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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G149160
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 39135987-39136385 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

318 bp · TkA06G149160|TK1151|cDNA

ATGGTTGAGTACTTCGGCGAGCAATTATCTGGTTTTGCCTTCACCGCCAACGGGTTGGTGCAGTCTTACGGCTCCCGATGTGTCAAACCACCGATCATCTACGGCGATGTCAGTCGTCCCAAATCCATGACCGTCTTCTGGTCGTCAATGGCTCAGGAAATGACCAAACGCCCTATGAAAGGCATGCTCACGGACCTGTCACCATCCTCAATTGGTCCTTCGTTCGGAACGATCAACCCAGATACAAGACTTGCTACCAG...

CDS

下载 CDS FASTA

318 bp · TkA06G149160|TK1151|CDS

ATGGTTGAGTACTTCGGCGAGCAATTATCTGGTTTTGCCTTCACCGCCAACGGGTTGGTGCAGTCTTACGGCTCCCGATGTGTCAAACCACCGATCATCTACGGCGATGTCAGTCGTCCCAAATCCATGACCGTCTTCTGGTCGTCAATGGCTCAGGAAATGACCAAACGCCCTATGAAAGGCATGCTCACGGACCTGTCACCATCCTCAATTGGTCCTTCGTTCGGAACGATCAACCCAGATACAAGACTTGCTACCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

105 aa · TkA06G149160|TK1151|PROTEIN

MVEYFGEQLSGFAFTANGLVQSYGSRCVKPPIIYGDVSRPKSMTVFWSSMAQEMTKRPMKGMLTDLSPSSIGPSFGTINPDTRLATRLFWRLRKKSRISKKLESK

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G149160
TK1151 IDTkA06G149160
OH-1004 IDLXL04_000286
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 60.952 / OH-1004 19.753
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G149160
位置Chr06:39135987-39136385 (+)
描述Similar to BTF3: Basic transcription factor 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g17920 催化将甲基从 5-甲基四氢叶酸转移到半胱氨酸，生成蛋氨酸。 暂无已核实直接文献
At3g03780 催化将甲基从 5-甲基四氢叶酸转移到半胱氨酸，生成蛋氨酸。 暂无已核实直接文献
At5g20980 催化将甲基从 5-甲基四氢叶酸转移到半胱氨酸，生成蛋氨酸。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0624000 催化将甲基从 5-甲基四氢叶酸转移到半胱氨酸，生成蛋氨酸。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000286 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009086 methionine biosynthetic process 生物过程
GO:0010043 response to zinc ion 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0071266 'de novo' L-methionine biosynthetic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17880
ath:AT1G73230
ath:AT3G03780
ath:AT5G17920
dosa:Os12g0624000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.369
排名 1 · TkA06G149160 · TK1151
细胞质0.207
排名 2 · TkA06G149160 · TK1151
质体0.187
排名 3 · TkA06G149160 · TK1151
细胞核0.185
排名 4 · TkA06G149160 · TK1151
细胞膜0.060
排名 5 · TkA06G149160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01717Meth_synt_21-64 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G149160PF01717Meth_synt_21641.4e-2591.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O50008拟南芥sp|O50008|METE1_ARATH 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase 190.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SRV5拟南芥sp|Q9SRV5|METE2_ARATH 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase 292.200%Swiss-Prot中等置信
Q0WNZ5拟南芥sp|Q0WNZ5|METE3_ARATH 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase 3, chloroplastic87.500%Swiss-Prot中等置信
Q2QLY4水稻sp|Q2QLY4|METE2_ORYSJ 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase 290.600%Swiss-Prot中等置信

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