TkA06G366950 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G366950

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 90868792-90871877 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2261 bp · TkA06G366950|TK1151|cDNA

ACTTAACTGTATAATCTGAGGATTATTTGTTAATCTGTAATCTACCATTGGACCTGTGAATACATGAAAATCCATACACCATTCCCATCCCTATAATCCCTCCCGATCATTCCCTCCAAAAATCATCTCGTTTCCACACCACTATCATCGATCCCTTTTGCAATCTGTCTTGACCTTTCTCTCTCTGTTTCTCTTTCTCTCTGTATCCATCCCTCTGTTTCACCGACTCTCACTTTCTTTCTCTCTAAACCTTCCATTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1509 bp · TkA06G366950|TK1151|CDS

ATGGGGAACTGCTGTTCCCAAAAAGAACCTCCAACTGAAGATGGGCAACCAAAAACAGAGGAAAGTCCCGAAGAAAGATCCGGAAACGACCCATCAAGAACCACCCCTCAAAGTGCATCCTCTCCGACAAACAAACCCGGCAAGCCATCCCCTATCGGAACCGTCTTGGGCCGCCCAATGGAAGATGTCCGTACAAGCTATACAATCGGAAAAGAGCTTGGTCGCGGCCAATTTGGTGTTACCCATTTATGCACGAATAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

502 aa · TkA06G366950|TK1151|PROTEIN

MGNCCSQKEPPTEDGQPKTEESPEERSGNDPSRTTPQSASSPTNKPGKPSPIGTVLGRPMEDVRTSYTIGKELGRGQFGVTHLCTNKQTGEQFACKTIAKRKLVNTEDMEDVRREVQIMHHLSGQNNIVDLKGAFEDKHSVHLVMELCAGGELFDRIIAKGHYTERGAASLLRTIVQIVHTCHSMGVIHRDLKPENFLLLSKDENAPLKATDFGLSVFYKQGEVFSDIVGSAYYIAPEVLKRKYGPEVDIWSIGVMLYIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G366950`
TK1151 ID	TkA06G366950
OH-1004 ID	LXL04_027077
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	63.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 88.247 / OH-1004 82.189 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G366950

位置 Chr06:90868792-90871877 (+)

描述 Similar to CPK21: Calcium-dependent protein kinase 21

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g12180`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At5g19360`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`At4g23650`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	CDPKs CPK6 and CPK3 function in ABA regulation of guard cell S-type anion- and Ca(2+)-permeable channels and stomatal closure.2006 · DOI: 10.1371/journal.pbio.0040327

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0808400`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献
`Os05g0491900`	可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027077 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能

GO:0005509 calcium ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G20410

ath:AT4G04720

ath:AT4G21940

dosa:Os07g0515100

osa:4343373

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.445

排名 1 · TkA06G366950 · TK1151

细胞膜0.431

排名 2 · TkA06G366950 · TK1151

细胞核0.213

排名 3 · TkA06G366950 · TK1151

高尔基体0.134

排名 4 · TkA06G366950 · TK1151

内质网0.090

排名 5 · TkA06G366950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase67-325 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr68-320 aa

PF14531Kinase-like71-125 aa

PF05042Caleosin116-144 aa

PF06293Kdo142-206 aa

PF14531Kinase-like162-310 aa

PF06293Kdo345-369 aa

PF13833EF-hand_8365-393 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G366950	`PF00069`	Pkinase	67	325	1.2e-78	264.8
TkA06G366950	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	68	320	7.2e-28	98.3
TkA06G366950	`PF14531`	Kinase-like	71	125	7.2e-07	29.5
TkA06G366950	`PF05042`	Caleosin	116	144	0.063	13.9
TkA06G366950	`PF06293`	Kdo	142	206	0.00065	19.9
TkA06G366950	`PF14531`	Kinase-like	162	310	7.2e-07	29.5
TkA06G366950	`PF06293`	Kdo	345	369	0.00065	19.9
TkA06G366950	`PF13833`	EF-hand_8	365	393	1.4e-11	44.6
TkA06G366950	`PF12763`	EH	365	432	6e-05	23.6
TkA06G366950	`PF25825`	SAPC2_N	366	432	1.6e-05	25.4
TkA06G366950	`PF24082`	SPEF2_C	366	392	0.03	14.8
TkA06G366950	`PF21008`	AIF-1	369	432	1.4e-05	26.1
TkA06G366950	`PF00069`	Pkinase	371	413	1.2e-78	264.8
TkA06G366950	`PF25578`	EF-hand_STIM1	372	394	0.00094	19.9
TkA06G366950	`PF13499`	EF-hand_7	373	433	3.3e-25	88.9
TkA06G366950	`PF00036`	EF-hand_1	373	399	6.5e-25	85.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FMP5`	拟南芥	sp\|Q9FMP5\|CDPKH_ARATH Calcium-dependent protein kinase 17	76.500%	Swiss-Prot	高置信
`Q3E9C0`	拟南芥	sp\|Q3E9C0\|CDPKY_ARATH Calcium-dependent protein kinase 34	77.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q42479`	拟南芥	sp\|Q42479\|CDPK3_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3	67.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q5VQQ5`	水稻	sp\|Q5VQQ5\|CDPK2_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2	72.400%	Swiss-Prot	高置信
`B9FKW9`	水稻	sp\|B9FKW9\|CDPKE_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 14	73.900%	Swiss-Prot	高置信

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