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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G130930
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 34148405-34151837 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3344 bp · TkA06G130930|TK1151|cDNA

AAATTCCAGTTCCTTCTAAAACCAAATTGAATACATAATCATGTAATTTATTTTCCCAAGTAAAAACGTATTCCGGCTGGAAACTATATATATGGGTACTTTGGGAAACAATTCAATTGCACATCATAAACGACAAATAATCAATCCTTTACAAATGGAGAAGGCCGAATTGCTCCAAATAATTATTCTCGTGCTTGCTACAATGTCCCTTTCCACGATTCTTGCTTATGGTTCTTCTGAAGAAGCCCTTGCTCTTCTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

3162 bp · TkA06G130930|TK1151|CDS

ATGGGTACTTTGGGAAACAATTCAATTGCACATCATAAACGACAAATAATCAATCCTTTACAAATGGAGAAGGCCGAATTGCTCCAAATAATTATTCTCGTGCTTGCTACAATGTCCCTTTCCACGATTCTTGCTTATGGTTCTTCTGAAGAAGCCCTTGCTCTTCTTAAATGGAAAGGTAGCATGCAAAGCCAAATTAATAGTTCTGCGTTATCTTCATGGATATCTCCTGTTCCGAGCGGTCGAAACGTTTCTTTGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1053 aa · TkA06G130930|TK1151|PROTEIN

MGTLGNNSIAHHKRQIINPLQMEKAELLQIIILVLATMSLSTILAYGSSEEALALLKWKGSMQSQINSSALSSWISPVPSGRNVSLTPIMPTMYWCTWYGVSCNSDGSIIKLNLTSSGLTGTLNSFTFSTFPNLKHFESSVNNLFGIIPSGISNLSKLVYLDFSFNHFSSIIPPEIGLLADLEELLLFENQLVGSIPHGICQMKFLSVLDLSTNILSGDIPSCVGNLTNLSLIFLFLNKLSGSIPYELGNLSNLNELQLQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G130930
TK1151 IDTkA06G130930
OH-1004 IDLXL04_024573
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 35.708 / OH-1004 36.434
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G130930
位置Chr06:34148405-34151837 (+)
描述Similar to MIK2: MDIS1-interacting receptor like kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g08850 作为十字花科植物SCOOP肽的受体，调节包括植物生长、发育和应激反应在内的多种过程。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
Perception of a divergent family of phytocytokines by the Arabidopsis receptor kinase MIK2.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-20932-y
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
The MIK2/SCOOP Signaling System Contributes to Arabidopsis Resistance Against Herbivory by Modulating Jasmonate and Indole Glucosinolate Biosynthesis.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.852808
At1g35710 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g35710。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At5g44700 与 GSO1 一起，是在胚胎和子叶表皮表面发育过程中所需的受体样丝氨酸/苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024573 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009759 indole glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0080027 response to herbivore 生物过程
GO:1901653 cellular response to peptide 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G35710
ath:AT4G08850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.871
排名 1 · TkA06G130930 · TK1151
内质网0.083
排名 2 · TkA06G130930 · TK1151
细胞质0.056
排名 3 · TkA06G130930 · TK1151
细胞核0.036
排名 4 · TkA06G130930 · TK1151
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · TkA06G130930 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04999FtsL9-22 aa
PF08263LRRNT_249-75 aa
PF08263LRRNT_296-104 aa
PF00560LRR_1109-124 aa
PF12799LRR_4110-136 aa
PF13855LRR_8111-168 aa
PF23952LRR_EndoS111-142 aa
PF29460LRR_NXF2114-144 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G130930PF04999FtsL9220.1412.9
TkA06G130930PF08263LRRNT_249750.008817.0
TkA06G130930PF08263LRRNT_2961040.008817.0
TkA06G130930PF00560LRR_11091248.7e-44138.7
TkA06G130930PF12799LRR_41101361.8e-2279.6
TkA06G130930PF13855LRR_81111685.9e-38129.2
TkA06G130930PF23952LRR_EndoS1111428.77.3
TkA06G130930PF29460LRR_NXF21141440.411.2
TkA06G130930PF00560LRR_11331558.7e-44138.7
TkA06G130930PF12799LRR_41331711.8e-2279.6
TkA06G130930PF13855LRR_81411925.9e-38129.2
TkA06G130930PF23598LRR_141502842.2e-36126.1
TkA06G130930PF25013LRR_Zer-11522145.9e-0523.9
TkA06G130930PF29252LRR_NLRC41531685.76.8
TkA06G130930PF00560LRR_11571778.7e-44138.7
TkA06G130930PF00560LRR_11822038.7e-44138.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZG8拟南芥sp|Q8VZG8|MIK2_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 249.900%Swiss-Prot低置信
Q9LP24拟南芥sp|Q9LP24|Y1571_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g3571045.800%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393035.800%Swiss-Prot低置信
Q9FIZ3拟南芥sp|Q9FIZ3|GSO2_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO241.800%Swiss-Prot低置信
Q9SHI2拟南芥sp|Q9SHI2|Y1723_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723038.300%Swiss-Prot低置信

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