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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA06G064620
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 17419564-17420484 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

394 bp · TkA06G064620|TK1151|cDNA

ATGTTCATAGTTACACTATTTATTTTCTTTGGTCTATATTTCATTTTTTATAATTTGCACCACTTCGAAGATGGCAATCTCTATACACATGACAGTGATGAATGTTTAAAAATTATATACAAAATATTCTTGTTTGTTATAAACTTTAACTGCAGGAACCTATTCAAGTATGCAGGATTGGATATTGATAAGCTACAAAACTTGGAATGCTGTCTGTTTGTTCTTTTTCCATACTTCTCGTACATGTTAGCAGAAGGACT...

315 bp · TkA06G064620|TK1151|CDS

ATGTTCATAGTTACACTATTTATTTTCTTTGGTCTATATTTCATTTTTTATAATTTGCACCACTTCGAAGATGGCAATCTCTATACACATGACAGTGATGAATGTTTAAAAATTATATACAAAATATTCTTGTTTGTTATAAACTTTAACTGCAGGAACCTATTCAAGTATGCAGGATTGGATATTGATAAGCTACAAAACTTGGAATGCTGTCTGTTTGTTCTTTTTCCATACTTCTCGTACATGTTAGCAGAAGGACT...

104 aa · TkA06G064620|TK1151|PROTEIN

MFIVTLFIFFGLYFIFYNLHHFEDGNLYTHDSDECLKIIYKIFLFVINFNCRNLFKYAGLDIDKLQNLECCLFVLFPYFSYMLAEGLGLSGIVSILFTGMLVNI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G064620
TK1151 IDTkA06G064620
OH-1004 IDLXL04_009900
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)83.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 65.385 / OH-1004 12.431
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G064620
位置Chr06:17419564-17420484 (+)
描述Similar to NHX6: Sodium/hydrogen exchanger 6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_009900 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0001675 acrosome assembly 生物过程
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0006814 sodium ion transport 生物过程
GO:0035725 sodium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0051453 regulation of intracellular pH 生物过程
GO:0071805 potassium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0098719 sodium ion import across plasma membrane 生物过程
GO:1902600 proton transmembrane transport 生物过程
GO:1905526 regulation of Golgi lumen acidification 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0001669 acrosomal vesicle 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G54370
ath:AT1G79610
gga:419356
hsa:23315
mmu:77031
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

内质网0.535
排名 1 · TkA06G064620 · TK1151
溶酶体/液泡0.238
排名 2 · TkA06G064620 · TK1151
高尔基体0.125
排名 3 · TkA06G064620 · TK1151
细胞质0.103
排名 4 · TkA06G064620 · TK1151
细胞膜0.070
排名 5 · TkA06G064620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00999Na_H_Exchanger43-103 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G064620PF00999Na_H_Exchanger431031.2e-0525.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWU6拟南芥sp|Q8RWU6|NHX6_ARATH Sodium/hydrogen exchanger 677.200%Swiss-Prot中等置信
Q8S396拟南芥sp|Q8S396|NHX5_ARATH Sodium/hydrogen exchanger 575.400%Swiss-Prot中等置信

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