OH-1004 95.538
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G414860
位置Chr06:102664512-102670032 (+)
描述Similar to YUC11: Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g48910 参与生长素生物合成。
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009
At1g21430 参与生长素生物合成。
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009
At5g43890 参与生长素生物合成。
Interaction of auxin and ERECTA in elaborating Arabidopsis inflorescence architecture revealed by the activation tagging of a new member of the YUCCA family putative flavin monooxygenases.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.063495
At1g04180 参与生长素生物合成。 暂无已核实直接文献
At5g11320 参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
Auxin synthesized by the YUCCA flavin monooxygenases is essential for embryogenesis and leaf formation in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053009

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035576 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009635 response to herbicide 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009819 drought recovery 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04180
ath:AT1G21430
ath:AT1G48910
ath:AT5G11320
ath:AT5G25620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.418
排名 1 · TkA06G414860 · TK1151
过氧化物酶体0.161
排名 2 · TkA06G414860 · TK1151
细胞核0.160
排名 3 · TkA06G414860 · TK1151
内质网0.136
排名 4 · TkA06G414860 · TK1151
质体0.101
排名 5 · TkA06G414860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03949Malic_M4-29 aa
PF01494FAD_binding_35-38 aa
PF01946Thi45-36 aa
PF01488Shikimate_DH6-19 aa
PF00899ThiF6-27 aa
PF028262-Hacid_dh_C6-29 aa
PF00743FMO-like8-316 aa
PF07992Pyr_redox_28-207 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G414860PF03949Malic_M4290.1611.9
TkA06G414860PF01494FAD_binding_35387.2e-0729.5
TkA06G414860PF01946Thi45360.0001322.0
TkA06G414860PF01488Shikimate_DH6190.04614.5
TkA06G414860PF00899ThiF6270.1911.6
TkA06G414860PF028262-Hacid_dh_C6290.2511.4
TkA06G414860PF00743FMO-like83161.2e-2177.5
TkA06G414860PF07992Pyr_redox_282076.2e-1452.8
TkA06G414860PF13434Lys_Orn_oxgnase8286.5e-1142.7
TkA06G414860PF00070Pyr_redox8342.5e-0731.8
TkA06G414860PF01134GIDA8340.000320.7
TkA06G414860PF01266DAO8380.001718.6
TkA06G414860PF03486HI0933_like8360.003817.5
TkA06G414860PF00890FAD_binding_28350.04413.7
TkA06G414860PF12831FAD_oxidored8340.3211.0
TkA06G414860PF13738Pyr_redox_392065.7e-2382.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FVQ0拟南芥sp|Q9FVQ0|YUC10_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1056.000%Swiss-Prot中等置信
Q9LPL3拟南芥sp|Q9LPL3|YUC11_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA1154.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LKC0拟南芥sp|Q9LKC0|YUC5_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA546.100%Swiss-Prot中等置信
O64489拟南芥sp|O64489|YUC9_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA946.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LFM5拟南芥sp|Q9LFM5|YUC4_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA446.600%Swiss-Prot中等置信

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