TkA06G386730 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G386730

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 95678864-95685517 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2765 bp · TkA06G386730|TK1151|cDNA

TTTGAAGTTCGTTTCCGCTTATCGCCCCGCTTAACCTCCTGTACGACTACGTCATCGATCGACACCCCAAATCGGAAAATTTTGTCAAACAACAAAAGCCCTAATCGTCAAAACTCACTCCCTCCCAAAAATCCCAAGTCAGCGTAACCTTCGATCCTTGTCAGAAACGCTTCCATTCTGGCATGAGATCTCGTTAACGCACCATTTGCAGTTGTTTCTGTTCATTTGTTTCTGTTCATCAATTTGGGTTTAGTTTCTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2073 bp · TkA06G386730|TK1151|CDS

ATGTCAGAGGACGTGCTTCTACACCTGGCCTCAAACTCCTCTAATCAATCCGATCAATCTCTGCCATCAAAAATTGCAAAACTCGAAGCCAGAATGGTGGGTAAAACCTCCACTGCGGTGGTGTCTACTCTTCAGCTTCCATCTGCCCAAGCCACAGCAACCCGGTCCTCCATTTCTGCTTCTTCAGCTTCCAAGTTTGGAGCTAATGCTGCTGGTGAGATTTGTGCTGAATCCTTCGACTCTAGCGATTCGGAAGAGGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

690 aa · TkA06G386730|TK1151|PROTEIN

MSEDVLLHLASNSSNQSDQSLPSKIAKLEARMVGKTSTAVVSTLQLPSAQATATRSSISASSASKFGANAAGEICAESFDSSDSEEDDSNGREFLIQANFQKRRKLVDDADSNSAEQNKVAVDVRQENVETLEPKSGTNVNKRKQSRGKSNSTPARGRGSSNDQTRTQNSTSTPPSLNGLFENSHQKQNSRPKEQLAQNERALLEEEVTSLRAKITTLEEDLKKARQEASEYQHMCQQLEKELKEVKSNEQQVKPKRMKV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G386730`
TK1151 ID	TkA06G386730
OH-1004 ID	LXL04_023227
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	98.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G386730

位置 Chr06:95678864-95685517 (-)

描述 Similar to TOUSLED: Serine/threonine-protein kinase TOUSLED

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g20930`	花器官原基的正确起始和器官原基的正确发育所必需的。	TOUSLED kinase activity oscillates during the cell cycle and interacts with chromatin regulators.2004 · DOI: 10.1104/pp.103.038117 The Tousled gene in A. thaliana encodes a protein kinase homolog that is required for leaf and flower development.1993 · DOI: 10.1016/0092-8674(93)90537-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023227 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006325 chromatin organization 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程

GO:0006974 DNA damage response 生物过程

GO:0007059 chromosome segregation 生物过程

GO:0007283 spermatogenesis 生物过程

GO:0018105 peptidyl-serine phosphorylation 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0032435 negative regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0051647 nucleus localization 生物过程

GO:0060147 regulation of post-transcriptional gene silencing 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G20930

dre:407732

hsa:9874

mmu:24086

xtr:780168

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.782

排名 1 · TkA06G386730 · TK1151

细胞质0.317

排名 2 · TkA06G386730 · TK1151

细胞膜0.034

排名 3 · TkA06G386730 · TK1151

线粒体0.024

排名 4 · TkA06G386730 · TK1151

高尔基体0.017

排名 5 · TkA06G386730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26666DUF822124-33 aa

PF07303Occludin_ELL97-127 aa

PF01166TSC22182-200 aa

PF28016Mua196-275 aa

PF10046BLOC1_2196-259 aa

PF02996Prefoldin202-241 aa

PF01636APH203-236 aa

PF07303Occludin_ELL204-257 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G386730	`PF26666`	DUF8221	24	33	0.023	15.5
TkA06G386730	`PF07303`	Occludin_ELL	97	127	0.0055	18.2
TkA06G386730	`PF01166`	TSC22	182	200	0.037	14.9
TkA06G386730	`PF28016`	Mua	196	275	0.027	15.4
TkA06G386730	`PF10046`	BLOC1_2	196	259	1.7	9.8
TkA06G386730	`PF02996`	Prefoldin	202	241	3.0	8.5
TkA06G386730	`PF01636`	APH	203	236	0.048	14.1
TkA06G386730	`PF07303`	Occludin_ELL	204	257	0.0055	18.2
TkA06G386730	`PF28907`	ZapB_rel	204	239	8.2	7.8
TkA06G386730	`PF01166`	TSC22	205	237	0.037	14.9
TkA06G386730	`PF26666`	DUF8221	207	254	0.023	15.5
TkA06G386730	`PF26585`	STX17_N	210	259	0.0081	16.9
TkA06G386730	`PF28907`	ZapB_rel	210	239	8.2	7.8
TkA06G386730	`PF13012`	MitMem_reg	213	277	0.19	12.4
TkA06G386730	`PF05377`	FlaC_arch	214	249	0.31	12.2
TkA06G386730	`PF00069`	Pkinase	227	276	3.3e-58	197.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q39238`	拟南芥	sp\|Q39238\|TSL_ARATH Serine/threonine-protein kinase TOUSLED	63.400%	Swiss-Prot	高置信

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