TkA06G392740 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G392740

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 97358486-97365198 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

4263 bp · TkA06G392740|TK1151|cDNA

CCAGTCTCCCTACTCTTTTAATCTTTTGATTTTGAAAAATCCTCTCTTCCCCGTCATTCAATCAGCCGACCCCAAAGAATCCTAAGCCGGCGATCATTCAACCCTCGTTCCGGCACTCACCACCGTCATCCGCCGTCTCACGCTCCGTACGCGTAGGTCAAGCGACAAAGAGAAGAGGTCAAATTAGAGTTCGTCTTACTTATTTAAGTTTCTAGAGAGTGAGAAAACCTAAATCGAAATTTCTCAGAGGGAAAGATAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2991 bp · TkA06G392740|TK1151|CDS

ATGGATGTGGATTCGTCAATGGCGTCGTCGTTGGAAGTTGATCACACTAGCAGCGATAACCTTGATACTAATGGGCCTGCATCTGAGGAGCAGCTAGATGAGTCTCCCGCTGCGGCTGGGGAGGAGTCTCCGGCTTCCTCGGCTCAGCCGCTTCAGTCTCAAGTTCAGCCAACAAGTAGCAGTCCGGTGGGTGGACCCAGACATGCGCCTAATTATTCTGTGGTGAATGCTATTTTAGAGAAGAAGGAAGATGGTCCTGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

996 aa · TkA06G392740|TK1151|PROTEIN

MDVDSSMASSLEVDHTSSDNLDTNGPASEEQLDESPAAAGEESPASSAQPLQSQVQPTSSSPVGGPRHAPNYSVVNAILEKKEDGPGPRCGHTLTAVAAVGEEGTPNYMGPRLILFGGATALEGNSANAGTPTSAGGAGIRLSGATADVHCYDVLTNKWSRITPFGEPPTPRAAHVATAVGTMVVIQGGIGPAGLSAEDLHVLDLTQQRPRWHRVVVQGPGPGPRYGHVMALVGQRYLMAIGGNDGKRPLADVWALDTAA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G392740`
TK1151 ID	TkA06G392740
OH-1004 ID	LXL04_023148
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G392740

位置 Chr06:97358486-97365198 (+)

描述 Similar to BSL3: Serine/threonine-protein phosphatase BSL3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g27210`	参与伸长过程的磷酸酶，可能通过作为油菜素内酯信号调控因子。	暂无已核实直接文献
`At1g08420`	参与伸长过程的磷酸酶，可能通过作为油菜素内酯信号调控因子。	暂无已核实直接文献
`At4g03080`	参与伸长过程的磷酸酶，可能通过作为油菜素内酯信号调控因子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os12g0617900`	丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶BSL2同源物。	暂无已核实直接文献
`Os05g0144400`	丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶BSL1同源物。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023148 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004722 protein serine/threonine phosphatase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G08420

ath:AT2G27210

ath:AT4G03080

dosa:Os05g0144400

dosa:Os12g0617900

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.602

排名 1 · TkA06G392740 · TK1151

细胞核0.319

排名 2 · TkA06G392740 · TK1151

细胞膜0.199

排名 3 · TkA06G392740 · TK1151

溶酶体／液泡0.065

排名 4 · TkA06G392740 · TK1151

高尔基体0.062

排名 5 · TkA06G392740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13854Kelch_HCF80-99 aa

PF24681Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC781-295 aa

PF13415Beta-prop_FBX4282-259 aa

PF07646Kelch_2112-164 aa

PF13964Beta-prop_Calicin138-245 aa

PF13854Kelch_HCF144-422 aa

PF01344Kelch_1145-165 aa

PF13418Beta-prop_TYW4145-191 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G392740	`PF13854`	Kelch_HCF	80	99	7.9e-12	45.8
TkA06G392740	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	81	295	2.7e-47	161.6
TkA06G392740	`PF13415`	Beta-prop_FBX42	82	259	2e-37	129.5
TkA06G392740	`PF07646`	Kelch_2	112	164	3.8e-17	62.0
TkA06G392740	`PF13964`	Beta-prop_Calicin	138	245	0.11	12.3
TkA06G392740	`PF13854`	Kelch_HCF	144	422	7.9e-12	45.8
TkA06G392740	`PF01344`	Kelch_1	145	165	9e-18	64.2
TkA06G392740	`PF13418`	Beta-prop_TYW4	145	191	1.9e-08	35.2
TkA06G392740	`PF01344`	Kelch_1	171	204	9e-18	64.2
TkA06G392740	`PF07646`	Kelch_2	171	192	3.8e-17	62.0
TkA06G392740	`PF24981`	Beta-prop_ATRN-LZTR1	199	287	2e-19	70.7
TkA06G392740	`PF13418`	Beta-prop_TYW4	222	268	1.9e-08	35.2
TkA06G392740	`PF07646`	Kelch_2	224	258	3.8e-17	62.0
TkA06G392740	`PF01344`	Kelch_1	233	258	9e-18	64.2
TkA06G392740	`PF13415`	Beta-prop_FBX42	249	385	2e-37	129.5
TkA06G392740	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	264	386	2.7e-47	161.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SHS7`	拟南芥	sp\|Q9SHS7\|BSL3_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL3	91.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SJF0`	拟南芥	sp\|Q9SJF0\|BSL2_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL2	89.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q8L7U5`	拟南芥	sp\|Q8L7U5\|BSL1_ARATH Serine/threonine-protein phosphatase BSL1	61.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q2QM47`	水稻	sp\|Q2QM47\|BSL2_ORYSJ Serine/threonine-protein phosphatase BSL2 homolog	86.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q60EX6`	水稻	sp\|Q60EX6\|BSL1_ORYSJ Serine/threonine-protein phosphatase BSL1 homolog	62.100%	Swiss-Prot	高置信

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