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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G112700
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 29548197-29550197 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1625 bp · TkA06G112700|TK1151|cDNA

GGAAAGGGAAATTCGATTGACATTGATGTGGGAAAGTATCAAACTATTTCCCATTTAAACGTCGTCAAAGTTGTTGCAAATTTGCAACCGGCGACGTGGTTGTCTTCCTTTCTACCGGCGGCCAGATTTCCCGCCTTAAAAAATTGAGGTCAAATCCCTGAAAATTAACGCGCCAGCCGTTTTAACTTTACTCAGAAAAGCCGAATTCTAGAATAAATGGAACCCTGTTTACCTAAACTTCTAAACCTTCTCTATAAAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1143 bp · TkA06G112700|TK1151|CDS

ATGGAACCCTGTTTACCTAAACTTCTAAACCTTCTCTATAAAGCCCGCAATTTAATTGGAGTTGCAACCATCGGTTCTTCCTCCGCCGCTGCCACCACCGCTATTACATCCTCTCCCAAGTTCTCTACTACCGCCGCCGCTATGGATGATCTCCAAACCCTGAAAACCCGACTATGCATCATTGGTAGTGGTCCGGCTGCGCATACCGCCGCCATCTATGCCGCTCGTGCAGAGATCAAACCTCTTCTATTCGAAGGATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

380 aa · TkA06G112700|TK1151|PROTEIN

MEPCLPKLLNLLYKARNLIGVATIGSSSAAATTAITSSPKFSTTAAAMDDLQTLKTRLCIIGSGPAAHTAAIYAARAEIKPLLFEGWMANDIAAGGQLTTTTDVENFPGFPEGILGFELMERCKSQSVRFGTEIFSETVTKVDFSSAPCKVFTDSKSVIADTVIVATGAVARRLTFPGSGEGKLGFWNKGISACAVCDGAAPIFRGKPLAVIGGGDSAMEEANYLTKYGSKVYIIHRRDEFRASKIMQQRAMNNPKIEVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G112700
TK1151 IDTkA06G112700
OH-1004 IDLXL04_024738
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G112700
位置Chr06:29548197-29550197 (+)
描述Similar to NTR2: Thioredoxin reductase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g35460 NADPH 依赖性硫氧还蛋白二硫化物还原酶，可还原硫氧还蛋白 O1、O2 和 F3。
Identification and characterization of a mitochondrial thioredoxin system in plants.2001 · DOI: 10.1073/pnas.241340898
At2g17420 对硫氧还蛋白 O1、O2 和 F3 具有硫氧还蛋白二硫化物还原酶活性。
Identification and characterization of a mitochondrial thioredoxin system in plants.2001 · DOI: 10.1073/pnas.241340898

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0713400 具有硫氧还蛋白-二硫键还原酶活性。 暂无已核实直接文献
Os06g0327300 具有硫氧还蛋白-二硫键还原酶活性。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024738 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0019430 removal of superoxide radicals 生物过程
GO:0045454 cell redox homeostasis 生物过程
GO:0051781 positive regulation of cell division 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0004791 thioredoxin-disulfide reductase (NADPH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17420
ath:AT4G35460
cgr:2889334
dosa:Os02g0713400
dosa:Os06g0327300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.810
排名 1 · TkA06G112700 · TK1151
细胞质0.155
排名 2 · TkA06G112700 · TK1151
质体0.093
排名 3 · TkA06G112700 · TK1151
细胞核0.076
排名 4 · TkA06G112700 · TK1151
过氧化物酶体0.033
排名 5 · TkA06G112700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01946Thi446-96 aa
PF01488Shikimate_DH54-76 aa
PF13241NAD_binding_755-69 aa
PF01494FAD_binding_356-77 aa
PF07992Pyr_redox_257-358 aa
PF00070Pyr_redox57-80 aa
PF03486HI0933_like58-86 aa
PF01266DAO58-86 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G112700PF01946Thi446960.004217.1
TkA06G112700PF01488Shikimate_DH54760.2312.2
TkA06G112700PF13241NAD_binding_755690.008917.3
TkA06G112700PF01494FAD_binding_356770.09612.6
TkA06G112700PF07992Pyr_redox_2573582.9e-47162.2
TkA06G112700PF00070Pyr_redox57801.6e-1661.3
TkA06G112700PF03486HI0933_like58860.0005720.2
TkA06G112700PF01266DAO58860.1312.5
TkA06G112700PF01134GIDA59890.0004220.2
TkA06G112700PF12831FAD_oxidored591000.006616.5
TkA06G112700PF13738Pyr_redox_360821.3e-1661.5
TkA06G112700PF13450NAD_binding_860850.002318.9
TkA06G112700PF03486HI0933_like1191710.0005720.2
TkA06G112700PF01266DAO1291740.1312.5
TkA06G112700PF01134GIDA1331740.0004220.2
TkA06G112700PF13738Pyr_redox_31363411.3e-1661.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39243拟南芥sp|Q39243|TRXB1_ARATH Thioredoxin reductase 1, mitochondrial76.600%Swiss-Prot高置信
Q39242拟南芥sp|Q39242|TRXB2_ARATH Thioredoxin reductase 282.800%Swiss-Prot高置信
Q6ZFU6水稻sp|Q6ZFU6|NTRB_ORYSJ Thioredoxin reductase NTRB78.900%Swiss-Prot高置信
Q69PS6水稻sp|Q69PS6|NTRA_ORYSJ Thioredoxin reductase NTRA78.300%Swiss-Prot高置信

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