TkA06G152650 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G152650

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 39943466-39945911 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1125 bp · TkA06G152650|TK1151|cDNA

AAACAGATTCCGGTTCCGTGAACCAAATACTCACTACAGAGTTAGACCAGTCTCTCGGCTTAAACGATCCCCTCTTTCCGATCGTTTCATCGGAACGGAATCGCAAATTCCGGCGCCAGTATGTCCACCGACTTCCAATCCATTCCACTCATCGATATTAGTCCACTTGTGGCTAAGTGCGATGATCCAAATGCATTTGAAGACAAAGATGTTGCAGAAGTTGTTAGACTTCTAGATCATGCGTGTAGAGAAGCTGGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1005 bp · TkA06G152650|TK1151|CDS

ATGTCCACCGACTTCCAATCCATTCCACTCATCGATATTAGTCCACTTGTGGCTAAGTGCGATGATCCAAATGCATTTGAAGACAAAGATGTTGCAGAAGTTGTTAGACTTCTAGATCATGCGTGTAGAGAAGCTGGATTCTTTTACGTGAAAGGCCATGGTATTCCCGAATCTCTTATCAAAGAGGTTAGAGACATTACACACAAGTATTTTGATCAACCTTACGAGGAGAAACTCAAGATCAAACTAGCAGATACAAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

335 aa · TkA06G152650|TK1151|PROTEIN

MSTDFQSIPLIDISPLVAKCDDPNAFEDKDVAEVVRLLDHACREAGFFYVKGHGIPESLIKEVRDITHKYFDQPYEEKLKIKLADTTGYRGYQRVGENITKGVPDKHEAIDCYRELKKGMYGGLGDPLVGTNKWPSDPPRFKEVMEEYLALCTELSRKIMRGIGVAVGGSLDEFEGKIAGDPFWVFRIIGYPGSLSTNNEDLPKNDVGCGAHTDYGLLTLVNQDDDKTALQVRNLSGEWISAVPIPGTFVCNIGDMLKIL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G152650`
TK1151 ID	TkA06G152650
OH-1004 ID	LXL04_019036
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	34.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 78.806 / OH-1004 80.363 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G152650

位置 Chr06:39943466-39945911 (-)

描述 Similar to hxnY: 2-oxoglutarate-Fe(II) type oxidoreductase hxnY (Emericella nidulans (strain FGSC A4 / ATCC 38163 / CBS 112.46 / NRRL 194 / M139)

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g50210`	2-氧代戊二酸依赖的双加氧酶，催化高精氨酸的6-羟基化，生成6-羟基-L-高精氨酸。	暂无已核实直接文献
`At3g49630`	2-氧代戊二酸依赖的双加氧酶，催化高精氨酸的6-羟基化，生成6-羟基-L-高精氨酸。	暂无已核实直接文献
`At3g49620`	2-酮戊二酸依赖性双加氧酶催化高精氨酸6-羟基化和精氨酸-5-羟基化，从而分别产生6-羟基-L-高精氨酸和5-羟基-L-精氨酸。	Guanidine production by plant homoarginine-6-hydroxylases.2024 · DOI: 10.7554/elife.91458

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0245500`	2-氧代戊二酸依赖的双加氧酶，催化高精氨酸的6-羟基化，生成6-羟基-L-高精氨酸。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019036 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0044283 small molecule biosynthetic process 生物过程

GO:1900602 endocrocin biosynthetic process 生物过程

GO:0016706 2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

GO:0051213 dioxygenase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

afm:AFUA_4G00230

ddi:DDB_G0283291

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.774

排名 1 · TkA06G152650 · TK1151

细胞核0.341

排名 2 · TkA06G152650 · TK1151

过氧化物酶体0.097

排名 3 · TkA06G152650 · TK1151

线粒体0.066

排名 4 · TkA06G152650 · TK1151

细胞膜0.036

排名 5 · TkA06G152650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14226DIOX_N8-136 aa

PF031712OG-FeII_Oxy204-289 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G152650	`PF14226`	DIOX_N	8	136	4.5e-29	102.2
TkA06G152650	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	204	289	2.1e-20	73.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q84MB6`	拟南芥	sp\|Q84MB6\|OD231_ARATH Homoarginine-6-hydroxylase 2-ODD-C23.1	68.600%	Swiss-Prot	高置信
`F4IY03`	拟南芥	sp\|F4IY03\|OD233_ARATH Homoarginine-6-hydroxylase 2-ODD-C23.3	62.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q8H113`	拟南芥	sp\|Q8H113\|OD232_ARATH Homoarginine-6-hydroxylase 2-ODD-C23.2	61.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q6K332`	水稻	sp\|Q6K332\|ODD33_ORYSJ Homoarginine-6-hydroxylase 2-ODD-233	64.500%	Swiss-Prot	高置信

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