TkA06G203570 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G203570

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 52850430-52853082 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1545 bp · TkA06G203570|TK1151|cDNA

ATTGTTAAAATCATGAATATGTGTCGGTAATAGACAATCCGACTTTTCGAAAGGACATCTCTGGTGTCCCAAGTGTACTCTGACATCAATTAATAGCGGCGACACACATTGGAGCGAACTTTTCCCGCGGCTAACTCCCGATCGTTGGATCACTTCAACGGCTAGGATGCTCCAACGATTTTCACACGGGCAGGAGTGGTCTTCATTGGTAGCGAAGTTGGCGGTCTACACTTGATTTAAAGCATCCACTTCTCCGCCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1011 bp · TkA06G203570|TK1151|CDS

ATGGCCAAGATTAAGATTGGAATCAATGGATTCGGAAGAATCGGCCGTTTGGTGGCCAGAGTTGCTCTACAGAGCGATGATGTTGAACTCGTCGCCGTTAATGATCCTTTCATTACTACCGATTATATGATCTACATGTTCAAATACGACAGTGTTCATGGCCCATGGAAAAAGCATGAGGTCAAAGTCAAGGATCCCAAAATTCTCCTCATCGGCGACAAACCTATCACCGTTTTCGGCATGAGAAACCCAGAAGAGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

336 aa · TkA06G203570|TK1151|PROTEIN

MAKIKIGINGFGRIGRLVARVALQSDDVELVAVNDPFITTDYMIYMFKYDSVHGPWKKHEVKVKDPKILLIGDKPITVFGMRNPEEIPWGEAGAEYVVESTGVFTDKDKAAAHLKGGAKKVVISAPSANAPMFVMGVNEKEYTSDITIVSNASCTTNCLAPIAKVINDKFGIVEGLMTTVHSITATQKTVDGPSMKDWRGGRAASFNIIPSSTGAAKAVGKVLPALNGKLTGMAFRVPTVDVSVVDLTARLEKPASYDEI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G203570`
TK1151 ID	TkA06G203570
OH-1004 ID	LXL04_006066
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	86.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G203570

位置 Chr06:52850430-52853082 (+)

描述 Similar to GAPC: Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, cytosolic

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0486600`	糖酵解中的关键酶，通过将 D-甘油醛-3-磷酸（G3P）转化为 3-磷酸-D-甘油酰磷酸，从而催化该途径的第一步。	暂无已核实直接文献
`Os02g0601300`	糖酵解中的关键酶，通过将 D-甘油醛-3-磷酸（G3P）转化为 3-磷酸-D-甘油酰磷酸，从而催化该途径的第一步。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006066 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006006 glucose metabolic process 生物过程

GO:0006096 glycolytic process 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0034059 response to anoxia 生物过程

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0032991 protein-containing complex 细胞组分

GO:0004365 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NAD+) (phosphorylating) activity 分子功能

GO:0042301 phosphate ion binding 分子功能

GO:0050661 NADP binding 分子功能

GO:0051287 NAD binding 分子功能

GO:0070403 NAD+ binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os02g0601300

dosa:Os04g0486600

zma:542333

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.831

排名 1 · TkA06G203570 · TK1151

细胞核0.265

排名 2 · TkA06G203570 · TK1151

线粒体0.080

排名 3 · TkA06G203570 · TK1151

细胞膜0.075

排名 4 · TkA06G203570 · TK1151

内质网0.054

排名 5 · TkA06G203570 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00044Gp_dh_N4-107 aa

PF01113DapB_N4-35 aa

PF028262-Hacid_dh_C4-33 aa

PF01113DapB_N93-111 aa

PF02800Gp_dh_C153-318 aa

PF00044Gp_dh_N296-328 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G203570	`PF00044`	Gp_dh_N	4	107	3.6e-35	121.0
TkA06G203570	`PF01113`	DapB_N	4	35	0.002	18.9
TkA06G203570	`PF02826`	2-Hacid_dh_C	4	33	0.082	13.0
TkA06G203570	`PF01113`	DapB_N	93	111	0.002	18.9
TkA06G203570	`PF02800`	Gp_dh_C	153	318	5.9e-76	254.6
TkA06G203570	`PF00044`	Gp_dh_N	296	328	3.6e-35	121.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q7FAH2`	水稻	sp\|Q7FAH2\|G3PC2_ORYSJ Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 2, cytosolic	89.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K5G8`	水稻	sp\|Q6K5G8\|G3PC3_ORYSJ Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase 3, cytosolic	87.700%	Swiss-Prot	高置信

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