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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G054660
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 14791939-14794092 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1887 bp · TkA06G054660|TK1151|cDNA

ATCTCGCCGCCGGAAACCATCCGGGAACACCAGCACAAACCCTAGTTTTTCATGTATATCAACCCTTAAGTTTTCTCTTGCTTAATCACGCACGCATTAATCGATATCTCTTGCTCCACCTGTCCTCGACATCCAAGCAATTAACGATCTCACTCAGCTCTTTAATTTTTGTTTTTAATTGTTCTTTGATTGTTTTATCACTGATCTCTTTTCGTAGCTTCTTCACCTAATCTCTCTGTATTGCAGGATATTTGGATTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1368 bp · TkA06G054660|TK1151|CDS

ATGGATGCAGGATCTGTAAGTTCTTCGGCTACCAAGTCACACTCACGATGCCCCCTTAAGGAGCAATTCCTGCAAAGAAAAAACTCCCGAGAAAACTTCGATAGATTCATACCAAACAGATCAGCCATGGATTTCGATTACGCTCATTACATGCTTACGGAAGCCAAAAAAGGTAACGAAAATCTAACAGCGAGCTCACCGTCAAAGGAAGCATACAGGAAGCATTTAGCAGATAGCTTCAACATGAACCGCACAAGGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

455 aa · TkA06G054660|TK1151|PROTEIN

MDAGSVSSSATKSHSRCPLKEQFLQRKNSRENFDRFIPNRSAMDFDYAHYMLTEAKKGNENLTASSPSKEAYRKHLADSFNMNRTRILAFKNKPPTPTDAIPNECSTSFQQSKPVKARRNIPQTSERTLDAPEILDDYYLNLLDWGSRNVLAIALSNTVYLWDATDGNTSELVTVDDESGPVTSVKWAPDGRHISIGLNNSDIQLWDSTSNRLLRTLKGGHQSRVGSLDWNNHILTTGGMDGRIVNNDVRIRSHIIETYT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G054660
TK1151 IDTkA06G054660
OH-1004 IDLXL04_025521
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G054660
位置Chr06:14791939-14794092 (-)
描述Similar to CDC20-1: Cell division cycle 20.1, cofactor of APC complex
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33270 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At4g33260 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At5g27570 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At5g26900 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At5g27080 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025521 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:1905786 positive regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005680 anaphase-promoting complex 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0033597 mitotic checkpoint complex 细胞组分
GO:0080008 Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex 细胞组分
GO:0010997 anaphase-promoting complex binding 分子功能
GO:0019900 kinase binding 分子功能
GO:1990757 ubiquitin ligase activator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33260
ath:AT4G33270
ath:AT5G26900
ath:AT5G27080
ath:AT5G27570
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.527
排名 1 · TkA06G054660 · TK1151
细胞质0.417
排名 2 · TkA06G054660 · TK1151
细胞膜0.062
排名 3 · TkA06G054660 · TK1151
溶酶体／液泡0.050
排名 4 · TkA06G054660 · TK1151
高尔基体0.041
排名 5 · TkA06G054660 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23184WD40_CFAP43125-207 aa
PF24807WD40_CDC20-Fz129-426 aa
PF24817WD40_WDHD1_1st140-232 aa
PF29037DSE1_N141-187 aa
PF23389Beta-prop_WDR19_1st143-244 aa
PF24105Beta-prop_CAF1B_HIR1147-216 aa
PF25460Beta-prop_Aladin147-230 aa
PF12894ANAPC4_WD40148-176 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G054660PF23184WD40_CFAP431252070.3110.8
TkA06G054660PF24807WD40_CDC20-Fz1294261.9e-124415.4
TkA06G054660PF24817WD40_WDHD1_1st1402321.1e-2384.6
TkA06G054660PF29037DSE1_N1411872.4e-1350.7
TkA06G054660PF23389Beta-prop_WDR19_1st1432441.6e-1454.4
TkA06G054660PF24105Beta-prop_CAF1B_HIR11472163.2e-1350.1
TkA06G054660PF25460Beta-prop_Aladin1472301.5e-1248.1
TkA06G054660PF12894ANAPC4_WD401481761.2e-1661.4
TkA06G054660PF24796WDR551482574.4e-1659.5
TkA06G054660PF25168Beta-prop_WDR36-Utp21_2nd1482863e-1247.2
TkA06G054660PF23414Beta-prop_EML_21492323.6e-2176.4
TkA06G054660PF25172Beta-prop_WDR3_2nd1492446.6e-1865.7
TkA06G054660PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st1492307.7e-1142.6
TkA06G054660PF23381Beta-prop_IFT122_1st1502926.9e-37128.0
TkA06G054660PF25391WD40_Gbeta1502921e-1248.5
TkA06G054660PF23609Beta-prop_EIPR11503414.8e-0730.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZA4拟南芥sp|Q9SZA4|CDC21_ARATH Cell division cycle 20.1, cofactor of APC complex77.700%Swiss-Prot高置信
Q9S7I8拟南芥sp|Q9S7I8|CDC22_ARATH Cell division cycle 20.2, cofactor of APC complex79.200%Swiss-Prot高置信
Q3E906拟南芥sp|Q3E906|CD205_ARATH Cell division cycle 20.5, cofactor of APC complex69.300%Swiss-Prot高置信
Q4PSE4拟南芥sp|Q4PSE4|CDC24_ARATH Cell division cycle 20.4, cofactor of APC complex67.000%Swiss-Prot高置信
Q9S7H3拟南芥sp|Q9S7H3|CD203_ARATH Cell division cycle 20.3, cofactor of APC complex66.400%Swiss-Prot高置信

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