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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G142950
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 37482091-37483622 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1065 bp · TkA06G142950|TK1151|cDNA

ATGGATGTTTCATCTTCAAAATGGTTGTCCGAGCTGGAAATGGAAGAGTATTGTGATTTCAAGATTAATCCACATCAAATGTCAAATCCTTATATCGATTCAGTGGCTGCATTATCGTCAGAAAGTTTAACCGATTACCCTAATTACCTACTCCCAATGAACCACAATTTCCAACAAGCCGTCAAATACATCGAACAAGATCATGTTTCAAAGGAACCCAAGAGTTATATTAATAAGCCCAGTAGTACTACTATTAGTAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1065 bp · TkA06G142950|TK1151|CDS

ATGGATGTTTCATCTTCAAAATGGTTGTCCGAGCTGGAAATGGAAGAGTATTGTGATTTCAAGATTAATCCACATCAAATGTCAAATCCTTATATCGATTCAGTGGCTGCATTATCGTCAGAAAGTTTAACCGATTACCCTAATTACCTACTCCCAATGAACCACAATTTCCAACAAGCCGTCAAATACATCGAACAAGATCATGTTTCAAAGGAACCCAAGAGTTATATTAATAAGCCCAGTAGTACTACTATTAGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

354 aa · TkA06G142950|TK1151|PROTEIN

MDVSSSKWLSELEMEEYCDFKINPHQMSNPYIDSVAALSSESLTDYPNYLLPMNHNFQQAVKYIEQDHVSKEPKSYINKPSSTTISNRMTTPFAPTRVSSSNTFIMSFGNPNSPPELTPHQLYDGYNTKYVKTKEEKNTTDFLVSLEAEKRVPGSTVSRNETQAQDHVLAERKRREILTRRFIALSALLPNLKKMDKATVLEDATKYIKQLQTRMKELEKETTSENKRFKQESAISIKRSKISGDSNDDINIPSSDDDET...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G142950
TK1151 IDTkA06G142950
OH-1004 IDLXL04_024444
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G142950
位置Chr06:37482091-37483622 (+)
描述Similar to BHLH25: Transcription factor bHLH25
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g37850 转录因子 bHLH25。 暂无已核实直接文献
At2g22770 调控至少NAI2、PYK10和PBP1表达的转录激活因子。
A novel ER-derived compartment, the ER body, selectively accumulates a beta-glucosidase with an ER-retention signal in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01636.x
NAI1 gene encodes a basic-helix-loop-helix-type putative transcription factor that regulates the formation of an endoplasmic reticulum-derived structure, the ER body.2004 · DOI: 10.1105/tpc.021154
Activation of an ER-body-localized beta-glucosidase via a cytosolic binding partner in damaged tissues of Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1093/pcp/pci126
PYK10, a beta-glucosidase located in the endoplasmatic reticulum, is crucial for the beneficial interaction between Arabidopsis thaliana and the endophytic fungus Piriformospora indica.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03424.x
Antagonistic jacalin-related lectins regulate the size of ER body-type beta-glucosidase complexes in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1093/pcp/pcn075
NAI2 is an endoplasmic reticulum body component that enables ER body formation in Arabidopsis thaliana.2008 · DOI: 10.1105/tpc.108.059345
At2g22760 转录因子 bHLH19。 暂无已核实直接文献
At2g22750 转录因子 bHLH18。 暂无已核实直接文献
At2g46510 转录激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024444 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007029 endoplasmic reticulum organization 生物过程
GO:0009718 anthocyanin-containing compound biosynthetic process 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010374 stomatal complex development 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0106167 extracellular ATP signaling 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22750
ath:AT2G22760
ath:AT2G22770
ath:AT4G37850
ath:AT5G46760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.974
排名 1 · TkA06G142950 · TK1151
细胞质0.097
排名 2 · TkA06G142950 · TK1151
细胞膜0.024
排名 3 · TkA06G142950 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA06G142950 · TK1151
质体0.012
排名 5 · TkA06G142950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23177bHLH_IRO353-76 aa
PF00010HLH58-66 aa
PF30591DUF8655137-183 aa
PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant139-151 aa
PF02173pKID164-181 aa
PF00010HLH166-212 aa
PF23177bHLH_IRO3169-226 aa
PF14868DUF4487181-242 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G142950PF23177bHLH_IRO353761e-0732.9
TkA06G142950PF00010HLH58664.9e-1039.8
TkA06G142950PF30591DUF86551371830.5211.5
TkA06G142950PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant1391510.001419.4
TkA06G142950PF02173pKID1641810.0314.5
TkA06G142950PF00010HLH1662124.9e-1039.8
TkA06G142950PF23177bHLH_IRO31692261e-0732.9
TkA06G142950PF14868DUF44871812420.06912.5
TkA06G142950PF30591DUF86551872280.5211.5
TkA06G142950PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant2733500.001419.4
TkA06G142950PF14868DUF44872883480.06912.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9T072拟南芥sp|Q9T072|BH025_ARATH Transcription factor bHLH2533.200%Swiss-Prot中等置信
Q8S3F1拟南芥sp|Q8S3F1|BH020_ARATH Transcription factor NAI143.500%Swiss-Prot中等置信
Q1PF16拟南芥sp|Q1PF16|BH019_ARATH Transcription factor bHLH1939.400%Swiss-Prot中等置信
Q1PF17拟南芥sp|Q1PF17|BH018_ARATH Transcription factor bHLH1840.300%Swiss-Prot中等置信
Q9ZPY8拟南芥sp|Q9ZPY8|AIB_ARATH Transcription factor ABA-INDUCIBLE bHLH-TYPE40.000%Swiss-Prot低置信

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