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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA06G041400
当前版本: TK1151 染色体: Chr06 坐标: 11194368-11199022 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3644 bp · TkA06G041400|TK1151|cDNA

TTGAAATAAATAATAATGATCGGCGGCACCAGCGGCCAACGTCCAACTGTCCTCGTCAACAGAACGTTACGACGTCGTATGAGGTGTTCTGACTGAGCGGGTAAGTATAGTGTGTAACGCACACCGCGCAGCATCGTCGATCGTCCTCTATGCCAAATCAACAACACGAAACCCTTCAATTTCCATTTCTTGCGACCGGATTAACTCGAGTTTGATATTTGAAATCCAAGATATGGAAGAGTATAGTCATTCAGAGCACG...

CDS

下载 CDS FASTA

3258 bp · TkA06G041400|TK1151|CDS

ATGGAAGAGTATAGTCATTCAGAGCACGTTACTGGAAGTCCAACAGCTGGAGAGAGTGGATTTGTTCATGTAGAGTCGATTGATTCAGCTTCAATGGATGATAGCGCAATTAATCAGGATGATGGGGTAGTGGTAACCAGAGTAGATAATGTACAAGATGATGGTGGAAATGAAGAGTTTGTTGACTGCCCAGATGACTTACTTTCTTATGATGAAAAGACTGATTTTGATGCAAGCCAAGAATCAGAAGCAGTTTCAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1085 aa · TkA06G041400|TK1151|PROTEIN

MEEYSHSEHVTGSPTAGESGFVHVESIDSASMDDSAINQDDGVVVTRVDNVQDDGGNEEFVDCPDDLLSYDEKTDFDASQESEAVSEVNQHTSFENEREILPHHYQEERQQLMTELTNLRHKLKLLIKKHPLIDGNEGALFTYEHATETVAGDDMDKSLWPLHEVIFDCSRFIELALSEQSQTEHTVRELLTTLDTKDKEINALNVIVTEHHSLETTTDRILNSLGVKVEDFSHTSVSGKMSHLEKSISFLIENRNHFFS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA06G041400
TK1151 IDTkA06G041400
OH-1004 IDLXL04_020715
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)43.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 15.392 / OH-1004 59.396
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA06G041400
位置Chr06:11194368-11199022 (-)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g24460 束缚因子参与反式高尔基体网络 的囊泡融合，因此是有效地将蛋白质运输到液泡所必需的。
TNO1 is involved in salt tolerance and vacuolar trafficking in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.110.168963
TNO1, a TGN-localized SNARE-interacting protein, modulates root skewing in Arabidopsis thaliana.2017 · DOI: 10.1186/s12870-017-1024-4

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020715 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006623 protein targeting to vacuole 生物过程
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0006906 vesicle fusion 生物过程
GO:0007034 vacuolar transport 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010015 root morphogenesis 生物过程
GO:0010031 circumnutation 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0010226 response to lithium ion 生物过程
GO:0010555 response to mannitol 生物过程
GO:0022604 regulation of cell morphogenesis 生物过程
GO:0035864 response to potassium ion 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G24460
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.445
排名 1 · TkA06G041400 · TK1151
高尔基体0.321
排名 2 · TkA06G041400 · TK1151
内质网0.157
排名 3 · TkA06G041400 · TK1151
细胞核0.126
排名 4 · TkA06G041400 · TK1151
过氧化物酶体0.092
排名 5 · TkA06G041400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06818Fez190-100 aa
PF27241CLIP193-128 aa
PF19220Rod_CreS93-123 aa
PF08614ATG1698-123 aa
PF09787Golgin_A5103-123 aa
PF28019HmpF105-120 aa
PF20492ERM_helical106-126 aa
PF21928XLF_CC106-117 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA06G041400PF06818Fez1901000.6211.2
TkA06G041400PF27241CLIP1931280.0002821.7
TkA06G041400PF19220Rod_CreS931232.08.2
TkA06G041400PF08614ATG16981230.9610.3
TkA06G041400PF09787Golgin_A51031230.03514.3
TkA06G041400PF28019HmpF1051200.003516.6
TkA06G041400PF20492ERM_helical1061260.003918.0
TkA06G041400PF21928XLF_CC1061170.06813.8
TkA06G041400PF29599Rv0250c1101603.38.4
TkA06G041400PF24161CCDC391473150.58.9
TkA06G041400PF21928XLF_CC1772050.06813.8
TkA06G041400PF09787Golgin_A51782750.03514.3
TkA06G041400PF19220Rod_CreS1782222.08.2
TkA06G041400PF28019HmpF1852170.003516.6
TkA06G041400PF06818Fez11883300.6211.2
TkA06G041400PF27241CLIP11942120.0002821.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I9A2拟南芥sp|F4I9A2|TNO1_ARATH Trans-Golgi network-localized SYP41-interacting protein 148.300%Swiss-Prot低置信

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