TkA06G094320 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA06G094320

当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 25075458-25078253 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1963 bp · TkA06G094320|TK1151|cDNA

GAAAACTGGGGAAGAGAGGTGCGTTTACGCAATTGGGATGACTGTATTTTCTGCTGGTGTATCGGGAGACTAAAATGCTCAAACTTGGGGGAAAGAGAGTGTGAGTGATAGGGTCAGAATGCAATAATGACAAAACTTCTGACGATGGACTATTATTTTGGGTGTAATTGGAAAAGGCTACCGTACTACTACTGATTCGCTATCTTCTCATACCAGTAAAAAAGATCATTTCTTTTAACTTCCAAAGATTTTCCATTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1422 bp · TkA06G094320|TK1151|CDS

ATGCAAAGCTTTAGAACTACACCACCGCCTGCTGCCGCTGCCCATCCTCTTTCGTCTTCGGACTTGTATTGCCATTCTCCATATTACATTAGAGCAGATGAAAATGGAAGAACGGATACGCGTTTTACGGATCTTGGTGAGCTTCAACACTCAGCTGCTTTTCATAACGAGGATGCTGTTGATTTAAGCAGAAGTTCGATATATAATGAAATAAAAGCAGGAAATGGAGTTGTTCTCGCTAATAGCTTACAGTTTCCGCC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

473 aa · TkA06G094320|TK1151|PROTEIN

MQSFRTTPPPAAAAHPLSSSDLYCHSPYYIRADENGRTDTRFTDLGELQHSAAFHNEDAVDLSRSSIYNEIKAGNGVVLANSLQFPPHHMNFGSTTEMSSIGTGVDTGQYMMQHHKTMVASGGRSGGGGGGGGGGGMGKGHFENWGESGIADNSQQTDTSTDIDTDDKNQYNSLQHGGQVAVDSMEGSMGKIGDQKILRRLAQNREAARKSRLRKKAYVQQLESSRLKLTQLEQELKRARQQGMFASGGDQTHLVGGSGA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA06G094320`
TK1151 ID	TkA06G094320
OH-1004 ID	LXL04_024950
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	96.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA06G094320

位置 Chr06:25075458-25078253 (-)

描述 Similar to Transcription factor HBP-1b(c1) (Fragment)

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g68640`	参与花器官数量决定的转录激活因子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os01g0808100`	参与防御反应的转录调控因子。	暂无已核实直接文献
`Os03g0318600`	参与防御反应的转录调控因子。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024950 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能

GO:0043565 sequence-specific DNA binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

dosa:Os03g0318600

nta:107782457

osa:4332660

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.893

排名 1 · TkA06G094320 · TK1151

细胞质0.163

排名 2 · TkA06G094320 · TK1151

细胞膜0.038

排名 3 · TkA06G094320 · TK1151

内质网0.025

排名 4 · TkA06G094320 · TK1151

线粒体0.016

排名 5 · TkA06G094320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00170bZIP_1196-237 aa

PF07716bZIP_2196-237 aa

PF01481Arteri_nucleo196-279 aa

PF03131bZIP_Maf196-242 aa

PF28673bZIP_CREBRF_C200-238 aa

PF14144DOG1278-351 aa

PF01481Arteri_nucleo430-447 aa

PF03131bZIP_Maf431-439 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA06G094320	`PF00170`	bZIP_1	196	237	9.6e-07	29.5
TkA06G094320	`PF07716`	bZIP_2	196	237	2.7e-05	24.8
TkA06G094320	`PF01481`	Arteri_nucleo	196	279	0.036	15.1
TkA06G094320	`PF03131`	bZIP_Maf	196	242	0.045	15.0
TkA06G094320	`PF28673`	bZIP_CREBRF_C	200	238	0.11	13.6
TkA06G094320	`PF14144`	DOG1	278	351	3.8e-32	111.0
TkA06G094320	`PF01481`	Arteri_nucleo	430	447	0.036	15.1
TkA06G094320	`PF03131`	bZIP_Maf	431	439	0.045	15.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SX27`	拟南芥	sp\|Q9SX27\|PAN_ARATH Transcription factor PERIANTHIA	55.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q6IVC2`	水稻	sp\|Q6IVC2\|TGAL1_ORYSJ Transcription factor TGAL1	59.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q6IVC3`	水稻	sp\|Q6IVC3\|TGA22_ORYSJ Transcription factor TGA2.2	70.000%	Swiss-Prot	中等置信

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