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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G056350
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 15202447-15203364 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

888 bp · TkA06G056350|TK1151|cDNA

ATGAACGATTTATTCTCCAATTCCTTTAAGCAATATCTAGATGAGGTTGGTGGTGGTGGTGGGGTCCAAAATGAAACAGTTGATCTCCACAAGTTCTTCCACGACGTCGAGAATGTAAAACAAGACATGACGGTTGTCGACAAGCTATACAATAAGCTACAAGAATCACACAAAGAAAGCAAGATGATCCAAAACGCCACCAAGATGAAACACTTCATATCCAAAATGGATTCAGACTTTACGCAAGTGTTACAGCATGC...

CDS

下载 CDS FASTA

888 bp · TkA06G056350|TK1151|CDS

ATGAACGATTTATTCTCCAATTCCTTTAAGCAATATCTAGATGAGGTTGGTGGTGGTGGTGGGGTCCAAAATGAAACAGTTGATCTCCACAAGTTCTTCCACGACGTCGAGAATGTAAAACAAGACATGACGGTTGTCGACAAGCTATACAATAAGCTACAAGAATCACACAAAGAAAGCAAGATGATCCAAAACGCCACCAAGATGAAACACTTCATATCCAAAATGGATTCAGACTTTACGCAAGTGTTACAGCATGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

295 aa · TkA06G056350|TK1151|PROTEIN

MNDLFSNSFKQYLDEVGGGGGVQNETVDLHKFFHDVENVKQDMTVVDKLYNKLQESHKESKMIQNATKMKHFISKMDSDFTQVLQHAKNIKSKLEALEKSNLEHRKIPGCGPGSSADRTRTSVVSGLGKKLKIMMDDFQALRVQINDEYKETMGRRYFTITGEKPDDELIDSLIASGNAEDFVQRAIQNQGRGQIMDTVSEIQERHDAIMEIERNLIELHQIFLDMAVLVEAQGQQLNDIESHVAQASSFVRRGAQQLVE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G056350
TK1151 IDTkA06G056350
OH-1004 IDLXL04_025495
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 95.593 / OH-1004 32.569
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G056350
位置Chr06:15202447-15203364 (-)
描述Similar to SYP124: Syntaxin-124
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11250 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g61290 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g03330 囊泡运输蛋白，在分泌途径中发挥作用（可能）。
Syntaxin of plant proteins SYP123 and SYP132 mediate root hair tip growth in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1093/pcp/pcu048
At3g11820 参与分泌途径的小泡转运蛋白（根据相似性推测）。
Arabidopsis SNAREs SYP61 and SYP121 coordinate the trafficking of plasma membrane aquaporin PIP2;7 to modulate the cell membrane water permeability.2014 · DOI: 10.1105/tpc.114.127159
At3g52400 在分泌途径中起作用的囊泡运输蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025495 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006612 protein targeting to membrane 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006887 exocytosis 生物过程
GO:0006906 vesicle fusion 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程
GO:0010148 transpiration 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0031348 negative regulation of defense response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G11250
ath:AT1G61290
ath:AT3G11820
ath:AT3G52400
ath:AT4G03330
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.325
排名 1 · TkA06G056350 · TK1151
细胞质0.300
排名 2 · TkA06G056350 · TK1151
溶酶体／液泡0.255
排名 3 · TkA06G056350 · TK1151
高尔基体0.179
排名 4 · TkA06G056350 · TK1151
内质网0.125
排名 5 · TkA06G056350 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27002FAM193A_N4-70 aa
PF08393DHC_N222-100 aa
PF25034Spectrin_SYNE124-96 aa
PF07889DUF166426-99 aa
PF00804Syntaxin28-187 aa
PF02646RmuC29-71 aa
PF10303DUF240830-97 aa
PF04108ATG17_like32-258 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G056350PF27002FAM193A_N4700.01315.9
TkA06G056350PF08393DHC_N2221000.001518.2
TkA06G056350PF25034Spectrin_SYNE124960.1712.2
TkA06G056350PF07889DUF166426990.6810.7
TkA06G056350PF00804Syntaxin281874.4e-46157.3
TkA06G056350PF02646RmuC29712.28.0
TkA06G056350PF10303DUF240830971.210.4
TkA06G056350PF04108ATG17_like322580.003817.5
TkA06G056350PF05531NPV_P1034631.99.7
TkA06G056350PF07303Occludin_ELL34987.58.1
TkA06G056350PF05739SNARE35553.7e-2588.3
TkA06G056350PF25672BBH37371600.00119.8
TkA06G056350PF27575Map3k7cl381010.07614.1
TkA06G056350PF13990YjcZ381003.67.6
TkA06G056350PF07851TMEM120A-B411011.48.8
TkA06G056350PF06780Erp_C46950.1213.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SXB0拟南芥sp|Q9SXB0|SY125_ARATH Syntaxin-12566.000%Swiss-Prot高置信
O64791拟南芥sp|O64791|SY124_ARATH Syntaxin-12463.400%Swiss-Prot高置信
Q9ZQZ8拟南芥sp|Q9ZQZ8|SY123_ARATH Syntaxin-12358.300%Swiss-Prot高置信
Q9ZSD4拟南芥sp|Q9ZSD4|SY121_ARATH Syntaxin-12154.600%Swiss-Prot高置信
Q9SVC2拟南芥sp|Q9SVC2|SY122_ARATH Syntaxin-12249.000%Swiss-Prot中等置信

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