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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G094820
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 25212441-25218100 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

914 bp · TkA06G094820|TK1151|cDNA

TTTCACTACCTGAAGCAACCTCTATAATCTATTGTCATCTGTGTCGGTAGTACCTTCAAAATGGTAGTCATGGCTGCTGATGCTAAACCCACCTTCTCTCTCCTCTTACTCGCCAGGATCTCAGCTTCACTCGTCGCCATTCTTCTTCTCACTTGGGCTCTCTACTTCACCACCAGCTTCCTTCCTCACACACTCTCTCAGCGAGACCTCATTTACTCTGTTCTGCATCCTTTATTAATGGTGATTGGATTCATTCTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

789 bp · TkA06G094820|TK1151|CDS

ATGTCAGATGGCTTCAGTTGCGGGTATGAGAGCTCGATGCCTCGAATTTACGACTTATTTAATGAGATTGGTTTGACCTTTGAAAACAATCGGAGCTACGAGAAAAGGATCTCAGCTTCACTCGTCGCCATTCTTCTTCTCACTTGGGCTCTCTACTTCACCACCAGCTTCCTTCCTCACACACTCTCTCAGCGAGACCTCATTTACTCTGTTCTGCATCCTTTATTAATGGTGATTGGATTCATTCTCATAAGCGGAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

262 aa · TkA06G094820|TK1151|PROTEIN

MSDGFSCGYESSMPRIYDLFNEIGLTFENNRSYEKRISASLVAILLLTWALYFTTSFLPHTLSQRDLIYSVLHPLLMVIGFILISGEAILVHRWLPGSRKRKKRVHLWLQGVALASAIFGIWTKFQGREGVVANFYSLHSWMGLLCVSLFGAQWLMGFVNFWHRGEVRMTRIQVLPWHVFLGLYTYGLAVVTAETGLLEKLTFLQTNGLVLKHCTESMIVNGLGLGLATLCGVVILTAVSPKPYQTTLATKAVYSDTKCL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G094820
TK1151 IDTkA06G094820
OH-1004 IDLXL04_024940
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)91.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G094820
位置Chr06:25212441-25218100 (-)
描述Similar to CYB561D: Probable transmembrane ascorbate ferrireductase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g26100 含两种血红素的细胞色素。 暂无已核实直接文献
At5g38630 含两个血红素的细胞色素。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0533500 含两种血红素的细胞色素。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024940 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0019852 L-ascorbic acid metabolic process 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0000293 ferric-chelate reductase activity 分子功能
GO:0009055 electron transfer activity 分子功能
GO:0016491 oxidoreductase activity 分子功能
GO:0019904 protein domain specific binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G26100
ath:AT4G25570
ath:AT5G38630
zma:100273009
zma:100384594
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.286
排名 1 · TkA06G094820 · TK1151
内质网0.258
排名 2 · TkA06G094820 · TK1151
溶酶体／液泡0.217
排名 3 · TkA06G094820 · TK1151
细胞质0.202
排名 4 · TkA06G094820 · TK1151
高尔基体0.197
排名 5 · TkA06G094820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20990DUF2207_C27-86 aa
PF29362TMEM3131-84 aa
PF03188Cytochrom_B56140-61 aa
PF07444Ycf66_N43-84 aa
PF03188Cytochrom_B56172-203 aa
PF11297DUF309875-88 aa
PF09990DUF223198-154 aa
PF09990DUF223199-196 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G094820PF20990DUF2207_C27860.3311.3
TkA06G094820PF29362TMEM3131840.008417.6
TkA06G094820PF03188Cytochrom_B56140611.1e-41143.0
TkA06G094820PF07444Ycf66_N43841.110.1
TkA06G094820PF03188Cytochrom_B561722031.1e-41143.0
TkA06G094820PF11297DUF309875880.1512.4
TkA06G094820PF09990DUF2231981542.98.7
TkA06G094820PF09990DUF2231991962.98.7
TkA06G094820PF20990DUF2207_C1011560.3311.3
TkA06G094820PF07444Ycf66_N1381461.110.1
TkA06G094820PF11297DUF30981691910.1512.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9C540拟南芥sp|Q9C540|ACFR4_ARATH Probable transmembrane ascorbate ferrireductase 465.700%Swiss-Prot高置信
Q9SWS1拟南芥sp|Q9SWS1|ACFR2_ARATH Transmembrane ascorbate ferrireductase 244.200%Swiss-Prot中等置信
Q7XMK3水稻sp|Q7XMK3|ACET2_ORYSJ Probable ascorbate-specific transmembrane electron transporter 240.100%Swiss-Prot中等置信

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