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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G052760
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 14284855-14286351 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1019 bp · TkA06G052760|TK1151|cDNA

TAATCTTTCATCTTTCCACATATACATCTCTCTTTCTTTAAGATCCCCAAGGACCCAACACCCAACTAAAAGACATCAAGAAAATGGGCAGATCACCATGTTGTGACAAAACCGGACTCAAGAAAGGGCCATGGACTCCAGAAGAAGACCTCAAACTCACACAATATATTCAAATCCATGGACCTGGCAATTGGCGAACCCTTCCAAAGAACTCTGGACTTGAACGATGTGGGAAAAGTTGTCGTCTTAGATGGACAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

936 bp · TkA06G052760|TK1151|CDS

ATGGGCAGATCACCATGTTGTGACAAAACCGGACTCAAGAAAGGGCCATGGACTCCAGAAGAAGACCTCAAACTCACACAATATATTCAAATCCATGGACCTGGCAATTGGCGAACCCTTCCAAAGAACTCTGGACTTGAACGATGTGGGAAAAGTTGTCGTCTTAGATGGACAAACTACTTGAGGCCTGATATCAAGAGAGGAAGATTCTCGTTTGAAGAAGAAGAGAGCATCATTCAACTACATAGTGTTCTTGGAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

312 aa · TkA06G052760|TK1151|PROTEIN

MGRSPCCDKTGLKKGPWTPEEDLKLTQYIQIHGPGNWRTLPKNSGLERCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGRFSFEEEESIIQLHSVLGNKWSAIAARLPGRTDNEIKNYWNTHIRKRLLKNGIDPVTHRPRIDLIDLSSILTSASFNLSNLLKIQTLVNPQVLRLATLLASSSSSNQENKELFLNNYINQNPNEPIANVASNPSYLGCNQLWNQEHHMQVDNGQYYSGNLVNLNDQSRQEKLMPSCLNDHYNSIPLQNYSDQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G052760
TK1151 IDTkA06G052760
OH-1004 IDLXL04_025548
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 93.134
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G052760
位置Chr06:14284855-14286351 (-)
描述Similar to MYB102: Transcription factor MYB102
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g21440 可能的转录因子，可能在渗透胁迫和伤口信号通路中发挥作用（可能性）。
Integration of wounding and osmotic stress signals determines the expression of the AtMYB102 transcription factor gene.2003 · DOI: 10.1104/pp.102.019273
The Arabidopsis thaliana Transcription Factor AtMYB102 Functions in Defense Against the Insect Herbivore Pieris rapae.2006 · DOI: 10.4161/psb.1.6.3512
At4g28110 参与盐胁迫反应的转录因子。
AtMyb41 regulates transcriptional and metabolic responses to osmotic stress in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.134874
Phosphorylation by AtMPK6 is required for the biological function of AtMYB41 in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2012.04.137
AtMYB41 activates ectopic suberin synthesis and assembly in multiple plant species and cell types.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12624
At4g05100 可能在盐胁迫响应中发挥作用的可能转录因子。
Salt-induced transcription factor MYB74 is regulated by the RNA-directed DNA methylation pathway in Arabidopsis.2015 · DOI: 10.1093/jxb/erv312
At3g01140 作为表皮细胞生长的抑制因子，并负向调控毛状体分支形成。
Transcriptional profiling of mature Arabidopsis trichomes reveals that NOECK encodes the MIXTA-like transcriptional regulator MYB106.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.126979
MIXTA-like transcription factors and WAX INDUCER1/SHINE1 coordinately regulate cuticle development in Arabidopsis and Torenia fournieri.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110783
The MIXTA-like transcription factor MYB16 is a major regulator of cuticle formation in vegetative organs.2013 · DOI: 10.4161/psb.26826
At5g15310 参与花瓣表皮细胞形态发生的控制。
Control of cell and petal morphogenesis by R2R3 MYB transcription factors.2007 · DOI: 10.1242/dev.02836
MIXTA-like transcription factors and WAX INDUCER1/SHINE1 coordinately regulate cuticle development in Arabidopsis and Torenia fournieri.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.110783
The MIXTA-like transcription factor MYB16 is a major regulator of cuticle formation in vegetative organs.2013 · DOI: 10.4161/psb.26826

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025548 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000902 cell morphogenesis 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009825 multidimensional cell growth 生物过程
GO:0010091 trichome branching 生物过程
GO:0010143 cutin biosynthetic process 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0080090 regulation of primary metabolic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G01140
ath:AT4G05100
ath:AT4G21440
ath:AT4G28110
ath:AT5G15310
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.828
排名 1 · TkA06G052760 · TK1151
细胞质0.295
排名 2 · TkA06G052760 · TK1151
线粒体0.027
排名 3 · TkA06G052760 · TK1151
细胞膜0.018
排名 4 · TkA06G052760 · TK1151
溶酶体／液泡0.013
排名 5 · TkA06G052760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding14-61 aa
PF13921Myb_DNA-bind_617-76 aa
PF23588HTH_CHD1_Hrp317-46 aa
PF00249Myb_DNA-binding67-111 aa
PF15963Myb_DNA-bind_769-116 aa
PF13921Myb_DNA-bind_671-114 aa
PF13921Myb_DNA-bind_6206-221 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G052760PF00249Myb_DNA-binding14612e-35121.3
TkA06G052760PF13921Myb_DNA-bind_617766.8e-1968.5
TkA06G052760PF23588HTH_CHD1_Hrp317460.212.4
TkA06G052760PF00249Myb_DNA-binding671112e-35121.3
TkA06G052760PF15963Myb_DNA-bind_7691160.212.2
TkA06G052760PF13921Myb_DNA-bind_6711146.8e-1968.5
TkA06G052760PF13921Myb_DNA-bind_62062216.8e-1968.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LDR8拟南芥sp|Q9LDR8|MY102_ARATH Transcription factor MYB10250.400%Swiss-Prot高置信
Q9M0J5拟南芥sp|Q9M0J5|MYB41_ARATH Transcription factor MYB4176.400%Swiss-Prot中等置信
Q9M0Y5拟南芥sp|Q9M0Y5|MYB74_ARATH Transcription factor MYB7471.700%Swiss-Prot中等置信
Q9LE63拟南芥sp|Q9LE63|MY106_ARATH Transcription factor MYB10658.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LXF1拟南芥sp|Q9LXF1|MYB16_ARATH Transcription factor MYB1676.000%Swiss-Prot低置信

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