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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G191660
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 49995452-50002405 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4444 bp · TkA06G191660|TK1151|cDNA

CAAGCATCATCTTGTAATAACTATAATTCATTATGTGTATCGTTTTATGTTTGGTTTGTTTGCTTGTCGAAACGGCAATAGGTCAGCAAGCTAACTACTCTCCTAACAAATATACAATAATATACTCATGTGCATATAATTATATCCATATCTACAAGACTAATACATTAACCAGTGATTAATGGCGGAAGTAAGAGATCTCTGCAACTTCTGACCAAAGTAAGGAATTTTGTCTACTCTGTCTTCTTGTATTTTTGCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

3558 bp · TkA06G191660|TK1151|CDS

ATGCCGTTTGGTAGGCATGAGAGGATTCGGTTTAGTAAAATTTATTCTCTTTCGTGTTTCCGACCTTCAACAAAAGATGAACACGGTCAAATCGGGCAAAAAGGCTACTCTAGAGTTGTATATTGCAATGATCCCGAGAATCCAGAGGCACTTCAGCTCAGATACCGGGGTAATTATGTTTCGACGACTAAGTATACGGCCGTCAATTTCATTCCGAAGTCTCTGTTTGAACAATTTAGGCGGGTTGCAAATATTTACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1185 aa · TkA06G191660|TK1151|PROTEIN

MPFGRHERIRFSKIYSLSCFRPSTKDEHGQIGQKGYSRVVYCNDPENPEALQLRYRGNYVSTTKYTAVNFIPKSLFEQFRRVANIYFLVVACVSFSPLAPFRASSILFPLLVVIGATMAKEGVEDWRRRKQDIKANNRKIHVYRDHSFSQSKWKDLRVGDLVKVYKDEYFPSDLLLLSSSYPDGICYVETMNLDGETNLKLKHAFDFTSSLHDDSSFHHFKAVVKCEDPNEDLYSFVGSLSYNGEQHPLSLQQILLRDSK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G191660
TK1151 IDTkA06G191660
OH-1004 IDLXL04_023977
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G191660
位置Chr06:49995452-50002405 (-)
描述Similar to ALA8: Probable phospholipid-transporting ATPase 8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g27870 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g68710 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At3g25610 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g26130 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献
At1g13210 参与磷脂的运输。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023977 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0045332 phospholipid translocation 生物过程
GO:1901703 protein localization involved in auxin polar transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016887 ATP hydrolysis activity 分子功能
GO:0090554 phosphatidylcholine floppase activity 分子功能
GO:0140326 ATPase-coupled intramembrane lipid transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G13210
ath:AT1G26130
ath:AT1G68710
ath:AT3G25610
ath:AT3G27870
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.391
排名 1 · TkA06G191660 · TK1151
内质网0.238
排名 2 · TkA06G191660 · TK1151
高尔基体0.224
排名 3 · TkA06G191660 · TK1151
细胞质0.207
排名 4 · TkA06G191660 · TK1151
溶酶体／液泡0.174
排名 5 · TkA06G191660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16209PhoLip_ATPase_N40-102 aa
PF00122E1-E2_ATPase137-202 aa
PF00702Hydrolase419-528 aa
PF13246Cation_ATPase514-710 aa
PF08282Hydrolase_3568-667 aa
PF00702Hydrolase662-738 aa
PF08282Hydrolase_3713-740 aa
PF00702Hydrolase816-877 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G191660PF16209PhoLip_ATPase_N401021.9e-2279.5
TkA06G191660PF00122E1-E2_ATPase1372020.002318.4
TkA06G191660PF00702Hydrolase4195282.3e-1351.7
TkA06G191660PF13246Cation_ATPase5147106.1e-2279.0
TkA06G191660PF08282Hydrolase_35686673e-0524.6
TkA06G191660PF00702Hydrolase6627382.3e-1351.7
TkA06G191660PF08282Hydrolase_37137403e-0524.6
TkA06G191660PF00702Hydrolase8168772.3e-1351.7
TkA06G191660PF08282Hydrolase_38578833e-0524.6
TkA06G191660PF16212PhoLip_ATPase_C89111413.8e-91306.0
TkA06G191660PF16209PhoLip_ATPase_N112311361.9e-2279.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK90拟南芥sp|Q9LK90|ALA8_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 871.500%Swiss-Prot高置信
Q9SX33拟南芥sp|Q9SX33|ALA9_ARATH Putative phospholipid-transporting ATPase 964.700%Swiss-Prot高置信
Q9LI83拟南芥sp|Q9LI83|ALA10_ARATH Phospholipid-transporting ATPase 1064.400%Swiss-Prot高置信
P57792拟南芥sp|P57792|ALA12_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 1263.100%Swiss-Prot高置信
Q9SAF5拟南芥sp|Q9SAF5|ALA11_ARATH Probable phospholipid-transporting ATPase 1163.500%Swiss-Prot高置信

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