TkA06G140230 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G140230

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 36750284-36753510 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2277 bp · TkA06G140230|TK1151|cDNA

AAAAAATACAAAAAAATCGTTCCTTTGTCTTTGTGTGGATTCTTCTTTGTCTTGATAACCATTAACAGAGAGAATCTCTCATTCAAAGCTTCACACTTTTATTCTTCTTTATTTTACCTATCTCAAGGGACCATCTTCCCCTCTTTCTCTCTCTATCTCATATACCTCCCAACTAATTCACTTAATTTAATCTCTACACAGACCACCTACGTTATATTACATACATGTTCGTACCCACTCTATTTGATTCCATGAAATAT...

CDS

下载 CDS FASTA

942 bp · TkA06G140230|TK1151|CDS

ATGAAGAAAAAAATGGTGAACAATTTGGAGAATAACAAGGCGTGGCTGCTGGCGGAGTCCGGTGGGTGTGTTGCGGAATTGGCAAATGCTGAACCACACTCGGTTCACTCGTCCTTCAGATTTAGTTTGTGTTCGCAAGTTGAGCTTGAATCTATGAGCGTCAATTCGTCATCTGCTACAGTTTTAATGGTGAATTTGGACAATGGATTAATCGAACCCAAATCTCAAGAACTTAAGTGGAGACGAATTGAATCTTTAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

313 aa · TkA06G140230|TK1151|PROTEIN

MKKKMVNNLENNKAWLLAESGGCVAELANAEPHSVHSSFRFSLCSQVELESMSVNSSSATVLMVNLDNGLIEPKSQELKWRRIESLEKSISPIAHNLIRFSYGEILSATRNFSKGRVLGRGALSYVFKGRIGILRTSVAIKKLDKEDKEAPKAFCRELMIASSLHNPFIVPLVGFCIDPEEGLFLIYKYVSGGSLERYLRETRKGKNAGSKLPWSVRYKVARGVAEAVRYLHNGTERCVVHRDIKPSNILLSSRKSPKLC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G140230`
TK1151 ID	TkA06G140230
OH-1004 ID	LXL04_024468
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	99.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.361 / OH-1004 59.961 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G140230

位置 Chr06:36750284-36753510 (+)

描述 Similar to PBL7: Probable serine/threonine-protein kinase PBL7

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g16750`	促进细胞在赤霉素（GA）信号通路中的增殖，在RGA下游起作用，并可能通过对两个细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子SIM和SMR1的负向调控实现作用。	暂无已核实直接文献
`At5g57670`	可能的受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g57670。	暂无已核实直接文献
`At1g20650`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献
`At3g26940`	参与正向调控油菜素甾醇（BR）信号转导和植物生长的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。	暂无已核实直接文献
`At3g05140`	类受体胞质丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 RBK2。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024468 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002221 pattern recognition receptor signaling pathway 生物过程

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0009739 response to gibberellin 生物过程

GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程

GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程

GO:0043410 positive regulation of MAPK cascade 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0045088 regulation of innate immune response 生物过程

GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G16750

ath:AT5G02800

ath:AT5G13160

ath:AT5G18610

ath:AT5G57670

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.442

排名 1 · TkA06G140230 · TK1151

细胞质0.375

排名 2 · TkA06G140230 · TK1151

细胞核0.328

排名 3 · TkA06G140230 · TK1151

内质网0.040

排名 4 · TkA06G140230 · TK1151

高尔基体0.033

排名 5 · TkA06G140230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase112-312 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr115-312 aa

PF01636APH173-197 aa

PF03109ABC1230-270 aa

PF01636APH231-268 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G140230	`PF00069`	Pkinase	112	312	5.3e-37	128.4
TkA06G140230	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	115	312	4.3e-37	128.5
TkA06G140230	`PF01636`	APH	173	197	0.0032	18.0
TkA06G140230	`PF03109`	ABC1	230	270	0.056	13.3
TkA06G140230	`PF01636`	APH	231	268	0.0032	18.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`B5X4Z9`	拟南芥	sp\|B5X4Z9\|STU_ARATH Protein kinase STUNTED	45.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5XF57`	拟南芥	sp\|Q5XF57\|Y5576_ARATH Probable receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g57670	40.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LDZ5`	拟南芥	sp\|Q9LDZ5\|PBL21_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL21	39.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LSE1`	拟南芥	sp\|Q9LSE1\|CDG1_ARATH Serine/threonine-protein kinase CDG1	39.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8RXC8`	拟南芥	sp\|Q8RXC8\|RBK2_ARATH Receptor-like cytosolic serine/threonine-protein kinase RBK2	41.000%	Swiss-Prot	中等置信

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