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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G173310
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 45500601-45502647 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

666 bp · TkA06G173310|TK1151|cDNA

ATGCGGCTATGGTGTTCTTCGACCGGGTTGATCCGTGTTTTGTGGGCGGTTGGACCGGCCGGGTCGATGGTTGTATCCATGAAATGGGTTTTGAAATGGTGCAGTTCTGGGACTTCAGGAGGCGAGAGAAAGCTGATGCCCACCATTGAAGCCGAGCTTGGAAGAAGGTCGTTGTTGTACAGTCTTTTAATGCCGCTAAAACTCTCGGTGGTTTTTGTTGATGATTCTGAAAACCCATCTCCCTCTGAGTCCAATAACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

666 bp · TkA06G173310|TK1151|CDS

ATGCGGCTATGGTGTTCTTCGACCGGGTTGATCCGTGTTTTGTGGGCGGTTGGACCGGCCGGGTCGATGGTTGTATCCATGAAATGGGTTTTGAAATGGTGCAGTTCTGGGACTTCAGGAGGCGAGAGAAAGCTGATGCCCACCATTGAAGCCGAGCTTGGAAGAAGGTCGTTGTTGTACAGTCTTTTAATGCCGCTAAAACTCTCGGTGGTTTTTGTTGATGATTCTGAAAACCCATCTCCCTCTGAGTCCAATAACAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

221 aa · TkA06G173310|TK1151|PROTEIN

MRLWCSSTGLIRVLWAVGPAGSMVVSMKWVLKWCSSGTSGGERKLMPTIEAELGRRSLLYSLLMPLKLSVVFVDDSENPSPSESNNSKFQTWNSQYYRGEPIVVVAKENSQQATDSATIETPLLLPVRSLKNGVAESSMIDSKVNSFGRSNSRRFSKHLSKLSGAVSPEESEENIVLRSPIPWRSRSRRMEIKEDFTQTPEINPIDSPSSRFQSSNKWNTK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G173310
TK1151 IDTkA06G173310
OH-1004 IDLXL04_002365
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)95.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.045 / OH-1004 92.991
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G173310
位置Chr06:45500601-45502647 (+)
描述Similar to GH3.6: Indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27260 催化吲哚-3-乙酸 -氨基酸缀合物的合成，为植物提供应对过量生长素存在的机制。
Characterization of an Arabidopsis enzyme family that conjugates amino acids to indole-3-acetic acid.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.026690
At5g54510 催化吲哚-3-乙酸 -氨基酸缀合物的合成，为植物提供应对过量生长素存在的机制。
DFL1, an auxin-responsive GH3 gene homologue, negatively regulates shoot cell elongation and lateral root formation, and positively regulates the light response of hypocotyl length.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.00957.x
Characterization of an Arabidopsis enzyme family that conjugates amino acids to indole-3-acetic acid.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.026690
At4g37390 催化吲哚-3-乙酸 -氨基酸缀合物的合成，为植物提供应对过量生长素存在的机制。
ydk1-D, an auxin-responsive GH3 mutant that is involved in hypocotyl and root elongation.2004 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01973.x
Characterization of an Arabidopsis enzyme family that conjugates amino acids to indole-3-acetic acid.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.026690

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0785400 可能催化吲哚-3-乙酸(IAA)-氨基酸结合物的合成，为植物应对过量生长素提供机制。 暂无已核实直接文献
Os05g0500900 可能催化吲哚-3-乙酸(IAA)-氨基酸结合物的合成，为植物应对过量生长素提供机制。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002365 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0010120 camalexin biosynthetic process 生物过程
GO:0140964 intracellular auxin homeostasis 生物过程
GO:1901183 positive regulation of camalexin biosynthetic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0010279 indole-3-acetic acid amido synthetase activity 分子功能
GO:0016881 acid-amino acid ligase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G27260
ath:AT4G37390
ath:AT5G54510
dosa:Os01g0785400
dosa:Os05g0500900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.370
排名 1 · TkA06G173310 · TK1151
细胞质0.311
排名 2 · TkA06G173310 · TK1151
细胞膜0.253
排名 3 · TkA06G173310 · TK1151
内质网0.108
排名 4 · TkA06G173310 · TK1151
线粒体0.073
排名 5 · TkA06G173310 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03321GH334-68 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G173310PF03321GH334686.9e-0522.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81829拟南芥sp|O81829|GH35_ARATH Indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.590.600%Swiss-Prot低置信
Q9LSQ4拟南芥sp|Q9LSQ4|GH36_ARATH Indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.690.600%Swiss-Prot低置信
Q9SZT9拟南芥sp|Q9SZT9|GH32_ARATH Indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.281.300%Swiss-Prot低置信
Q8LQM5水稻sp|Q8LQM5|GH31_ORYSJ Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.184.400%Swiss-Prot低置信
Q60EJ6水稻sp|Q60EJ6|GH34_ORYSJ Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase GH3.484.400%Swiss-Prot低置信

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