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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G391500
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 97062616-97065966 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1877 bp · TkA06G391500|TK1151|cDNA

ATTTACTCCACATTCTGATTCTTCTGATCACACCCTTCGGTTTCCTTTTTTAAATCGAAATAAATTACGCAGTCTTACGCTTCAATTTTGCTTCTGGTGTTATTGTTGATTCTTTGATTTTTCTCCGCAATTCATAATAATTCGCCAAGGATGTTTCCTGGGATGATGGATCCGGAGATGATCAGACTCGCTCAAGAACAGATGAGTCGTATGTCACCCGCAGACTTATCCAGAATCCAGCAACAGATGATGTCTAATCC...

1650 bp · TkA06G391500|TK1151|CDS

ATGTTTCCTGGGATGATGGATCCGGAGATGATCAGACTCGCTCAAGAACAGATGAGTCGTATGTCACCCGCAGACTTATCCAGAATCCAGCAACAGATGATGTCTAATCCAGAGTTGATGAAGATGGCATCTGACAGCATGAAAAACATGAAGCCTGAAGACTTGAGACGTGCAGCAGAACAGTTGAAGTCTACTCAGCCAGATGAGATGGCTGAGATTGGTGCCAAGATGGCAAATGCAACACCTAATGAGTTTGCCTC...

549 aa · TkA06G391500|TK1151|PROTEIN

MFPGMMDPEMIRLAQEQMSRMSPADLSRIQQQMMSNPELMKMASDSMKNMKPEDLRRAAEQLKSTQPDEMAEIGAKMANATPNEFASMQSRVDAQINYQINAAQMLKQKGNELHSQGRFTDALENYTRAKNNLKSIPSSKGGTLLLACSLNLMSCYLKTNQYDECINEGIEVLTTDARNVKALYRRGQAYKNLGQLENAVSDLTKALEFSPDDETIADVLRDAKEKLIEHGGNDATRGIKIEEITDEDPTPLSETLSSES...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G391500
TK1151 IDTkA06G391500
OH-1004 IDLXL04_036743
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)33.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 24.772 / OH-1004 24.825
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G391500
位置Chr06:97062616-97065966 (+)
描述Similar to FKBP62: Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP62
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g21990 在蛋白质输入内质网 中发挥作用。
At3g21640 PPI酶加速蛋白质折叠(通过相似性)。
At3g25230 PPIases 加速蛋白质折叠。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_036743 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0031111 negative regulation of microtubule polymerization or depolymerization 生物过程
GO:0070370 cellular heat acclimation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G25230
ath:AT5G48570
bta:508535
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.567
排名 1 · TkA06G391500 · TK1151
细胞质0.276
排名 2 · TkA06G391500 · TK1151
线粒体0.205
排名 3 · TkA06G391500 · TK1151
细胞核0.120
排名 4 · TkA06G391500 · TK1151
内质网0.077
排名 5 · TkA06G391500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04216FdhE_N8-82 aa
PF04963Sigma54_CBD12-69 aa
PF03710GlnE27-65 aa
PF13325MCRS_N33-123 aa
PF25058ARM_TT2146-80 aa
PF13371TPR_953-72 aa
PF09976TPR_2156-134 aa
PF29407CFAP70_TPR_C67-213 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G391500PF04216FdhE_N8820.7210.8
TkA06G391500PF04963Sigma54_CBD12690.05613.9
TkA06G391500PF03710GlnE27650.00517.0
TkA06G391500PF13325MCRS_N331230.6410.6
TkA06G391500PF25058ARM_TT2146800.08213.6
TkA06G391500PF13371TPR_953726.3e-0523.6
TkA06G391500PF09976TPR_21561342.48.6
TkA06G391500PF29407CFAP70_TPR_C672130.001319.0
TkA06G391500PF26337Gtf3_C681050.810.4
TkA06G391500PF18849baeRF_family7781860.006617.3
TkA06G391500PF25058ARM_TT21941650.08213.6
TkA06G391500PF13424TPR_121031640.0001322.8
TkA06G391500PF00515TPR_11041292.6e-1556.2
TkA06G391500PF07719TPR_21061294.9e-1142.6
TkA06G391500PF13428TPR_141061290.0001422.9
TkA06G391500PF13181TPR_81081295.9e-1039.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
B7ZWR6拟南芥sp|B7ZWR6|OEP61_ARATH Outer envelope protein 6150.500%Swiss-Prot高置信
Q9LDC0拟南芥sp|Q9LDC0|FKB42_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4234.300%Swiss-Prot低置信
Q38931拟南芥sp|Q38931|FKB62_ARATH Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP6239.100%Swiss-Prot低置信

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