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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G074720
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 19988496-19990766 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1714 bp · TkA06G074720|TK1151|cDNA

ATGACAGTGGCCAAGTAGAAAAAGCCTCCTTTGGCCTCCCTGTTTTTTCTCCCCTATCCTTGATGTTCTTATAAACCCCCATCAAGCTCTACTCCCCACACAAGATTCTCTCTCTTTCTCTTTGTATCTAAAACACACATATTTGCATGGTTTTCAAAACCCAAATCAAATTGTGATTCATGGGCGTCATCTCTCACTTCTACCACATGACTGTAATTTTAAGCACTTGCTTTTTTAGGCATAAGCCCCATCTCCCAATC...

858 bp · TkA06G074720|TK1151|CDS

ATGGAAATGGAAGGTGGAATGGTGTTTGAAGCTTTGCTCAAAAATCAAAGCCTTTCTTTTCACTCCCCTTGGATTCCAAACTCCTTTCATGAAGAAAAAACGAACACAAAGAAGCAACCGGAAAACGAGGATAATTCCGATGATGACTACGAGAAATGTTTCCGACAACCGGAGAAGAAACGACGGCTATCGATGGATCAAGTTCAGTTTCTTGAAAGAAGTTTCGAGGAAGAGAATAAGCTTGAGCCAGAAAGAAAAAT...

285 aa · TkA06G074720|TK1151|PROTEIN

MEMEGGMVFEALLKNQSLSFHSPWIPNSFHEEKTNTKKQPENEDNSDDDYEKCFRQPEKKRRLSMDQVQFLERSFEEENKLEPERKIQLAKELNLQPRQVAIWFQNRRARCKTKQLEKDYEILNSSYDKLKSEFDCLQKHNDTLKHEVEMLKEKLQQREKEEKDSIPSEISTKESDSNAEEQNRNPFSVETWSQEPKMVICKQEYANSVSTKSDIIDSYSDGNHSSFLEPCDSSNVFENQSDFSQDEEDNLTILRCPKIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G074720
TK1151 IDTkA06G074720
OH-1004 IDLXL04_025214
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G074720
位置Chr06:19988496-19990766 (+)
描述Similar to HAT5: Homeobox-leucine zipper protein HAT5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01470 可能参与叶发育的转录激活子。
At2g22430 转录激活子,可能作为对水分不足的生长调节因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0729700 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X980 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YWC0 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_025214 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G22430
ath:AT3G01470
dosa:Os02g0729700
dosa:Os09g0470500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.978
排名 1 · TkA06G074720 · TK1151
细胞质0.092
排名 2 · TkA06G074720 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA06G074720 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA06G074720 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA06G074720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06156YabA12-54 aa
PF06082YjbH49-184 aa
PF12709Fungal_TACC50-79 aa
PF10205KLRAQ58-69 aa
PF00046Homeodomain59-112 aa
PF30907IPGA1_CC60-87 aa
PF01496V_ATPase_I61-183 aa
PF06156YabA71-85 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G074720PF06156YabA12540.01117.0
TkA06G074720PF06082YjbH491840.2111.1
TkA06G074720PF12709Fungal_TACC50790.007417.5
TkA06G074720PF10205KLRAQ58690.0415.0
TkA06G074720PF00046Homeodomain591127.7e-1761.6
TkA06G074720PF30907IPGA1_CC60870.03915.0
TkA06G074720PF01496V_ATPase_I611838.74.8
TkA06G074720PF06156YabA71850.01117.0
TkA06G074720PF00170bZIP_173812.78.9
TkA06G074720PF21037CCDC138_cc74960.0215.6
TkA06G074720PF24655DUF7645771150.01815.7
TkA06G074720PF05920Homeobox_KN831105.6e-0523.6
TkA06G074720PF10205KLRAQ1121820.0415.0
TkA06G074720PF28907ZapB_rel1121318.37.8
TkA06G074720PF06156YabA1131660.01117.0
TkA06G074720PF02183HALZ1141563.6e-1659.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q02283拟南芥sp|Q02283|HAT5_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT575.700%Swiss-Prot低置信
P46668拟南芥sp|P46668|ATHB6_ARATH Homeobox-leucine zipper protein ATHB-675.000%Swiss-Prot低置信
Q6YWR4水稻sp|Q6YWR4|HOX16_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX1673.900%Swiss-Prot低置信
A2X980水稻sp|A2X980|HOX16_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1673.900%Swiss-Prot低置信
A2YWC0水稻sp|A2YWC0|HOX20_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX2077.300%Swiss-Prot低置信

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