TkA06G141990 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G141990

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 37232969-37234042 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

597 bp · TkA06G141990|TK1151|cDNA

TCAGATTTTCTTAATCTGTTTGATTTGGAAGTCCTCCTCTTGAACAATAATGGTTTTACTGGAGCAATACCAACGGAAGCATACCTATCTAATCCTCTCTTGTGTCATTTAAATGCGGAGATATCAGAGTTCAATGAATCAAGAGAAAAGGAGTTGCCTTTAATTCAAGAAGTTGACATCAAAATCAAAGAACTTCGCCAGATGATTTCAGCCCTTAATAATCAACAAATGTCACTAAAGGCTGCATTTAGAAAAAAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

597 bp · TkA06G141990|TK1151|CDS

TCAGATTTTCTTAATCTGTTTGATTTGGAAGTCCTCCTCTTGAACAATAATGGTTTTACTGGAGCAATACCAACGGAAGCATACCTATCTAATCCTCTCTTGTGTCATTTAAATGCGGAGATATCAGAGTTCAATGAATCAAGAGAAAAGGAGTTGCCTTTAATTCAAGAAGTTGACATCAAAATCAAAGAACTTCGCCAGATGATTTCAGCCCTTAATAATCAACAAATGTCACTAAAGGCTGCATTTAGAAAAAAGAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

198 aa · TkA06G141990|TK1151|PROTEIN

SDFLNLFDLEVLLLNNNGFTGAIPTEAYLSNPLLCHLNAEISEFNESREKELPLIQEVDIKIKELRQMISALNNQQMSLKAAFRKKKEAVKEMDEKISSAEFALVQSAQENASLHSKIVQSPVKLQRALEEKKAVLIESKNAERESMQSFQIIYFVISRAYRLTDKQVHRVLFMGFLKMDRRLEQLVEMEKVHIRMRY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G141990`
TK1151 ID	TkA06G141990
OH-1004 ID	LXL04_025902
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	96.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.495 / OH-1004 64.078 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G141990

位置 Chr06:37232969-37234042 (+)

描述 Similar to NUF2: Kinetochore protein NUF2 homolog

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g61000`	作为重要着丝粒相关 NDC80 复合体的组成部分，该复合体是染色体分离和纺锤体检查点活性所必需的，以确保正确的细胞分裂。	MUN (MERISTEM UNSTRUCTURED), encoding a SPC24 homolog of NDC80 kinetochore complex, affects development through cell division in Arabidopsis thaliana.2018 · DOI: 10.1111/tpj.13823

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025902 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000070 mitotic sister chromatid segregation 生物过程

GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程

GO:0008361 regulation of cell size 生物过程

GO:0009624 response to nematode 生物过程

GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程

GO:0009877 nodulation 生物过程

GO:0010091 trichome branching 生物过程

GO:0010342 endosperm cellularization 生物过程

GO:0010492 maintenance of shoot apical meristem identity 生物过程

GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程

GO:0030154 cell differentiation 生物过程

GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G61000

ath:AT4G11920

ath:AT4G22910

ath:AT5G13840

mtr:25493638

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.525

排名 1 · TkA06G141990 · TK1151

细胞核0.374

排名 2 · TkA06G141990 · TK1151

细胞膜0.084

排名 3 · TkA06G141990 · TK1151

线粒体0.071

排名 4 · TkA06G141990 · TK1151

高尔基体0.063

排名 5 · TkA06G141990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF29997SPC25_N36-97 aa

PF28016Mua40-167 aa

PF10198Ada340-110 aa

PF19456MobI42-79 aa

PF07517SecA_DEAD44-111 aa

PF10186ATG1455-129 aa

PF02609Exonuc_VII_S61-92 aa

PF09989DUF222961-171 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G141990	`PF29997`	SPC25_N	36	97	0.88	10.6
TkA06G141990	`PF28016`	Mua	40	167	0.033	15.1
TkA06G141990	`PF10198`	Ada3	40	110	0.18	12.6
TkA06G141990	`PF19456`	MobI	42	79	0.068	14.0
TkA06G141990	`PF07517`	SecA_DEAD	44	111	6.0	6.8
TkA06G141990	`PF10186`	ATG14	55	129	0.086	12.6
TkA06G141990	`PF02609`	Exonuc_VII_S	61	92	0.085	13.6
TkA06G141990	`PF09989`	DUF2229	61	171	0.58	10.5
TkA06G141990	`PF13720`	Acetyltransf_11	61	95	2.7	9.2
TkA06G141990	`PF15882`	DUF4735	62	143	0.17	12.1
TkA06G141990	`PF00709`	Adenylsucc_synt	73	142	0.18	11.2
TkA06G141990	`PF29997`	SPC25_N	110	147	0.88	10.6
TkA06G141990	`PF13720`	Acetyltransf_11	116	138	2.7	9.2
TkA06G141990	`PF07517`	SecA_DEAD	127	179	6.0	6.8
TkA06G141990	`PF19456`	MobI	145	159	0.068	14.0
TkA06G141990	`PF13720`	Acetyltransf_11	166	189	2.7	9.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8RXJ0`	拟南芥	sp\|Q8RXJ0\|NUF2_ARATH Kinetochore protein NUF2 homolog	55.900%	Swiss-Prot	中等置信

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