TkA06G123260 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G123260

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 32107504-32109152 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

620 bp · TkA06G123260|TK1151|cDNA

GGAAGTTTTCTTAGGAGACGTTTTTGGTTCTTAGAATTTGAGGAGATTTAGAAAATGGGTGAAGAAGGACAAGTGATCAGTTGCCACACTATTAATGCCTGGAATCAACAAATTCAAAAGGACAAGAATAGACTGATAGTTGTGGACTTTGCTGCATCATGGTGTGGACCTTGCCGGGCCATTGCTCCATTTGTAGCAGAATTGGCAAAAAAGATGCCACATGTTACCTTCGTTAAAGTTGATATCGATGAAATGAAGGA...

CDS

下载 CDS FASTA

354 bp · TkA06G123260|TK1151|CDS

ATGGGTGAAGAAGGACAAGTGATCAGTTGCCACACTATTAATGCCTGGAATCAACAAATTCAAAAGGACAAGAATAGACTGATAGTTGTGGACTTTGCTGCATCATGGTGTGGACCTTGCCGGGCCATTGCTCCATTTGTAGCAGAATTGGCAAAAAAGATGCCACATGTTACCTTCGTTAAAGTTGATATCGATGAAATGAAGGAAATTGCATCAGATTGGGGTGTGGAAGCAATGCCAACATTTTTGTTCCTAAAAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

117 aa · TkA06G123260|TK1151|PROTEIN

MGEEGQVISCHTINAWNQQIQKDKNRLIVVDFAASWCGPCRAIAPFVAELAKKMPHVTFVKVDIDEMKEIASDWGVEAMPTFLFLKDGKSVAQVVGAKKDELQQTIIKHSGNSSTSA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G123260`
TK1151 ID	TkA06G123260
OH-1004 ID	LXL04_024629
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.100
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G123260

位置 Chr06:32107504-32109152 (+)

描述 Similar to Thioredoxin H-type 2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g51030`	硫醇-二硫氧化还原酶，参与多种胞质酶的氧化还原调控。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024629 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0043085 positive regulation of catalytic activity 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0008047 enzyme activator activity 分子功能

GO:0015035 protein-disulfide reductase activity 分子功能

GO:0016671 oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G51030

nta:107762104

rcu:8266412

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.654

排名 1 · TkA06G123260 · TK1151

细胞核0.338

排名 2 · TkA06G123260 · TK1151

线粒体0.126

排名 3 · TkA06G123260 · TK1151

细胞膜0.106

排名 4 · TkA06G123260 · TK1151

内质网0.101

排名 5 · TkA06G123260 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02780Transketolase_C6-62 aa

PF00085Thioredoxin10-107 aa

PF02966DIM112-90 aa

PF02114Phosducin14-96 aa

PF20207PedC-like14-102 aa

PF13728TraF17-95 aa

PF14595Thioredoxin_918-94 aa

PF14581SseB_C18-69 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G123260	`PF02780`	Transketolase_C	6	62	0.098	13.3
TkA06G123260	`PF00085`	Thioredoxin	10	107	6.8e-31	107.1
TkA06G123260	`PF02966`	DIM1	12	90	0.0056	17.2
TkA06G123260	`PF02114`	Phosducin	14	96	0.02	14.6
TkA06G123260	`PF20207`	PedC-like	14	102	0.031	15.0
TkA06G123260	`PF13728`	TraF	17	95	0.0034	18.0
TkA06G123260	`PF14595`	Thioredoxin_9	18	94	1.1e-06	29.3
TkA06G123260	`PF14581`	SseB_C	18	69	0.047	14.7
TkA06G123260	`PF13098`	Thioredoxin_2	20	101	1.2e-09	39.3
TkA06G123260	`PF26967`	A6-like_Thioredoxin-like_C	20	99	0.002	18.8
TkA06G123260	`PF08534`	Redoxin	21	104	2.7e-05	24.7
TkA06G123260	`PF26981`	Thioredoxin-like_PDI	21	69	0.18	12.4
TkA06G123260	`PF13899`	Thioredoxin_7	23	84	0.0051	17.6
TkA06G123260	`PF00578`	AhpC-TSA	24	101	0.0051	17.5
TkA06G123260	`PF13905`	Thioredoxin_8	25	68	1.1e-06	29.7
TkA06G123260	`PF10589`	NADH_4Fe-4S	35	72	0.14	12.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P29448`	拟南芥	sp\|P29448\|TRXH1_ARATH Thioredoxin H1	67.000%	Swiss-Prot	高置信

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