TkA06G127760 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G127760

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 33384214-33385958 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1289 bp · TkA06G127760|TK1151|cDNA

AAACAGATGACTTGCCAACACCAACTCTACCTTCCCTCGTCTACTTAATACCCCTATCTCCCTTCTCCCATTTTCACTCCATTCGTATCGCCTTTTCCACTCCTGTCTCCAAAAATGGTGAACTTAGTAGCCATACAGCAGCCACTGATTATCAGATTGATGAAAATGGCCGGAGTCCAAACTCACGCCGTCGAAATCGAGCCCGGAACCATCATGAACTTCTGGGTACCAAATGAAACCATTCAAAAACCCAACAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

903 bp · TkA06G127760|TK1151|CDS

ATGGTGAACTTAGTAGCCATACAGCAGCCACTGATTATCAGATTGATGAAAATGGCCGGAGTCCAAACTCACGCCGTCGAAATCGAGCCCGGAACCATCATGAACTTCTGGGTACCAAATGAAACCATTCAAAAACCCAACAAAAAATCCAAAACCACCGTCGTCACCACAATCGCTCCCAAACCGGAGAAGCCGGTGGTCGTGTTAGTTCATGGTTTCGCTGCGGAGGGCATAGCGACGTGGCAGTTCCAAATTGGCGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

300 aa · TkA06G127760|TK1151|PROTEIN

MVNLVAIQQPLIIRLMKMAGVQTHAVEIEPGTIMNFWVPNETIQKPNKKSKTTVVTTIAPKPEKPVVVLVHGFAAEGIATWQFQIGALSKQYSVYVPDLLFFGGSISDNPDRSPTFQAKCLVRGLRKLGVERCVVVGFSYGGMVAFKMAELYPDMIRAMVVSGSILAMTDSISELTLKSLGFSSSAELLLPDSVRGLKALLSVATHRKLWFPDRLHKDYLEVMFNNRKERGELLEGLVVSNKDVTIPYFPQRIHLLWGEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G127760`
TK1151 ID	TkA06G127760
OH-1004 ID	LXL04_024586
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.000 / OH-1004 74.436 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA06G127760`
位置	Chr06:33384214-33385958 (-)
描述	Similar to ephx3: Epoxide hydrolase 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_024586` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程 GO:0097176 epoxide metabolic process 生物过程 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0043231 intracellular membrane-bounded organelle 细胞组分 GO:0004301 epoxide hydrolase activity 分子功能 GO:0016787 hydrolase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	cel:CELE_K02F3.6 hsa:253152 hsa:79852 mmu:384214 xtr:779884 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.292

排名 1 · TkA06G127760 · TK1151

质体0.168

排名 2 · TkA06G127760 · TK1151

溶酶体／液泡0.136

排名 3 · TkA06G127760 · TK1151

细胞质0.125

排名 4 · TkA06G127760 · TK1151

细胞膜0.120

排名 5 · TkA06G127760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02230Abhydrolase_260-84 aa

PF00756Esterase62-100 aa

PF12146Hydrolase_463-296 aa

PF00561Abhydrolase_165-297 aa

PF12697Abhydrolase_667-297 aa

PF01738DLH125-160 aa

PF02230Abhydrolase_2129-173 aa

PF12695Abhydrolase_5129-200 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G127760	`PF02230`	Abhydrolase_2	60	84	0.0002	22.0
TkA06G127760	`PF00756`	Esterase	62	100	0.014	15.9
TkA06G127760	`PF12146`	Hydrolase_4	63	296	7.1e-08	32.8
TkA06G127760	`PF00561`	Abhydrolase_1	65	297	2e-24	87.3
TkA06G127760	`PF12697`	Abhydrolase_6	67	297	5.2e-16	60.6
TkA06G127760	`PF01738`	DLH	125	160	0.0034	17.7
TkA06G127760	`PF02230`	Abhydrolase_2	129	173	0.0002	22.0
TkA06G127760	`PF12695`	Abhydrolase_5	129	200	0.0061	17.1
TkA06G127760	`PF07819`	PGAP1	130	166	0.015	15.8
TkA06G127760	`PF05577`	Peptidase_S28	131	171	0.0031	17.1
TkA06G127760	`PF00756`	Esterase	131	207	0.014	15.9
TkA06G127760	`PF00326`	Peptidase_S9	131	174	0.026	14.7
TkA06G127760	`PF08840`	BAAT_C	133	170	0.093	13.5
TkA06G127760	`PF00975`	Thioesterase	135	152	0.13	13.2
TkA06G127760	`PF02230`	Abhydrolase_2	253	274	0.0002	22.0
TkA06G127760	`PF01738`	DLH	253	281	0.0034	17.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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